基于线粒体DNA黑龙江野猪进化分析

发布时间：2022-07-08 11:58

　　野猪是我国重要野生资源,野猪系统进化研究对于阐述家猪起源和进化历史具有重要意义。为研究黑龙江野猪系统进化,在黑龙江地区提取23个野猪样本,对其线粒体细胞色素b基因和D-loop高变区150～591 bp开展测序和进化分析。结果表明,黑龙江野猪Cyt b基因序列遗传多样性相对较低,不同地区野猪亲缘关系符合地理分布;线粒体D-loop区目标序列包括27个SNP位点、21个单倍型,形成两个类群,类群Ⅰ为古老类群,黑龙江野猪有3个单倍型,包括内蒙古野猪和吉林野猪所有单倍型,黑龙江地区可能为野猪分化中心之一,研究为东北亚地区野猪起源与进化提供理论依据。 

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验材料
        1.1.1 供试动物
        1.1.2 供试药剂
    1.2 方法
        1.2.1 DNA提取
        1.2.2 引物设计与合成
        1.2.3 PCR反应体系
        1.2.4 克隆测序
        1.2.5 遗传多样性分析
        1.2.6 序列比对和系统进化分析
2 结果与分析
    2.1 黑龙江野猪Cyt b基因系统进化分析
        2.1.1 PCR扩增及克隆测序
        2.1.2 黑龙江野猪Cyt b基因系统进化分析
    2.2 黑龙江野猪线粒体D-loop区系统进化分析
        2.2.1 PCR扩增与测定
    2.2东北亚地区野猪线粒体D-loop区系统进化分析
    2.3 野猪线粒体D-loop区单倍型鉴定
    2.4 东北地区野猪单倍型组成鉴定与进化分析
3 讨论
    3.1 线粒体DNA
    3.2 野猪Cyt b基因系统进化
    3.3 野猪线粒体D-loop区系统进化
    3.4 黑龙江野猪单倍型进化分析
4 结论


【参考文献】：
期刊论文
[1]淮南猪线粒体DNA D-loop遗传多样性及母系起源研究[J]. 徐秋良,段广莹,张潇,朱宽佑,李婉涛,黄炎坤.  中国畜牧杂志. 2020(01)
[2]猪的全基因组测序研究进展[J]. 肖瑜,马海明.  中国畜牧杂志. 2019(05)
[3]民猪全基因组序列测定与分析[J]. 张冬杰,何鑫淼,王文涛,汪亮,刘娣.  东北农业大学学报. 2018(11)
[4]基于线粒体DNAD-loop区全序列分析藏鸡遗传多样性及其起源进化关系的研究[J]. 贾晓旭,唐修君,陆俊贤,顾荣,葛庆联,高玉时,苏一军.  东北农业大学学报. 2015(02)
[5]黑龙江省野猪线粒体D-Loop区的生物信息学分析[J]. 杨国伟.  黑龙江农业科学. 2010(02)
[6]野猪的遗传学研究与开发利用进展[J]. 李忠秋,马建章.  东北农业大学学报. 2010(01)
[7]TYR基因外显子1的序列变异与家猪的起源研究[J]. 韩洪金,吴桂生,史宪伟,张亚平.  遗传. 2005(05)
[8]东北亚地区野猪种群mtDNA遗传结构及系统地理发生[J]. 李崇奇,常青,陈建琴,张保卫,朱立峰,周开亚.  动物学报. 2005(04)

硕士论文
[1]线粒体从头组装揭示欧亚猪遗传多样性及分子进化[D]. 倪攀.华中农业大学 2018
[2]东亚及秦岭野猪种群遗传结构和历史动态[D]. 张怡.南京师范大学 2018



本文编号：3656986