贵州地方鸡种隐性白羽与慢羽分子标记研究与应用
发布时间:2022-02-16 17:29
为了准确鉴定兴义矮脚鸡白羽系的白羽性状,本文根据TYR基因序列和PMEL17序列各分别设计了特异性引物各1对,采用PCR直接测序法鉴定兴义矮脚鸡白羽系(以下简称XB)和罗曼蛋鸡(以下简称LB)的羽色控制基因,建立了地方鸡种显性白羽和隐性白羽分子鉴定方法,开展了罗曼蛋鸡与兴义矮脚白羽系杂交后代中隐性白羽纯合子(以下简称YXB)的鉴定和挑选工作。为了鉴定贵州黄鸡慢羽系、瑶山鸡慢羽系的慢羽性状,根据控制慢羽性状的基因序列,设计特异性引物1对,采用PCR直接测序法对表型鉴别的贵州黄鸡慢羽系(以下简称GHS)和瑶山鸡慢羽系(以下简称YSS)个体进行了分子鉴定,同时设计引物鉴定了慢羽公鸡纯合子,建立了两个鸡种慢羽性状分子标记鉴定方法;统计了贵州黄鸡、瑶山鸡不同世代慢羽羽型的变化规律,探讨了不同羽型对羽毛和体重的影响。结果如下:(1)经分子鉴定,检测到兴义矮脚鸡白羽系中TYR基因196bp的插入片段,测序后比对与原序列一致,未检测到PMEL17基因的160bp插入片段,判定兴义矮脚鸡白羽系为TYR基因控制的隐性白羽鸡,基因型为iicc;检测到罗曼蛋鸡PMEL17基因160bp的插入片段,测序后比对与...
【文章来源】:贵州大学贵州省211工程院校
【文章页数】:60 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
中文摘要
Summary
第一章 文献综述
1.1 前言
1.2 白羽鸡的研究现状与应用
1.2.1 羽色性状的研究
1.2.2 隐性白羽鸡的现状
1.2.3 隐性白羽鸡在育种中的应用
1.3 快慢羽鸡的研究现状与应用
1.3.1 快慢羽性状的研究
1.3.2 快慢羽的现状
1.3.3 快慢羽鸡在育种中的应用
1.4 试验鸡品种介绍
1.4.1 贵州兴义矮脚鸡白羽系
1.4.2 贵州黄鸡
1.4.3 瑶山鸡
1.5 遗传标记概述
1.5.1 分子标记
1.5.2 分子标记在动物育种中的应用
1.6 研究的目的意义与技术路线
1.6.1 目的意义
1.6.2 技术路线
第二章 兴义矮脚鸡白羽系TYR、PMEL17 基因检测与应用
2.1 试验材料
2.1.1 样本的采集
2.1.2 试验主要的仪器设备
2.1.3 试验主要的试剂及溶液
2.1.4 主要数据分析软件及在线网站
2.2 试验方法
2.2.1 种蛋的收集与孵化
2.2.2 试验动物基因组DNA提取
2.2.3 基因组DNA检测
2.2.4 基因组DNA浓度与纯度的检测
2.3 PMEL17、TYR基因PCR反应
2.3.1 引物设计
2.3.2 引物溶解与稀释
2.3.3 PCR反应的体系
2.3.4 基因型鉴定
2.4 结果与分析
2.4.1 基因组DNA提取结果
2.4.2 PMEL17 位点基因型分析
2.4.3 PMEL17 位点PCR产物测序结果
2.4.4 TYR位点基因型分析
2.4.5 TYR位点PCR产物测序结果
2.4.6 兴义矮脚鸡白羽系个体隐性基因鉴定
2.4.7 白羽鸡在育种中的应用
2.5 讨论
2.5.1 兴义矮脚鸡白羽系在地方鸡配套生产中的应用前景
2.5.2 兴义矮脚鸡白羽系隐性基因检测
2.6 小结
第三章 贵州黄鸡、瑶山鸡快慢羽基因的检测与应用
3.1 试验材料
3.1.1 样本的采集
3.1.2 试验主要的仪器
3.1.3 试验主要的试剂及溶液
3.2 试验方法
3.2.1 种蛋的选取与孵化
3.2.2 试验动物基因组DNA提取
3.2.3 基因组DNA检测
3.2.4 基因组DNA浓度与纯度的检测
