黔北麻羊CTSB、CTSD基因的克

发布时间：2022-07-29 14:26

　　以单、多羔黔北麻羊为试验对象,采用PCR法扩增克隆获得黔北麻羊CTSB、CTSD基因CDS区序列,生物信息学方法分析黔北麻羊CTSB、CTSD的理化性质、蛋白质高级结构、亚细胞定位情况和信号肽位点,并进行氨基酸同源性分析构建系统进化树;应用qRT-PCR法对目的基因在单、多羔黔北麻羊下丘脑、垂体、子宫、输卵管和卵巢5个性腺组织中的表达量进行差异分析。结果表明:黔北麻羊CTSB、CTSD基因编码序列全长为1 008和1 239 bp,共编码335和412个氨基酸。其蛋白相对分子质量分别为36 780和44 590,理论等电点为5.65和7.03,不稳定系数为65.16和37.82。CTSB、CTSD蛋白二级结构均主要由无规则卷曲构成;三级结构预测结果与二级结构一致,且CTSB蛋白属于亲水性蛋白,信号肽剪切位点位于第17～18号氨基酸,亚细胞定位发现CTSB蛋白有66.7%的可能定位于细胞外;而CTSD属于疏水性蛋白,信号肽剪切位点位于第22～23号氨基酸,亚细胞定位表明其有44.4%的可能定位于细胞外（包括细胞壁）。与其他动物相比,黔北麻羊CTSB、CTSD编码氨基酸序列与绵羊的亲缘性最... 

【文章页数】：11 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 试验试剂
    1.3 引物的设计与合成
    1.4 组织总RNA的提取与cDNA第1链的合成
    1.5 实时荧光定量PCR
    1.6 PCR扩增黔北麻羊CTSB、CTSD基因CDS区
    1.7 目的基因CTSB、CTSD的克隆
    1.8 黔北麻羊CTSB、CTSD基因生物信息学分析
2 结果
    2.1 PCR扩增黔北麻羊CTSB、CTSD基因
    2.2 CTSB、CTSD基因在单、多羔黔北麻羊不同组织中的表达
    2.3 CTSB、CTSD基因T克隆载体的鉴定与测序鉴定
    2.4 黔北麻羊CTSB、CTSD基因CDS区生物信息学分析
        2.4.1 黔北麻羊CTSB、CTSD蛋白质理化性质分析
        2.4.2 黔北麻羊CTSB、CTSD蛋白质高级结构分析与预测
        2.4.3 黔北麻羊CTSB、CTSD蛋白质亚细胞定位分析与信号肽预测
        2.4.4 CTSB、CTSD氨基酸同源性分析
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]黔北麻羊KISS1基因多态性及组织差异表达研究[J]. 陈祥,李鹏程,孙振梅,许厚强,陈伟.  农业生物技术学报. 2018(07)
[2]黔北麻羊BMPR-ⅠB第9外显子C40G位点多态性及组织差异表达[J]. 孙振梅,李鹏程,许厚强,冯文武,苑洪霞,王鑫,陈祥.  农业生物技术学报. 2016(12)
[3]卵泡刺激激素受体基因（FSHR）在贵州地方山羊的多态性及表达研究[J]. 龙威海,丁玫,冯文武,许厚强,陈祥.  农业生物技术学报. 2015(06)
[4]企鹅珍珠贝组织蛋白酶D的cDNA克隆、序列特征分析和应激表达研究[J]. 潘俐玲,黄桂菊,成书营,王晓宁,喻达辉.  南方水产科学. 2012(02)
[5]猪Cathepsin B基因cDNA分子克隆、序列分析及遗传多态性分析[J]. 陈磊,李学伟,朱砺,李强,李明洲.  畜牧兽医学报. 2008(04)
[6]猪CTSD全长cDNA的克隆和表达分析[J]. 梅盈洁,李加琪,陈瑶生,李晓筠,朱良瑞,凌飞,王翀,张豪.  畜牧兽医学报. 2007(05)
[7]组织蛋白酶及其抑制剂研究进展[J]. 曾广智,谭宁华,贾锐锐,潘蓄林.  云南植物研究. 2005(04)

博士论文
[1]牛溶酶体组织蛋白酶家族及其抑制基因的克隆、表达及遗传效应分析[D]. 邓桂馨.中国农业科学院 2011

硕士论文
[1]旋毛虫组织蛋白酶B的克隆表达及在幼虫侵入小鼠肠上皮细胞中的作用[D]. 韩月.郑州大学 2019
[2]猪带绦虫组织蛋白酶B基因的克隆、表达及功能研究[D]. 孙铭苑.中国农业科学院 2015
[3]罗非鱼组织蛋白酶D和基质金属蛋白酶2基因的克隆鉴定及其功能分析[D]. 刘铁柱.山东农业大学 2015
[4]天府肉羊CTSD和CSTB基因克隆及其组织表达测定[D]. 王念璐.四川农业大学 2014
[5]绵羊CTSB基因克隆及其活性与卵母细胞发育能力相关性研究[D]. 祁昕.河北农业大学 2013



本文编号：3666629