鸡MTNR1A基因5’调控区的多态性及其与产蛋性状的关联分析

发布时间：2022-10-30 11:20

　　褪黑素（Melatonin，Mel）是光照与生殖系统协调关系中重要的激素信号，它与分布在下丘脑-垂体-性腺轴上的特异性褪黑素受体结合，从各个水平上影响生殖功能，但各受体参与生殖调控的机制目前还不清楚。本研究旨在从分子水平研究鸡MTNR1A基因5’调控区的多态性及验证不同单倍型启动活性的差异。 本实验以寿光鸡、文昌鸡为研究材料，对鸡MTNR1A基因5’调控区进行PCR扩增，用单克隆测序和直接测序的方法分别检测寿光鸡、文昌鸡中存在的SNPs，并将其与产蛋性状进行关联分析，然后对连锁不平衡较强的位点构建单倍型检测其双荧光素酶活性。结果表明： （1）在寿光鸡的8个SNPs中，-100、-110、-126、-329位点对开产日龄和20~25周龄产蛋数有显著影响，MTNR1A基因作用方式主要为加性效应，显性效应不明显。-100位点TT基因型个体的开产日龄显著早于GG型个体4.5天，20~25周龄产蛋数多2.3枚，等位基因T比G能使鸡提前2.3天开产，20~25周产蛋数增加1.2枚；-110位点对上述两个性状的影响与-100位点完全一致。-126位点CC型个体开产日龄显著早于CT型和TT... 

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【学位级别】：硕士

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符号说明
中文摘要
ABSTRACT
1 引言
    1.1 褪黑素的研究进展
        1.1.1 褪黑素的发现、分泌、合成、运输与代谢
        1.1.2 褪黑素对动物的生殖调控
    1.2 褪黑素受体的研究进展
        1.2.1 褪黑素受体的命名、分类及生物学特性
        1.2.2 褪黑素受体的分布与功能
        1.2.3 褪黑激素受体 1A 基因的研究进展
    1.3 鸡产蛋性状分子遗传标记的研究进展
    1.4 单核苷酸多态性
    1.5 研究的目的意义及主要内容
2 材料与方法
    2.1 试验材料
        2.1.1 试验动物和样品的采集
        2.1.2 主要仪器
        2.1.3 主要酶和试剂
        2.1.4 主要数据库及软件
        2.1.5 常用试剂的配制
    2.2 试验方法
        2.2.1 鸡 MTNR1A 基因 5'调控区多态性及其与产蛋性状关系的研究
        2.2.2 鸡 MTNR1A 基因 5'调控区-100、-110、-126 三种单倍型的启动活性检测
3 试验结果
    3.1 鸡 MTNR1A 基因 5'调控区多态性检测及分析
        3.1.1 鸡 MTNR1A 基因 5'调控区的 SNPs 的检测结果
        3.1.2 各 SNPs 位点 TFSEARCH 分析
        3.1.3 寿光鸡、文昌鸡 SNPs 位点群体遗传学分析
    3.2 各 SNPs 位点的连锁不平衡及单倍型分析
        3.2.1 寿光鸡 8 个 SNPs 位点的连锁不平衡及单倍型分析
        3.2.2 文昌鸡 10 个 SNPs 位点的连锁不平衡及单倍型分析
    3.3 鸡 MTNR1A 基因 5'调控区 SNPs 位点与产蛋性状的关联分析
        3.3.1 寿光鸡和文昌鸡 MTNR1A 基因 5'调控区各 SNPs 位点与产蛋性状的关联分析
        3.3.2 鸡 MTNR1A 基因 5'调控区多态性位点单倍型和联合基因型的效应分析
    3.4 鸡 MTNR1A 基因 5'调控区-100、-110、-126 位点三种单倍型的启动活性验证
        3.4.1 -100、-110、-126 位点三种单倍型的构建
        3.4.2 -100、-110、-126 位点三种单倍型的启动活性验证
4 讨论
    4.1 鸡 MTNR1A 基因 5'调控区 SNPs 的意义
    4.2 鸡 MTNR1A 基因 5'调控区 SNPs 品种间的异同
    4.3 鸡 MTNR1A 基因 5'调控区潜在的分子标记
    4.4 鸡 MTNR1A 基因 5'调控区-100、-110、-126 位点三种单倍型启动活性的差异
5 结论
6 参考文献
7 致谢
8 攻读学位期间论文发表情况


【参考文献】：
期刊论文
[1]文昌鸡MTNR1B基因的多态性及其与产蛋性状的关系[J]. 李晓宁,王慧,于希江,姜运良,宋倩,闫超,唐辉.  畜牧兽医学报. 2012(04)
[2]VIPR-1基因5′调控区多态位点与鸡就巢性的关联分析[J]. 周敏,和俊,谢袖娟,沈栩,徐海平,张细权.  畜牧兽医学报. 2012(03)
[3]连城白鸭GnRH基因与产蛋性能的关联分析[J]. 黄种彬,钟志新,刘丽平,秦国荣,吴旭,连森阳,王光瑛,李昂.  中国家禽. 2011(05)
[4]清远麻鸡VIPR-1基因C1704887T、C1715301T位点与繁殖性状的关联性分析[J]. 周敏,沈栩,李莹,许佳俊,李晓鹏,梁少东,何丹林,聂庆华.  江西农业大学学报. 2011(01)
[5]3个基因SNPs及基因聚合对白耳鸡产蛋数的遗传效应[J]. 李国辉,张学余,苏一军,屠云洁,魏岳.  江西农业大学学报. 2010(04)
[6]DRD2基因14个多态位点与鸡产蛋性状的相关性[J]. 徐海平,周敏,方梅霞,曾华,聂庆华,张德祥,张细权.  畜牧兽医学报. 2010(08)
[7]家禽单核苷酸多态性研究与应用新进展[J]. 卢立志,李进军,田勇,傅衍.  农业生物技术学报. 2010(02)
[8]人软骨细胞中褪黑素受体mRNA的表达及意义[J]. 孙光权,邱勇,朱泽章,黄爱兵,李海波,刘臻.  江苏医药. 2009(02)
[9]褪黑素受体1B基因与青少年特发性脊柱侧凸患者骨密度的相关性[J]. 邱旭升,邓亮生,杨晓恩,郑振耀,邱勇.  中国骨质疏松杂志. 2009(01)
[10]人骨髓间充质干细胞褪黑素受体的表达及其意义[J]. 李海波,邱勇,李卫国,孙光权,黄爱兵,邱旭升.  中国脊柱脊髓杂志. 2008(09)

博士论文
[1]鸡卵泡发育相关基因和miRNA的鉴定及功能分析[D]. 康丽.山东农业大学 2009
[2]文昌鸡产蛋性能及蛋品质性状分子标记的研究[D]. 吴旭.扬州大学 2006

硕士论文
[1]鸡褪黑激素受体基因的多态性及其在不同组织中表达量的研究[D]. 李晓宁.山东农业大学 2011
[2]中国荷斯坦牛PRL和POU1F1基因多态性及其与产奶性状的关系研究[D]. 贾祥捷.山东师范大学 2010
[3]文昌鸡GHR基因，ESR基因和IGF-Ⅰ基因与产蛋性能的相关性研究[D]. 葛洪伟.扬州大学 2007
[4]鸡FSHβ基因SNPs分析及其与早期产蛋性能关系的研究[D]. 韩厚明.安徽农业大学 2006
[5]利用多重PCR进行丝羽乌骨鸡产蛋量与微卫星标记的相关分析[D]. 孟凡玲.四川农业大学 2004



本文编号：3698792