临床疑似猪非典型瘟病毒感染仔猪小脑组织的转录差异

发布时间：2022-10-21 21:06

　　【背景】猪非典型瘟病毒作为一种新发病毒,近几年在国内各省份中陆续被检出,目前针对猪非典型瘟病毒（atypical porcine pestivirus,APPV）的研究报道大多集中于基因组学和流行病学,而其感染宿主后的致病机制尚不清楚。【目的】利用高通量测序技术,对感染仔猪小脑组织进行转录水平差异研究,初步探索APPV致病机制。【方法】将实验组3份排除其余能引发仔猪先天性震颤和神经症状相关病原干扰的APPV感染仔猪的小脑组织,与对照组3份健康仔猪的小脑组织进行高通量测序,比较实验组和对照组之间转录水平的差异。【结果】构建了两个cDNA文库:APPV感染小脑组织文库、健康小脑组织文库。在P≤0.05,|Log2（FC）|≥0.263的筛选标准下,共筛选出差异表达基因（differentially expressed gene,DEG） 381个,其中上调基因163个,下调基因218个;随机选取8个差异表达的基因,经RT-qPCR检测,以β-actin作为内参基因,结果显示8个差异基因的表达趋势与高通量测序一致。【结论】通过对临床感染APPV的仔猪小脑样本进行转录组研究,通过GO、KEGG... 

【文章页数】：9 页

【部分图文】：

样品检测电泳图

差异表达基因的GO分类统计

差异表达基因KEGG注释分类

【参考文献】：
期刊论文
[1]一种新型仔猪先天性震颤及其病原的初步研究[J]. 张文波,吴松松,邓舜洲,周荷田,张志庆,杨丹凤,曹亮亮.  中国畜牧兽医. 2017(07)
[2]Wnt信号通路在神经系统发育中的作用研究进展[J]. 刘丽,龙鼎新.  中南医学科学杂志. 2017(03)
[3]轴突导向信号的研究进展[J]. 马振莲,刘少君.  军事医学科学院院刊. 2006(02)



本文编号：3696377