绒山羊ALX4基因多态性与绒毛性状相关性分析

发布时间：2022-10-23 19:34

　　在绒山羊（Capra hircus）绒毛生长发育的过程中,不同基因的表达调控在毛囊代谢中发挥着重要作用。本研究选择无根状同源异型盒-4 （aristaless-like homeobox 4, ALX4）为候选基因,旨在验证ALX4基因与绒山羊绒毛性状的相关性,为绒山羊分子标记辅助选育提供依据。首先提取20只绒细度处于最高和最低绒山羊血液DNA,采用PCR扩增技术对ALX4基因的3’-UTR、5’-UTR、外显子、启动子序列进行扩增并测序。根据Blast比对结果,统计ALX4基因发生突变的SNP位点,再利用竞争性等位基因特异性PCR （Kompetitive Allele-Specific PCR, KASP）基因分型技术对315只绒山羊个体进行检测,应用一般线性模型进行SNPs位点与绒毛性状的相关性分析。结果表明,ALX4基因启动子区存在SNP1 （T-1700C）,3’-UTR区存在SNP2 （T-14621C）、SNP3 （T-15433C）、SNP4 （G-16377C）、SNP5 （A-17780G）和SNP6 （A-18044G）,每个位点均符合Hardy-Weinberg... 

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
        1.1.1 实验材料
        1.1.2 主要仪器和试剂
    1.2 方法
        1.2.1 基因组DNA提取
        1.2.2 引物设计与合成
        1.2.3 PCR扩增及SNP位点检测
        1.2.4 KASP (Kompetitive Allele-Specific PCR)基因分型
        1.2.5 统计分析
2 结果与分析
    2.1 基因组DNA提取结果及PCR扩增产物电泳检测
    2.2 ALX4基因PCR扩增产物测序
    2.3 ALX4基因各位点基因型频率和基因频率
    2.4 ALX4基因各位点的群体遗传多样性
    2.5 ALX4基因SNPs位点与绒毛性状的关联性分析
    2.6 ALX4基因SNPs单倍型重构及单倍型组合与绒毛性状关联性分析
3 讨论
4 结论


【参考文献】：
期刊论文
[1]羊绒细度候选基因靶标miRNAs筛选和鉴定[J]. 惠太宇,郑圆媛,岳畅,孙家明,郭丹,郭素玲,王意如,刘宇浩,王梓橙,王英轩,黄丽飞,白文林,王泽英.  沈阳农业大学学报. 2019(01)
[2]鸡主要组织相容性复合体B区域多态性分析[J]. 袁海旭,王明月,赵越,王敏,原一桐,赵春江,连玲.  中国家禽. 2018(20)
[3]FGF7亚家族在小鼠毛囊第一生长周期的表达[J]. 牛姝,程笳琪,高淑媛,曹校瑞,吴晋强,陆娜,闫瑞琴,赫晓燕.  畜牧兽医学报. 2018(03)
[4]河西绒山羊绒毛生长的季节性变化规律及其与生长激素关系的研究[J]. 魏云霞,肖玉萍,杨保平,程胜利,杨博辉.  中国草食动物科学. 2012(06)
[5]褪黑激素对PDGFA基因在绒山羊皮肤毛囊中表达模式的影响[J]. 丽春,张文广,杨文柱,王志新,张永斌,高爱琴,张燕军,赵艳红,苏蕊,常子丽,金鑫,王鹏宇,冯林,刘慧,武瑞兵,王瑞军,李金泉.  中国农业科学. 2012(10)
[6]性激素影响毛囊生长的机制进展[J]. 王利生,翁立强,程波.  国际皮肤性病学杂志. 2007(05)

博士论文
[1]内蒙古绒山羊毛被类型遗传规律及其对重要经济性状间接选择研究[D]. 李学武.内蒙古农业大学 2019
[2]内蒙古绒山羊毛囊发育、生长周期及相关基因的研究[D]. 尹俊.内蒙古大学 2004



本文编号：3696996