3.2.5 主要数据分析软件及在线网站
3.2.6 快慢羽表型鉴定
3.2.7 羽毛长度测定
3.2.8 体重测定
3.3 快慢羽基因PCR反应
3.3.1 引物设计
3.3.2 引物溶解与稀释
3.3.3 PCR反应的体系
3.4 结果与分析
3.4.1 基因组DNA提取结果
3.4.2 羽速类型的分子鉴定结果分析
3.4.3 慢羽公鸡分型检测结果分析
3.4.4 慢羽公鸡分型基因SNP
3.4.5 贵州黄鸡、瑶山鸡慢羽系分子鉴定
3.4.6 贵州黄鸡、瑶山鸡快慢羽系自别雌雄配套杂交效果
3.4.7 不同世代贵州黄鸡、瑶山鸡慢羽羽型变化
3.4.8 不同羽型对羽毛生长和体重的影响
3.5 讨论
3.5.1 贵州黄鸡、瑶山鸡慢羽性状分子鉴定
3.5.2 不同羽型对鸡羽毛生长的影响
3.6 小结
参考文献
论文使用的符号和缩写词(Abbreviations)
致谢
附录
【参考文献】:
期刊论文
[1]四川山地乌骨鸡黄羽系快、慢羽群体羽毛和体重的早期发育分析及基因型鉴定[J]. 钟成麟,王丽云,张小敏,朱庆,王彦,尹华东,舒刚,欧达亮,赵小玲. 中国家禽. 2018(22)
[2]DNA分子标记技术的研究与应用[J]. 陈星,高子厚. 分子植物育种. 2019(06)
[3]瑶山鸡慢羽系羽型与出壳体重相关性研究[J]. 林家栋,张福平,龚俞,李雪松,张游宇,任丽群,李洪林,祖盘玉,吴立鑫,李维. 黑龙江畜牧兽医. 2018(15)
[4]羽速基因对沐川乌骨黑鸡肤色性状和体重的影响[J]. 喻世刚,王钢,廖娟,曾昌巧. 黑龙江畜牧兽医. 2018(10)
[5]鸡快慢羽性状遗传学基础分析综合实验探索与实践[J]. 张丽,徐海冬,冷奇颖,刘艳芬,赵志辉,效梅,吴江,张权,安立龙. 遗传. 2018(03)
[6]盔顶珍珠鸡快慢羽基因分型及早期性别鉴定[J]. 王章,袁泳兰,包志江,李婷,董晶,安立龙,效梅,杜炳旺,张丽. 广东农业科学. 2017(05)
[7]鸡内源白血病病毒ev21与慢羽非连锁分析和LTR区启动子活性分析[J]. 王麒,王晗,张秀玲,刘春杨,张乐超,李兰会,李祥龙. 畜牧兽医学报. 2017(05)
[8]慢羽系麒麟公鸡纯合个体分子检测方法的建立[J]. 李珊珊,李东华,吕福琨,董晶,李艳青,杜炳旺. 河南农业科学. 2016(07)
[9]坝上长尾鸡快、慢羽系繁育及配套应用技术方案初探[J]. 吴占福,刘立文,刘海斌,张立永,董卫英. 黑龙江畜牧兽医. 2016(08)
[10]他留乌骨鸡TYR基因多态性与色素性状相关性分析[J]. 陆晓屏,滕召纯,李庆华,孙利民,王玉祥,张斌,史宪伟. 中国家禽. 2015(17)
博士论文
[1]REV感染对SPF雏鸡miRNA及其靶基因mRNA表达的影响[D]. 于志强.东北农业大学 2017
[2]轮作条件下长期施肥对棕壤微生物群落的影响[D]. 罗培宇.沈阳农业大学 2014
[3]牦牛绒毛和免疫性状相关基因研究[D]. 沙日耐.中国农业科学院 2012
[4]小麦抗条锈病遗传资源评价及抗性新基因发掘[D]. 蒲宗君.四川农业大学 2008
硕士论文
[1]我国北方羊种布鲁氏菌流行株的遗传多态性分析[D]. 王勋.甘肃农业大学 2018
[2]口虾蛄不同地理群体线粒体DNA控制区和转录组变异研究[D]. 张阳.浙江海洋大学 2018
[3]小麦RIL群体遗传图谱的构建及粒长、粒宽和千粒重的QTL定位分析[D]. 张心如.山东农业大学 2017
[4]内蒙古沙葱萤叶甲种群的遗传多样性和遗传分化[D]. 张鹏飞.内蒙古农业大学 2016
[5]鸡快慢羽候选基因的筛选[D]. 赵计昌.扬州大学 2016
