NTM、ZNF597、NAA60和GLIS3基因在牛中的印记状态分析
发布时间：2022-02-10 18:27
基因组印迹（Genomic imprinting）是一种表观遗传（Epigenetic）现象,是指哺乳动物的一少部分基因优先表达来自父系或者母系的等位基因。印迹基因在哺乳动物的生长发育和胎盘功能中起着重要的作用,印迹基因表达紊乱常伴随疾病的发生。牛由于具有实验动物（如啮齿动物）所不具备的诸多优势,成为后基因组时代人类疾病研究的新型模式生物。目前,印记研究主要集中在人和小鼠中,而牛中被鉴定的印记基因数量较少。本研究以牛的NTM、ZNF597、NAA60、GLIS3基因为研究对象,分析了这些基因在牛中的印记状态。Neurotrimin（NTM）对神经发育中有重要影响,在人类相关研究中是印记基因,但是在牛中的印记状态尚未揭示。我们分析了牛NTM基因的序列特征和编码蛋白结构,并鉴定NTM基因在成年牛组织和胎盘中的印记状态。本研究首先应用cDNA末端快速扩增技术（rapid amplification of cDNA ends,RACE）技术,得到1个牛NTM基因新的剪接体NTMxd（GenBank No.:MH037574）,通过对其编码氨基酸序列进行分析,发现其N端具有更完整的跨膜信号。为了...
【文章来源】：河北农业大学河北省
【文章页数】：53 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
Dnmt基因家族维持基因组印记Fig.1.3Dnmtgenefamilymaintainsgenomicimprinting
从提取的成年牛肝脏组织提取的DNA基因组、胎盘组织DNA基因组、精子DNA基因组和血液DNA基因组中吸取1 μL与核酸染料混合，用1%的琼脂糖凝胶检测DNA基因组提取效果（图3.1）。胶图中可见提取DNA基因组条带单一，且测定OD260与OD280的比值介于1.8-1.9之间，说明提取DNA基因组纯度较好。再测定DNA的浓度，制备100 ng/μL的稀释液用于后续实验。图3.1 牛总DNA的提取Fig.3.1 Total DNA of bovine泳道 1-9: 成年牛 1-9 号基因组Lane 1-9：Adult cattle 1-9 total DNA.图3.2为1.5%琼脂糖凝胶电泳检测牛组织和胎盘RNA基因组提取效果图，位于1000-2000bp间的条带为28S而另一条为18S。由图中可见，提取RNA基因组条带整齐没有拖带现象。所有RNA基因组测定OD260和OD280，OD260/OD280的比值介于1.9-2.0之间，提取的RNA纯度较好
泳道 1-9: 成年牛 1-9 号基因组Lane 1-9：Adult cattle 1-9 total DNA.图3.2为1.5%琼脂糖凝胶电泳检测牛组织和胎盘RNA基因组提取效果图，位于1000-2000bp间的条带为28S而另一条为18S。由图中可见，提取RNA基因组条带整齐没有拖带现象。所有RNA基因组测定OD260和OD280，OD260/OD280的比值介于1.9-2.0之间，提取的RNA纯度较好，可以用于后续实验。再分别测定RNA的浓度，制备1000ng/μL的稀释液用于RT-PCR反应。图3.2 牛总RNA的提取Fig.3.2 Total RNA of bovine泳道 1-7：分别为大脑、心、肝、肺、肾、脾、肌肉.泳道 8-15:胎盘组织Lane 1-7：Total RNA obtained from brain, heart
【参考文献】：
期刊论文
[1]印记基因研究进展[J]. 沈秀平,林月霞,徐琪. 上海农业学报. 2012(01)
[2]基于PCR技术的DNA甲基化检测方法研究进展[J]. 李克勇,肖武生,常秀丽,吴庆. 国外医学(卫生学分册). 2008(05)
[3]A Quantitative DNA Methylation Assay Using Mismatch Hybridization and Chemiluminescence[J]. QUN-FENG YAO, XIN-JIANG KANG, QIAO-LING HAO, AND YI-KAI ZHOU Institute of Environmental Medicine, Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan, Hubei 430030, China. Biomedical and Environmental Sciences. 2005(01)
