利用蛋白质组学技术研究北京油鸡肌肉发育和肌内脂肪沉积的分子机制
发布时间：2022-12-07 00:42
肌肉发育状况直接影响畜禽生产效率,肌内脂肪（IMF）含量是影响肉品质的重要因素。本研究采用绝对和相对定量（iTRAQ）蛋白质组技术检测北京油鸡（BJY）整个生长期胸肌中蛋白质表达谱,对肉鸡不同发育阶段肌肉发育和肌内脂肪代谢的分子机制进行深入研究。本试验包括三部分内容： 试验一：利用蛋白质组学技术筛选北京油鸡胸肌组织中四个生长阶段的差异表达蛋白。选用1日龄北京油鸡40只,随机分为4组,分别在1日龄（出雏）、56日龄（快速生长期）、98日龄（上市日龄）、140日龄（性成熟期）屠宰一组,提取鸡胸肌的总蛋白,构建不同日龄的蛋白混合池并进行iTRAQ检测。结果表明：1)鉴定到517个蛋白,可定量的蛋白494个,210个显著下调,210个显著上调。2)通过分层聚类分析,发现在56日龄和98日龄蛋白表达水平相近,140日龄次之,1日龄最远；1日龄蛋白质表达水平与其他三个时期差异很大。 试验二：北京油鸡肌肉发育相关的差异表达蛋白及分子机制研究。试验动物同试验一。利用蛋白表达谱数据和屠体数据,进行生物信息学和关联分析筛选肌肉发育相关的关键蛋白和信号通路,利用Western Blotting（...
【文章页数】：110 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
摘要
Abstract
英文縮略表
第一章 文献综述
1.1 肌肉生长和发育的研究进展
1.1.1 骨骼肌发育的生物学过程
1.1.2 肌肉发育的研究进展
1.2 肉鸡肉品质研究进展
1.2.1 脂肪和脂肪酸的形成的生物学过程
1.2.2 肌内脂肪与肉品质
1.2.3 肌内脂肪的研究进展
1.2.4 肌肉发育和脂类代谢的调控通路
1.3 蛋白质组学技术在畜禽中的研究进展
1.3.1 常用的蛋白质组学技术
1.3.2 蛋白质组学技术在畜禽研究中的应用
1.4 研究内容以及目的意义
第二章 利用蛋白质组学技术研究北京油鸡不同发育阶段胸肌组织中蛋白表达谱
2.1 前言
2.2 材料和方法
2.2.1 试验材料和样品采集
2.2.2 主要仪器、试剂与配制
2.2.3 实验方法和流程
2.3 试验结果与分析
2.3.1 蛋白提取
2.3.2 蛋白鉴定结果及理化性质分析结果
2.3.3 鉴定蛋白的分层聚类结果
2.3.4 差异蛋白的筛选及GO分析结果
2.3.5 差异蛋白的KEGG通路富集分析
2.3.6 蛋白表达谱与差异蛋白分析
2.4 讨论
2.4.1 iTRAQ技术的选择
2.4.2 iTRAQ技术在家禽中利用的可靠性分析
2.4.3 BJY不同发育阶段胸肌组织中蛋白的发育状况
2.5 小结
第三章 北京油鸡肌肉发育相关的差异表达蛋白及分子机制研究
3.1 前言
3.2 材料和方法
3.2.1 试验材料和样品采集
3.2.2 主要仪器、试剂与配制
3.2.3 试验方法与流程
3.2.4 数据统计与分析
3.3 结果与分析
3.3.1 不同阶段肌肉发育规律
3.3.2 生物信息学手段筛选肌肉发育相关的蛋白
3.3.3 关联分析筛选肌肉发育相关的鉴定
3.3.4 不同阶段差异蛋白的GO富集分析
3.3.5 不同阶段的差异蛋白KEGG通路富集分析
3.3.6 肌肉发育相关的功能蛋白的验证
3.3.7 BJY胸肌肌肉发育的分子调控网路
3.4 讨论
3.5 小结
第四章 北京油鸡肌内脂肪沉积相关的差异表达蛋白及分子机制研究
4.1 前言
4.2 材料和方法
4.2.1 试验材料和样品采集
4.2.2 主要仪器、试剂与配制
4.2.3 试验方法与流程
4.2.4 数据统计与分析
4.3 结果与分析
4.3.1 脂肪在BJY不同阶段不同组织的沉积规律
4.3.2 不同阶段胸肌组织中的脂肪组成分析
4.3.3 不同阶段胸肌组织中脂肪酸组成成分分析
4.3.4 生物信息学筛选与脂类代谢相关的蛋白
4.3.5 关联分析鉴定的与脂肪代谢相关的蛋白
4.3.6 BJY不同发育阶段胸肌组织中与脂肪代谢显著相关的通路的鉴定分析
4.3.7 脂肪代谢相关的功能蛋白的验证
4.3.8 脂肪代谢相关的Pathway的验证
4.4 讨论