[6]红腹锦鸡胚胎羽毛毛囊发育及β-catenin在胚胎皮肤中的表达[D]. 郝玉.内蒙古农业大学 2015
[7]布氏田鼠封闭群遗传学检测及社会行为学研究[D]. 张曼.北京协和医学院 2015
[8]核辐射对实验红鲫损伤的毒理学及AFLP分子标记的研究[D]. 廖小立.南华大学 2015
[9]家蚕新突变体紫色类鹑斑q-lp的定位分析[D]. 王平阳.江苏科技大学 2015
[10]条石鲷微卫星性别特异标记筛选及子代家系的遗传分析[D]. 孙鑫序.浙江海洋学院 2014
本文编号:3628364
【文章来源】:贵州大学贵州省211工程院校
【文章页数】:60 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
中文摘要
Summary
第一章 文献综述
1.1 前言
1.2 白羽鸡的研究现状与应用
1.2.1 羽色性状的研究
1.2.2 隐性白羽鸡的现状
1.2.3 隐性白羽鸡在育种中的应用
1.3 快慢羽鸡的研究现状与应用
1.3.1 快慢羽性状的研究
1.3.2 快慢羽的现状
1.3.3 快慢羽鸡在育种中的应用
1.4 试验鸡品种介绍
1.4.1 贵州兴义矮脚鸡白羽系
1.4.2 贵州黄鸡
1.4.3 瑶山鸡
1.5 遗传标记概述
1.5.1 分子标记
1.5.2 分子标记在动物育种中的应用
1.6 研究的目的意义与技术路线
1.6.1 目的意义
1.6.2 技术路线
第二章 兴义矮脚鸡白羽系TYR、PMEL17 基因检测与应用
2.1 试验材料
2.1.1 样本的采集
2.1.2 试验主要的仪器设备
2.1.3 试验主要的试剂及溶液
2.1.4 主要数据分析软件及在线网站
2.2 试验方法
2.2.1 种蛋的收集与孵化
2.2.2 试验动物基因组DNA提取
2.2.3 基因组DNA检测
2.2.4 基因组DNA浓度与纯度的检测
2.3 PMEL17、TYR基因PCR反应
2.3.1 引物设计
2.3.2 引物溶解与稀释
2.3.3 PCR反应的体系
2.3.4 基因型鉴定
2.4 结果与分析
2.4.1 基因组DNA提取结果
2.4.2 PMEL17 位点基因型分析
2.4.3 PMEL17 位点PCR产物测序结果
2.4.4 TYR位点基因型分析
2.4.5 TYR位点PCR产物测序结果
2.4.6 兴义矮脚鸡白羽系个体隐性基因鉴定
2.4.7 白羽鸡在育种中的应用
2.5 讨论
2.5.1 兴义矮脚鸡白羽系在地方鸡配套生产中的应用前景
2.5.2 兴义矮脚鸡白羽系隐性基因检测
2.6 小结
第三章 贵州黄鸡、瑶山鸡快慢羽基因的检测与应用
3.1 试验材料
3.1.1 样本的采集
3.1.2 试验主要的仪器
3.1.3 试验主要的试剂及溶液
3.2 试验方法
3.2.1 种蛋的选取与孵化
3.2.2 试验动物基因组DNA提取
3.2.3 基因组DNA检测
3.2.4 基因组DNA浓度与纯度的检测
3.2.5 主要数据分析软件及在线网站
3.2.6 快慢羽表型鉴定
3.2.7 羽毛长度测定
3.2.8 体重测定
3.3 快慢羽基因PCR反应
3.3.1 引物设计
3.3.2 引物溶解与稀释
3.3.3 PCR反应的体系
3.4 结果与分析
3.4.1 基因组DNA提取结果
3.4.2 羽速类型的分子鉴定结果分析
3.4.3 慢羽公鸡分型检测结果分析
3.4.4 慢羽公鸡分型基因SNP
3.4.5 贵州黄鸡、瑶山鸡慢羽系分子鉴定
3.4.6 贵州黄鸡、瑶山鸡快慢羽系自别雌雄配套杂交效果
3.4.7 不同世代贵州黄鸡、瑶山鸡慢羽羽型变化
3.4.8 不同羽型对羽毛生长和体重的影响
