用于猪肉产品溯源的相关SNP的挖掘与引物筛选

发布时间：2022-02-14 22:04

　　我国是生产和消费猪肉量最大的国家,猪肉是我国居民消费的最主要肉类产品,对其建立有效的溯源系统,更是迫在眉睫。随着当代高通量测序技术的发展,DNA标记已经逐渐被用于肉类产品的溯源系统建立。在DNA标记中, SNP（Single Nucleotide Polymorphisms）标记,以其相对简单且检测成本较低,是一种可有效对猪肉产品进行溯源的遗传学方法。为种猪档案库建设所需,本研究选用我国最常用的商品猪种洛克、长白和大约克猪,对杜洛克、长白和大约克猪个体身份的DNA识别进行了研究。并提供了一种新的遗传标记——“多位点合并基因型DNA片段”,用于猪个体身份识别及其产品的溯源。一、为了更多地挖掘可用于猪个体识别的SNP,共筛选了8对引物,PCR扩增后将产物直接测序,得到了63个SNP。取杂合度≥0.10的SNP,这些SNP在不同品种中所组成的基因型数目不同,最终可用于实验中三个品种溯源的SNP,在杜洛克中有16个,在长白中13有个,在大约克中有17个,可组成131220（杜洛克）、2160（长白）、6480（大约克）种基因型。以这些SNP为基础的基因分型策略,足以应用到饲养杜洛克猪的猪场进行... 

【文章来源】：南京农业大学江苏省211工程院校教育部直属院校

【文章页数】：59 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
英文缩写
第一部分 文献综述
    第一章 肉产品溯源技术的研究进展
        1.1 非遗传学的肉产品溯源研究及应用
        1.2 遗传学的肉产品溯源研究进展
    第二章 SNP标记的研究进展
        2.1 SNP检测方法
        2.2 SNP标记的优势和特点
    第三章 SNP用于溯源的研究进展
        3.1 SNP标记用于人及其它物种研究
        3.2 SNP标记用于猪肉产品的溯源研究
    参考文献
第二部分 实验研究
    第四章 猪个体身份识别的SNP筛选
        1. 材料与方法
            1.1 材料
            1.2 实验方法与步骤
            1.3 数据分析
            1.4 猪个体身份识别的SNP数字条形码编制
        2 结果与分析
            2.1 SNP检测
            2.2 SNP连锁不平衡分析
            2.3 用于制作条形码的SNP筛选结果
            2.4 SNP条形码及数字条形码编制
            2.5 基因型分析
        3. 讨论
            3.1 猪个体身份识别
            3.2 SNP的混样PCR测序检测
        参考文献
    第五章 多位点合并基因型DNA片段筛选
        1. 材料与方法
            1.1 材料
            1.2 实验方法与步骤
        2. 结果与分析
            2.1 检测SNP位点
            2.2 SNP及引物筛选结果汇总
            2.3 有效引物获得效率
        3. 讨论
            3.1 SNP的“奠基者”效应
            3.2 “多位点合并基因型DNA片段”
        参考文献
全文结论
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]新一代基因测序技术及其在肿瘤研究中的应用[J]. 陈琛,万海粟,周清华.  中国肺癌杂志. 2010(02)
[2]TNFβ的基因多态性在汉族SLE病人中的分布特点及与其他不同种族人群的比较[J]. 王育新,章友康,朱世乐,刘玉春,白千帆,郑欣.  北京医科大学学报. 1998(04)
[3]叶酸代谢酶的基因多态性与神经管畸形的关系[J]. 赵如冰,朱慧萍,李竹.  北京医科大学学报. 1998(02)
[4]随机扩增多态DNA影响因素的研究[J]. 陈永久,张亚平.  动物学研究. 1997(02)
[5]云南4个少数民族的随机扩增多态DNA分析[J]. 王文,兰宏,宿兵,施立明.  科学通报. 1994(20)



本文编号：3625348