4.4.1 基于iTRAQ数据结果对胸肌脂类代谢相关蛋白和通路的筛选
4.4.2 胸肌不同发育阶段的脂肪沉积的机制
4.5 小结
全文结论
1 主要结论
2 创新点
3 需要进一步解决的问题
参考文献
附表
致谢
作者简历
【参考文献】：
期刊论文
[1]北京油鸡体脂分布及沉积规律研究[J]. 付睿琦,赵桂苹,刘冉冉,郑麦青,陈继兰,文杰. 动物营养学报. 2013(07)
[2]耐力运动促进骨骼肌卫星细胞线粒体能量代谢及其对成肌分化的影响[J]. 薄海,王逊,陈啟祥,吉力立,张勇. 中国运动医学杂志. 2012(05)
[3]蛋白组学技术研究有氧运动影响C57BL/6小鼠骨骼肌代谢系列报道之一——有氧运动对胰岛素抵抗小鼠骨骼肌脂代谢相关蛋白的影响[J]. 尹苗苗,牛燕媚,袁海瑞,刘效磊,褚晓蕾,黄雯,傅力. 中国运动医学杂志. 2011(07)
[4]卫星细胞与肌肉肥大关系及成肌因子的运动性调控[J]. 王今越,王小虹,陈民盛,杨海东. 中国组织工程研究与临床康复. 2010(28)
[5]氯仿/甲醇匀浆测定肝脏甘油三酯含量[J]. 曾涛,谢克勤,张翠丽,于丽华,朱振平. 卫生研究. 2008(05)
[6]鸡H-FABP和A-FABP基因表达与肌内脂肪含量相关研究[J]. 李文娟,李宏宾,文杰,陈继兰,赵桂苹,郑麦青. 畜牧兽医学报. 2006(05)
[7]北京油鸡品种资源特性描述[J]. 赵桂苹,陈继兰,文杰,郑麦青,李小华. 中国家禽. 2005(23)
[8]利用基因芯片技术研究两品种鸡脂肪组织差异表达基因[J]. 王洪宝,王启贵,李辉. 生物工程学报. 2005(06)
[9]鸡肉肌苷酸和肌内脂肪沉积规律研究[J]. 陈继兰,文杰,王述柏,赵桂苹,郑麦青,李小华. 畜牧兽医学报. 2005(08)
[10]不同鸡种肌肉肌苷酸和脂肪酸含量的比较[J]. 李慧芳,陈宽维. 扬州大学学报. 2004(03)
博士论文
[1]肉鸡肌内脂肪形成的分子调控网络及相关基因研究[D]. 崔焕先.中国农业科学院 2011
[2]鸡TLRs基因的表达调控与抗沙门氏菌的机制研究[D]. 苟钟勇.中国农业科学院 2012
[3]优质鸡肌内脂肪代谢调控及其与肉质性状关系的研究[D]. 杨烨.中国农业科学院 2005
[4]共轭亚油酸对肉鸡肉品质的影响及其作用机制的研究[D]. 张广民.中国农业科学院 2006
[5]振动训练对大鼠骨骼肌运动能力的影响及其机制探讨[D]. 史仍飞.第二军医大学 2007
[6]鸡肉品质相关脂肪代谢功能基因的筛选及营养调控研究[D]. 李文娟.中国农业科学院 2008
[7]脂肪型和瘦肉型猪肌肉生长和脂肪沉积相关基因的差异表达分析和分子网络构建[D]. 李明洲.四川农业大学 2008
[8]烟酸对鸡脂肪代谢和肉品质的影响及作用机理[D]. 蒋瑞瑞.中国农业科学院 2010
[9]肉鸡肌纤维特性与肉质性状的形成规律及日粮营养调控研究[D]. 赵景鹏.中国农业科学院 2010
硕士论文
[1]后肢悬吊大鼠骨骼肌废用性肌萎缩的蛋白组学研究[D]. 任媛媛.北京体育大学 2010
本文编号：3711921
【文章页数】：110 页
【学位级别】：博士
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摘要
Abstract
英文縮略表
第一章 文献综述
1.1 肌肉生长和发育的研究进展
1.1.1 骨骼肌发育的生物学过程
1.1.2 肌肉发育的研究进展
1.2 肉鸡肉品质研究进展
1.2.1 脂肪和脂肪酸的形成的生物学过程
1.2.2 肌内脂肪与肉品质
1.2.3 肌内脂肪的研究进展
1.2.4 肌肉发育和脂类代谢的调控通路
1.3 蛋白质组学技术在畜禽中的研究进展
1.3.1 常用的蛋白质组学技术
1.3.2 蛋白质组学技术在畜禽研究中的应用
1.4 研究内容以及目的意义
第二章 利用蛋白质组学技术研究北京油鸡不同发育阶段胸肌组织中蛋白表达谱
2.1 前言
2.2 材料和方法
2.2.1 试验材料和样品采集
2.2.2 主要仪器、试剂与配制
2.2.3 实验方法和流程
2.3 试验结果与分析
2.3.1 蛋白提取
2.3.2 蛋白鉴定结果及理化性质分析结果
2.3.3 鉴定蛋白的分层聚类结果
