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基于睾丸测序的鸡精子活力性状mRNA-miRNA-lncRNA转录调控研究

发布时间:2022-01-27 09:01
  精子活力是评价种公鸡繁殖潜力的重要指标,对家禽生产、制种和育种等多个环节都有着至关重要的影响。调查显示,我国地方鸡普遍存在精子活力偏低的情况,弱精症(精子活力低下)个体比例偏高。精子活力性状遗传力较高,但目前家禽精子活力的分子调控机制仍不清楚。因此,寻找鸡精子活力性状的分子标记物,利用分子育种方法剔除弱精个体,对于加快家禽品种繁殖性能选育进展,提高地方鸡产业化水平有重要的实践意义。本研究选择具有极端精子活力表型的北京油鸡公鸡作为研究对象,利用高通量测序技术分析睾丸组织中表达的mRNA、lncRNA和miRNA,筛选鉴定与鸡精子活力相关的基因和非编码RNA以及相关的信号通路,并通过构建mRNA-miRNA-lncRNA互作网络,在转录水平鉴定参与鸡精子活力调控的分子机制。主要研究内容和结果如下:通过对200只北京油鸡公鸡进行精液品质测定,建立了高、低精子活力公鸡样本组,各20只公鸡。比较发现,总体上高精子活力公鸡的繁殖指标优于低精子活力公鸡,其中种蛋受精率与精子活力的关联程度最高,睾丸组织切片观察发现,低精子活力公鸡睾丸生精上皮完整性较差。对高、低精子活力公鸡睾丸进行lncRNA测序,共... 

【文章来源】:中国农业大学北京市211工程院校985工程院校教育部直属院校

【文章页数】:112 页

【学位级别】:博士

【部分图文】:

基于睾丸测序的鸡精子活力性状mRNA-miRNA-lncRNA转录调控研究


图3-5?IncRNA和mRNA的外显子数目分布??

长度分布,长度分布,外显子


图3-4?IncRNA和mRNA的长度分布??Figure?3-4?Length?distribution?of?IncRNAs?and?mRNAs??由图3-5可以看出,大多数(78.2%)的IncRNA拥有3个或更少的外显子,而多数(76.9%)??mRNA外显子数目超过5个。与之前报道的鸡骨骼肌IncRNA相比(Li?etal.2016d),睪丸IncRNA??的长度较短,但外显子数目接近。??060?■?IncRNA?"mRNA??;I?I??I?0.30?■??:L?L?■■?■■?■!?I??2?3?4?5?6-10?>10??Exon?number??图3-5?IncRNA和mRNA的外显子数目分布??Figure?3-5?Exon?number?distribution?of?IncRNAs?and?mRNAs??表达量水平方面,通过Stringtie软件对IncRNA和mRNA进行定量分析,发现鸡華丸??IncRNA的表达水平显著低于mRNA?(图3-6)。??25??

序列,睾丸,染色体,小鼠


??图3-6?IncRNA的表达特征??Figure?3-6?Expression?feature?of?IncRNAs?and?mRNAs.??经过与己报道的人和小鼠IncRNA进行比对,仅有9条鸡IncRNA与29条人IncRNA存在序??列同源,9条与14条小鼠IncRNA序列同源。其中,5条鸡睾丸IncRNA能够同时比对上人和小??鼠IncRNA数据库。此外,本研究还发现了鸡睾丸IncRNA主要集中在1号和Z染色体上(图3-??7),分别有433?(16.7%)和404?(15.6%)条IncRNA位于这两条染色体。??500?-I??450?-??400???■??350?-??,?300-??〇?250?-?I??I?1??g?200?-?I??Z?150?-?III??llllllllllllllll????/?^?^?^?^vvvvvvv^vvv??v??■?li

【参考文献】:
期刊论文
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博士论文
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硕士论文
[1]利用iTRAQ蛋白质组学技术筛选与种公鸡繁殖力相关的候选蛋白[D]. 薛夫光.中国农业科学院 2015
[2]犏牛精子发生阻滞的比较转录组研究[D]. 曾贤彬.西南民族大学 2014
[3]不同LED光色下繁育的二代种用与肉用三黄鸡生产性能比较[D]. 王小双.浙江大学 2014



本文编号:3612181

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