巴马香猪FABP4基因的克隆及其组织表达分析

发布时间：2022-10-09 19:40

　　为了获得巴马香猪脂肪酸结合蛋白4（FABP4）基因的编码区序列（CDS）,并探究FABP4基因在巴马香猪不同器官/组织中的mRNA表达水平,试验以巴马香猪背最长肌为材料,提取总RNA并扩增出FABP4基因的CDS,运用在线分析系统进行生物信息学分析,并利用实时荧光定量PCR技术检测巴马香猪心脏、脾脏、肝脏、肾脏、肺脏、背最长肌和胰腺等器官/组织中FABP4基因的mRNA表达水平。结果表明:成功克隆得到巴马香猪FABP4基因的CDS,长度为488bp,与GenBank中公布的猪FABP4基因同源性为99.6%,并且存在2个突变位点,第421位点处G→A为同义突变,第462位点处A→G导致赖氨酸突变为精氨酸;巴马香猪FABP4基因CDS与猪、人、黑猩猩、猕猴、牛和家鼠的同源性分别为99.6%、89.3%、89.3%、88.7%、87.3%和82.8%,且与普通猪的遗传距离最近,聚类为一支;巴马香猪FABP4蛋白氨基酸组成中苏氨酸和缬氨酸含量较高,均占氨基酸总数的10.6%;FABP4蛋白为亲水蛋白,包含一个Lipocalin超家族结构域;巴马香猪FABP4蛋白的二、三级结构包含α-螺旋、延... 

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验动物
    1.2 主要试剂
2 方法
    2.1 引物的设计与合成
    2.2 FABP4基因的PCR扩增及克隆
    2.3 生物信息学分析
    2.4 不同器官/组织中FABP4基因表达的检测
3 结果与分析
    3.1 巴马香猪FABP4基因的克隆
    3.2 巴马香猪FABP4基因序列分析
    3.3 巴马香猪FABP4基因CDS同源性比较及系统进化树构建
    3.4 巴马香猪FABP4基因氨基酸组成分析
    3.5 巴马香猪FABP4蛋白亲疏水性分析
    3.6 巴马香猪FABP4蛋白保守结构域预测
    3.7 巴马香猪FABP4蛋白的二级结构预测
    3.8 巴马香猪FABP4蛋白的三级结构预测
    3.9 不同器官/组织中FABP4基因表达的检测
4 讨论与结论


【参考文献】：
期刊论文
[1]猪A-FABP基因真核表达载体的构建及其组织表达[J]. 李晓玲,于光辉,崔小荣,张廷荣,孙金海.  中国畜牧杂志. 2018(01)
[2]猪A-FABP基因的克隆及其组织差异性表达[J]. 李晓玲,崔小荣,窦成利,于光辉,张廷荣,孙金海.  黑龙江畜牧兽医. 2017(15)
[3]绒山羊不同肌肉组织及肌内脂肪细胞的基因表达分析[J]. 杜琛,李金泉,陈秀娟.  中国畜牧兽医. 2016(02)
[4]FABP4基因在阿勒泰羊尾脂沉积与代谢模型中的表达变化规律[J]. 许瑞霞,高磊,赵伟利,张伟,宋广超,甘尚权,石国庆.  遗传. 2015(02)
[5]绵羊脂肪细胞型脂肪酸结合蛋白基因（FABP4）cDNA的克隆、表达及其结构模拟分析[J]. 徐秋良,张庆莉,陈玉林.  农业生物技术学报. 2011(03)
[6]九龙牦牛脂肪细胞型脂肪酸结合蛋白基因（A-FABP）的克隆及其表达谱[J]. 邝良德,林亚秋,徐亚欧,李玉萍,蒋忠荣,郑玉才.  农业生物技术学报. 2010(06)

博士论文
[1]大熊猫FABP4、FABP5及RPS9基因克隆与表达研究[D]. 宋波.四川农业大学 2015

硕士论文
[1]阿勒泰大尾羊FABP4、ADIPOQ和CFD基因分子克隆及其组织差异性表达的研究[D]. 许瑞霞.石河子大学 2015
[2]北京鸭A-FABP基因组织表达特征及表达效应[D]. 荣光辉.扬州大学 2014
[3]脂肪因子Lipocalin-2与2型糖尿病及肥胖的相关性研究[D]. 陈旖婷.苏州大学 2011
[4]牛A-FABP多克隆抗血清制备及组织表达分析[D]. 季舒涵.西北农林科技大学 2010



本文编号：3689238