一株绿鹭源H9N2亚型禽流感病毒全基因组序列分析

发布时间：2022-10-11 11:54

　　为了解野生水禽绿鹭（Butorides striata）中分离到的1株H9N2亚型禽流感病毒（A/striated heron/Yunnan/2018）的生物学特性;对其进行全基因组序列扩增、测序、进化分析;序列分析显示:该分离株HA、NA基因位于Y280-like分支、PB2、M基因位于G1-like分支、PA、PB1、NP、NS基因位于F98-like分支,分别与H9、H7、H10等多种亚型的AIV同源性较高,该分离株不同基因片段来源较复杂。HA裂解位点氨基酸序列为333PSRSSR↓GL340,符合低致病性禽流感病毒（LPAIV）氨基酸序列特征; S145N突变增加了一个糖基化位点,提示该位点出现可能会使毒株致病性提高,免疫原性发生改变; HA受体结合位点发生Q234L突变,表现出人流感病毒受体结合特性; NA基因出现第63—65位氨基酸缺失,M1发生N30D,T215A突变,M2发生S31N的突变,PB2、PB1、NS、NP、PA关键位点未发生变化,分析结果提示当前分离株已出现耐药性、致病性增强的变化。本研究表明该分离株呈现遗传演化的多样性及基因重组的复杂性,因此加强对野生水禽... 

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 样品来源
    1.2 主要试剂
    1.3 病毒分离扩增
    1.4 病毒RNA提取和RT-PCR鉴定
    1.5 全基因组序列扩增
    1.6 生物信息学分析
2 结果
    2.1 病毒PCR鉴定结果
    2.2 病毒全基因组PCR扩增结果
    2.3 基因组遗传进化分析
    2.4 基因组序列关键位点分析
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]1株鹅源H9N2亚型禽流感病毒分子进化分析及对鹅的致病性[J]. 张溢珊,陈济铛,陈建红,刘敏芳,曹梦蕊,张济培.  中国兽医学报. 2018(06)
[2]影响禽流感病毒致病性和传播的关键氨基酸位点的研究进展[J]. 徐晓龙,包红梅,陈化兰,王秀荣.  中国预防兽医学报. 2014(02)
[3]H9N2 AIV HA蛋白S145N变异毒株的抗原性和免疫原性[J]. 王新卫,赵军,陈陆,姚惠霞,王川庆,王泽霖.  中国兽医学报. 2012(02)
[4]人H5N1亚型禽流感病毒安徽株NS1基因的克隆及在原核系统的表达[J]. 程从升,蓝雨,柳燕,张智清,舒跃龙,姚立红,温乐英,王大燕,王伟,李希妍,王琦,赵新生,黄晶晶,聂凯,张晓光.  微生物学报. 2007(03)

博士论文
[1]中国南方H9N2禽流感病毒的分子进化分析及其对小鼠致病性研究[D]. 朱光剑.华东师范大学 2012



本文编号：3690526