肉鸡肺动脉组织中MEOX2基因克隆与生物信息学分析

发布时间：2022-10-19 14:08

　　克隆构建肉鸡间充质同源盒蛋白2（mesenchyme homeobox,MEOX2）重组质粒pUCm-T-MEOX2,并对其进行生物信息学分析。通过提取肉鸡肺动脉组织基因组RNA,并反转录为cDNA,利用PCR方法扩增MEOX2基因片段,并将目的片段通过TA克隆到pUCm-T载体上获得重组质粒,测序后对其进行生物信息学分析。结果显示,成功获得pUCm-T-MEOX2重组质粒,目的基因片段为819 bp,可编码273个氨基酸,其序列同源性与原鸡无差异;其存在45个磷酸化位点和1个N-糖基化修饰位点;经预测MEOX2蛋白亚细胞定位于细胞核,无信号肽;MEOX2蛋白为亲水性蛋白且无跨膜结构;二级结构预测为α-螺旋、延伸链、β-转角和无规卷曲,分别占22.79%,9.93%,3.68%,63.60%;三级结构主要由无规卷曲和α-螺旋组成;其有11个B细胞抗原表位。本试验结果可为MEOX2基因抗体制备奠定良好的基础,进而为肉鸡腹水综合征的肺动脉血管重构病理检测及基因药物治疗提供有力的依据。 

【文章页数】：9 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验样品及主要试剂
    1.2 引物设计与合成
    1.3 MEOX2 基因的PCR扩增
    1.4 MEOX2基因的TA克隆
    1.5 MEOX2基因的生物信息学分析
2 结果
    2.1 MEOX2基因的PCR扩增、克隆与鉴定
    2.2 MEOX2基因的生物信息学分析
        2.2.1 MEOX2基因同源性分析
        2.2.2 MEOX2蛋白的理化性质
        2.2.3 MEOX2蛋白磷酸化位点和糖基化位点分析
        2.2.4 MEOX2 蛋白亚细胞定位和信号肽
        2.2.5 MEOX2蛋白的亲/疏水性及跨膜结构域
        2.2.6 MEOX2 蛋白的二三级结构
        2.2.7 MEOX2 蛋白的抗原肽与保守域
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
[1]RNF10对代谢紊乱大鼠颈动脉再狭窄的作用和机制研究[D]. 余贵泉.重庆医科大学 2018

硕士论文
[1]肉鸡腹水综合征的gallus转录组学分析及丹参酮ⅡA对其防治的研究[D]. 邓广付.江西农业大学 2015



本文编号：3693506