西藏牦牛、绵羊棘球蚴病病原的分子鉴定
发布时间:2022-05-03 05:00
本研究旨在对西藏自治区那曲地区和拉萨市牦牛、绵羊体内棘球蚴病原进行分子生物学鉴定并分析其遗传变异规律。对2016年11月底采自西藏拉萨市当雄县和那曲地区嘉黎县的5只绵羊体内的5个棘球蚴包囊、15头牦牛体内的18个棘球蚴包囊分别分离棘球蚴原头蚴或生发层组织,提取基因组DNA,应用PCR方法扩增nad1基因,通过测序获得nad1全基因序列。运用DNAStar MegAlign软件对序列进行同源性分析。以GenBank中已公布的棘球属的nad1全基因序列为比对对象,采用最大似然法(ML)构建系统发育树。结果显示,所测定的牦牛和绵羊的23个棘球蚴病原nad1基因序列与GenBank登录的细粒棘球蚴狭义种(G1基因型)nad1基因序列高度同源,同源性为99.6%~99.8%,23条nad1基因的遗传距离为0~0.0022447。同源基因的碱基变异率为0.2%~0.4%;与棘球属其他棘球绦虫同源基因的碱基变异率为14.9%~19.8%。有5个样本的nad1基因在不同位点发生碱基突变,变异位点发生序列转换。以上结果表明,本研究所采集牦牛和绵羊的棘球蚴为细粒棘球绦虫G1基因型,其nad1基因变异小,序...
【文章页数】:7 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 细粒棘球蚴的采集和处理
1.1.2 主要试剂
1.2 方法
1.2.1 引物设计与合成
1.2.2 棘球蚴总DNA提取
1.2.3 nad1基因PCR扩增、产物纯化与测序
1.2.4 序列分析
2 结 果
2.1 PCR扩增结果
2.2 nad1基因序列特征与同源性比对分析
2.3 系统发育分析
3 讨 论
4 结 论
【参考文献】:
期刊论文
[1]青藏高原细粒棘球绦虫的分子鉴定与遗传变异分析[J]. 胡丹丹,王凝,钟秀琴,王家海,延宁,阳爱国,蒋忠荣,郭莉,邓世金,达瓦次仁,孔维淑,刘天宇,周旋,谢跃,古小彬,杨光友. 畜牧兽医学报. 2013(09)
本文编号:3650677
【文章页数】:7 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 细粒棘球蚴的采集和处理
1.1.2 主要试剂
1.2 方法
1.2.1 引物设计与合成
1.2.2 棘球蚴总DNA提取
1.2.3 nad1基因PCR扩增、产物纯化与测序
1.2.4 序列分析
2 结 果
2.1 PCR扩增结果
2.2 nad1基因序列特征与同源性比对分析
2.3 系统发育分析
3 讨 论
4 结 论
【参考文献】:
期刊论文
[1]青藏高原细粒棘球绦虫的分子鉴定与遗传变异分析[J]. 胡丹丹,王凝,钟秀琴,王家海,延宁,阳爱国,蒋忠荣,郭莉,邓世金,达瓦次仁,孔维淑,刘天宇,周旋,谢跃,古小彬,杨光友. 畜牧兽医学报. 2013(09)
本文编号:3650677
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