3.5 讨论
3.5.1 贵州黄鸡、瑶山鸡慢羽性状分子鉴定
3.5.2 不同羽型对鸡羽毛生长的影响
3.6 小结
参考文献
论文使用的符号和缩写词(Abbreviations)
致谢
附录
【参考文献】:
期刊论文
[1]四川山地乌骨鸡黄羽系快、慢羽群体羽毛和体重的早期发育分析及基因型鉴定[J]. 钟成麟,王丽云,张小敏,朱庆,王彦,尹华东,舒刚,欧达亮,赵小玲. 中国家禽. 2018(22)
[2]DNA分子标记技术的研究与应用[J]. 陈星,高子厚. 分子植物育种. 2019(06)
[3]瑶山鸡慢羽系羽型与出壳体重相关性研究[J]. 林家栋,张福平,龚俞,李雪松,张游宇,任丽群,李洪林,祖盘玉,吴立鑫,李维. 黑龙江畜牧兽医. 2018(15)
[4]羽速基因对沐川乌骨黑鸡肤色性状和体重的影响[J]. 喻世刚,王钢,廖娟,曾昌巧. 黑龙江畜牧兽医. 2018(10)
[5]鸡快慢羽性状遗传学基础分析综合实验探索与实践[J]. 张丽,徐海冬,冷奇颖,刘艳芬,赵志辉,效梅,吴江,张权,安立龙. 遗传. 2018(03)
[6]盔顶珍珠鸡快慢羽基因分型及早期性别鉴定[J]. 王章,袁泳兰,包志江,李婷,董晶,安立龙,效梅,杜炳旺,张丽. 广东农业科学. 2017(05)
[7]鸡内源白血病病毒ev21与慢羽非连锁分析和LTR区启动子活性分析[J]. 王麒,王晗,张秀玲,刘春杨,张乐超,李兰会,李祥龙. 畜牧兽医学报. 2017(05)
[8]慢羽系麒麟公鸡纯合个体分子检测方法的建立[J]. 李珊珊,李东华,吕福琨,董晶,李艳青,杜炳旺. 河南农业科学. 2016(07)
[9]坝上长尾鸡快、慢羽系繁育及配套应用技术方案初探[J]. 吴占福,刘立文,刘海斌,张立永,董卫英. 黑龙江畜牧兽医. 2016(08)
[10]他留乌骨鸡TYR基因多态性与色素性状相关性分析[J]. 陆晓屏,滕召纯,李庆华,孙利民,王玉祥,张斌,史宪伟. 中国家禽. 2015(17)
博士论文
[1]REV感染对SPF雏鸡miRNA及其靶基因mRNA表达的影响[D]. 于志强.东北农业大学 2017
[2]轮作条件下长期施肥对棕壤微生物群落的影响[D]. 罗培宇.沈阳农业大学 2014
[3]牦牛绒毛和免疫性状相关基因研究[D]. 沙日耐.中国农业科学院 2012
[4]小麦抗条锈病遗传资源评价及抗性新基因发掘[D]. 蒲宗君.四川农业大学 2008
硕士论文
[1]我国北方羊种布鲁氏菌流行株的遗传多态性分析[D]. 王勋.甘肃农业大学 2018
[2]口虾蛄不同地理群体线粒体DNA控制区和转录组变异研究[D]. 张阳.浙江海洋大学 2018
[3]小麦RIL群体遗传图谱的构建及粒长、粒宽和千粒重的QTL定位分析[D]. 张心如.山东农业大学 2017
[4]内蒙古沙葱萤叶甲种群的遗传多样性和遗传分化[D]. 张鹏飞.内蒙古农业大学 2016
[5]鸡快慢羽候选基因的筛选[D]. 赵计昌.扬州大学 2016
[6]红腹锦鸡胚胎羽毛毛囊发育及β-catenin在胚胎皮肤中的表达[D]. 郝玉.内蒙古农业大学 2015
[7]布氏田鼠封闭群遗传学检测及社会行为学研究[D]. 张曼.北京协和医学院 2015
[8]核辐射对实验红鲫损伤的毒理学及AFLP分子标记的研究[D]. 廖小立.南华大学 2015
[9]家蚕新突变体紫色类鹑斑q-lp的定位分析[D]. 王平阳.江苏科技大学 2015
[10]条石鲷微卫星性别特异标记筛选及子代家系的遗传分析[D]. 孙鑫序.浙江海洋学院 2014
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