[4]哺乳动物印记基因的研究进展[J]. 张守全,冯定远,田秀春,杨向中. 中国生物工程杂志. 2003(12)
[5]印记基因的印记机制及其表达调控[J]. 杨明升,刘红林,陈杰. 生命的化学. 2002(01)
[6]蒙古羊胸椎数的亲本印记遗传研究[J]. 张立岭,菊林花,杨丽君. 内蒙古农业大学学报(自然科学版). 2000(02)
[7]DNA甲基化及其影响因素[J]. 陈瑞琳,蔺淑梅,陈天艳,张曦. 国际流行病学传染病学杂志. 2007 (04)
本文编号：3619318
【文章来源】：河北农业大学河北省
【文章页数】：53 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
Dnmt基因家族维持基因组印记Fig.1.3Dnmtgenefamilymaintainsgenomicimprinting
从提取的成年牛肝脏组织提取的DNA基因组、胎盘组织DNA基因组、精子DNA基因组和血液DNA基因组中吸取1 μL与核酸染料混合，用1%的琼脂糖凝胶检测DNA基因组提取效果（图3.1）。胶图中可见提取DNA基因组条带单一，且测定OD260与OD280的比值介于1.8-1.9之间，说明提取DNA基因组纯度较好。再测定DNA的浓度，制备100 ng/μL的稀释液用于后续实验。图3.1 牛总DNA的提取Fig.3.1 Total DNA of bovine泳道 1-9: 成年牛 1-9 号基因组Lane 1-9：Adult cattle 1-9 total DNA.图3.2为1.5%琼脂糖凝胶电泳检测牛组织和胎盘RNA基因组提取效果图，位于1000-2000bp间的条带为28S而另一条为18S。由图中可见，提取RNA基因组条带整齐没有拖带现象。所有RNA基因组测定OD260和OD280，OD260/OD280的比值介于1.9-2.0之间，提取的RNA纯度较好
泳道 1-9: 成年牛 1-9 号基因组Lane 1-9：Adult cattle 1-9 total DNA.图3.2为1.5%琼脂糖凝胶电泳检测牛组织和胎盘RNA基因组提取效果图，位于1000-2000bp间的条带为28S而另一条为18S。由图中可见，提取RNA基因组条带整齐没有拖带现象。所有RNA基因组测定OD260和OD280，OD260/OD280的比值介于1.9-2.0之间，提取的RNA纯度较好，可以用于后续实验。再分别测定RNA的浓度，制备1000ng/μL的稀释液用于RT-PCR反应。图3.2 牛总RNA的提取Fig.3.2 Total RNA of bovine泳道 1-7：分别为大脑、心、肝、肺、肾、脾、肌肉.泳道 8-15:胎盘组织Lane 1-7：Total RNA obtained from brain, heart
【参考文献】：
期刊论文
[1]印记基因研究进展[J]. 沈秀平,林月霞,徐琪. 上海农业学报. 2012(01)
[2]基于PCR技术的DNA甲基化检测方法研究进展[J]. 李克勇,肖武生,常秀丽,吴庆. 国外医学(卫生学分册). 2008(05)
[3]A Quantitative DNA Methylation Assay Using Mismatch Hybridization and Chemiluminescence[J]. QUN-FENG YAO, XIN-JIANG KANG, QIAO-LING HAO, AND YI-KAI ZHOU Institute of Environmental Medicine, Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan, Hubei 430030, China. Biomedical and Environmental Sciences. 2005(01)
[4]哺乳动物印记基因的研究进展[J]. 张守全,冯定远,田秀春,杨向中. 中国生物工程杂志. 2003(12)
[5]印记基因的印记机制及其表达调控[J]. 杨明升,刘红林,陈杰. 生命的化学. 2002(01)
[6]蒙古羊胸椎数的亲本印记遗传研究[J]. 张立岭,菊林花,杨丽君. 内蒙古农业大学学报(自然科学版). 2000(02)
[7]DNA甲基化及其影响因素[J]. 陈瑞琳,蔺淑梅,陈天艳,张曦. 国际流行病学传染病学杂志. 2007 (04)
本文编号：3619318
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