4株滑液囊支原体分离株的分子鉴定及vlhA基因的序列分析

发布时间：2022-02-05 05:52

　　为了从分子水平对4株滑液囊支原体（Mycoplasma synoviae,MS）分离株进行鉴定,同时分析其膜蛋白vlhA的基因序列以及蛋白的功能结构域。通过PCR扩增其16S rRNA和vlhA基因序列,以16S rRNA序列构建分子进化树并分析4株MS分离株和其他支原体参考株的同源性;利用生物信息学工具对vlhA基因的核酸序列和蛋白序列进行分析,查找其保守结构域,预测其可能具有的功能。结果表明,4株MS分离株在16S rRNA基因序列上与MS不同菌株具有同源性,可以确定为滑液囊支原体;其vlhA基因序列分为保守区和高变区,保守区和部分高变区组成主要膜抗原基因MSPB;vlhA蛋白共含有10个保守的结构域,7个保守域位于保守区,8个保守域位于MSPB区,其中的75 Asp～425 Asn之间的氨基酸残基预测与细胞黏附有关;75 Asp～126 Val与129 Val～206 Val之间的氨基酸残基为免疫球蛋白超家族结构,与受体/配体功能相关,可能都参与MS感染宿主的过程。 

【文章来源】：中国兽医学报. 2020,40(05)北大核心CSCD

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

16S rRNA基因序列PCR 扩增结果

vlhA基因PCR扩增结果

应用 DNAStar 软件,对 vlhA 蛋白的抗原表位进行预测(图9),可看出 vlhA蛋白存在多个潜在的抗原表位位点,可能的蛋白质抗原表位区域:1～11,28～126,142～165,173～202,209～219,223～230,236～252,262～271,275～298,314～319,323～345,375～401,407～414,421～440,452～469,479～501,510～523,530～547,573～591,614～634,654～662,677～698,741～770。图4 vlhA保守区和高变区序列比对结果

【参考文献】：
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本文编号：3614684