鸡CALB1基因的SNPs检测及其与蛋品质的关联分析

发布时间：2022-10-08 14:56

　　蛋壳品质是蛋禽的重要经济性状。钙结合蛋白是机体内调节钙离子转运的重要蛋白,CALB1,即Calbindin-D28k,是Ca BP的一种位于胞浆中可溶性蛋白质,可与Ca2+相结合,直接调节Ca2+转运,介导调节参与Ca2+的多种生理功能。本试验以济宁百日鸡为试验材料,搜集了43周龄母鸡所产鸡蛋560枚,测定了蛋重、蛋形指数、蛋壳厚度、蛋壳强度、蛋壳重、蛋黄重、蛋白重、蛋白高度、蛋黄颜色、哈氏单位、蛋壳比率、蛋黄比率、蛋白比率等蛋品质指标,检测了CALB1基因5’调控区SNPs,并将其与蛋品质性状进行关联分析。主要研究结果如下:（1）济宁百日鸡平均蛋重为44.04±0.15g、蛋壳厚度为0.31±0.03mm、蛋壳强度为38.13±0.29N/cm2、蛋形指数为1.31±0.00,哈氏单位为61.17±0.30。蛋壳比率、蛋黄比率和蛋白比率分别为9.90%、37.60%和52.52%。蛋形指数的变异系数最小,为4.06%;蛋壳强度和蛋白高度的变异系数最大,均超过了15%。变异系数在5%~10%的性状有蛋重、蛋壳比率、蛋白比率和蛋黄比率。其余性状的变异系数在10%~15%之间。蛋重与蛋壳重... 

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中文摘要
Abstract
1 引言
    1.1 济宁百日鸡及蛋品质
    1.2 蛋壳品质的研究进展
        1.2.1 蛋壳性状的评定指标
        1.2.2 影响蛋壳品质的因素
        1.2.3 蛋壳的成分
    1.3 钙结合蛋白的研究进展
        1.3.1 钙结合蛋白的结构
        1.3.2 钙结合Calbindin-D28k的分子生物学特性
        1.3.3 钙结合Calbindin-D28k的作用
    1.4 CALB1基因的研究进展
        1.4.1 CALB1基因的结构
        1.4.2 CALB1基因在雌性生殖系统中的表达
    1.5 单核苷酸多态性与蛋壳性状分子遗传标记
    1.6 本研究的目的与意义
2 材料与方法
    2.1 试验材料
        2.1.1 试验动物
        2.1.2 数据库及软件
        2.1.3 主要仪器设备
        2.1.4 主要试剂
    2.2 试验方法
        2.2.1 蛋品质指标测量
        2.2.2 鸡血液DNA的提取
        2.2.3 试验引物设计
        2.2.4 混池测序筛选CALB1基因的SNPs位点
        2.2.5 5'调控区各SNPs位点突变前后转录因子变化预测
        2.2.6 CALB1基因 5'调控区甲基化预测
        2.2.7 济宁百日鸡CALB1基因 5'调控区大群检测和基因分型
    2.3 数据统计与分析
        2.3.1 济宁百日鸡蛋品质
        2.3.2 群体基因频率、基因型频率及遗传多样性
        2.3.3 SNPs与蛋品质性状关联分析
        2.3.4 单倍型效应分析
3 结果与分析
    3.1 济宁百日鸡蛋品质分析
    3.2 济宁百日鸡蛋品质性状相关性分析
    3.3 济宁百日鸡CALB1基因SNPs位点检测及群体遗传学分析
        3.3.1 目的片段PCR扩增结果
        3.3.2 混池测序结果
        3.3.3 部分SNPs位点突变前后转录因子比较
        3.3.4 CALB1基因 5'调控区的甲基化预测结果
        3.3.5 济宁百日鸡CALB1基因 5'调控区SNPs直接测序结果
        3.3.6 济宁百日鸡CALB1基因 5'调控区SNPs位点群体遗传学分析
    3.4 济宁百日鸡CALB1基因SNPs与蛋品质关联分析
        3.4.1 济宁百日鸡CALB1基因 5'调控区SNPs位点与蛋品质关联分析
        3.4.2 济宁百日鸡CALB1基因 5'调控区SNPs位点连锁不平衡分析
        3.4.3 济宁百日鸡CALB1基因 5'调控区单倍型与联合基因型效应分析
4 讨论
    4.1 济宁百日鸡蛋品质特点
    4.2 鸡CALB15'调控区的多态性
    4.3 济宁百日鸡CALB15'调控区SNPs对蛋壳品质的影响
5 结论
参考文献
致谢


【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
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硕士论文
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[3]寿光鸡AANAT基因5’调控区的多态性及其与产蛋性状的关联分析[D]. 郝园丽.山东农业大学 2015
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本文编号：3687916