2.3.4 差异蛋白的筛选及GO分析结果
2.3.5 差异蛋白的KEGG通路富集分析
2.3.6 蛋白表达谱与差异蛋白分析
2.4 讨论
2.4.1 iTRAQ技术的选择
2.4.2 iTRAQ技术在家禽中利用的可靠性分析
2.4.3 BJY不同发育阶段胸肌组织中蛋白的发育状况
2.5 小结
第三章 北京油鸡肌肉发育相关的差异表达蛋白及分子机制研究
3.1 前言
3.2 材料和方法
3.2.1 试验材料和样品采集
3.2.2 主要仪器、试剂与配制
3.2.3 试验方法与流程
3.2.4 数据统计与分析
3.3 结果与分析
3.3.1 不同阶段肌肉发育规律
3.3.2 生物信息学手段筛选肌肉发育相关的蛋白
3.3.3 关联分析筛选肌肉发育相关的鉴定
3.3.4 不同阶段差异蛋白的GO富集分析
3.3.5 不同阶段的差异蛋白KEGG通路富集分析
3.3.6 肌肉发育相关的功能蛋白的验证
3.3.7 BJY胸肌肌肉发育的分子调控网路
3.4 讨论
3.5 小结
第四章 北京油鸡肌内脂肪沉积相关的差异表达蛋白及分子机制研究
4.1 前言
4.2 材料和方法
4.2.1 试验材料和样品采集
4.2.2 主要仪器、试剂与配制
4.2.3 试验方法与流程
4.2.4 数据统计与分析
4.3 结果与分析
4.3.1 脂肪在BJY不同阶段不同组织的沉积规律
4.3.2 不同阶段胸肌组织中的脂肪组成分析
4.3.3 不同阶段胸肌组织中脂肪酸组成成分分析
4.3.4 生物信息学筛选与脂类代谢相关的蛋白
4.3.5 关联分析鉴定的与脂肪代谢相关的蛋白
4.3.6 BJY不同发育阶段胸肌组织中与脂肪代谢显著相关的通路的鉴定分析
4.3.7 脂肪代谢相关的功能蛋白的验证
4.3.8 脂肪代谢相关的Pathway的验证
4.4 讨论
4.4.1 基于iTRAQ数据结果对胸肌脂类代谢相关蛋白和通路的筛选
4.4.2 胸肌不同发育阶段的脂肪沉积的机制
4.5 小结
全文结论
1 主要结论
2 创新点
3 需要进一步解决的问题
参考文献
附表
致谢
作者简历
【参考文献】：
期刊论文
[1]北京油鸡体脂分布及沉积规律研究[J]. 付睿琦,赵桂苹,刘冉冉,郑麦青,陈继兰,文杰. 动物营养学报. 2013(07)
[2]耐力运动促进骨骼肌卫星细胞线粒体能量代谢及其对成肌分化的影响[J]. 薄海,王逊,陈啟祥,吉力立,张勇. 中国运动医学杂志. 2012(05)
[3]蛋白组学技术研究有氧运动影响C57BL/6小鼠骨骼肌代谢系列报道之一——有氧运动对胰岛素抵抗小鼠骨骼肌脂代谢相关蛋白的影响[J]. 尹苗苗,牛燕媚,袁海瑞,刘效磊,褚晓蕾,黄雯,傅力. 中国运动医学杂志. 2011(07)
[4]卫星细胞与肌肉肥大关系及成肌因子的运动性调控[J]. 王今越,王小虹,陈民盛,杨海东. 中国组织工程研究与临床康复. 2010(28)
[5]氯仿/甲醇匀浆测定肝脏甘油三酯含量[J]. 曾涛,谢克勤,张翠丽,于丽华,朱振平. 卫生研究. 2008(05)
[6]鸡H-FABP和A-FABP基因表达与肌内脂肪含量相关研究[J]. 李文娟,李宏宾,文杰,陈继兰,赵桂苹,郑麦青. 畜牧兽医学报. 2006(05)
[7]北京油鸡品种资源特性描述[J]. 赵桂苹,陈继兰,文杰,郑麦青,李小华. 中国家禽. 2005(23)
[8]利用基因芯片技术研究两品种鸡脂肪组织差异表达基因[J]. 王洪宝,王启贵,李辉. 生物工程学报. 2005(06)
[9]鸡肉肌苷酸和肌内脂肪沉积规律研究[J]. 陈继兰,文杰,王述柏,赵桂苹,郑麦青,李小华. 畜牧兽医学报. 2005(08)
[10]不同鸡种肌肉肌苷酸和脂肪酸含量的比较[J]. 李慧芳,陈宽维. 扬州大学学报. 2004(03)
博士论文
[1]肉鸡肌内脂肪形成的分子调控网络及相关基因研究[D]. 崔焕先.中国农业科学院 2011
[2]鸡TLRs基因的表达调控与抗沙门氏菌的机制研究[D]. 苟钟勇.中国农业科学院 2012
[3]优质鸡肌内脂肪代谢调控及其与肉质性状关系的研究[D]. 杨烨.中国农业科学院 2005
[4]共轭亚油酸对肉鸡肉品质的影响及其作用机制的研究[D]. 张广民.中国农业科学院 2006
[5]振动训练对大鼠骨骼肌运动能力的影响及其机制探讨[D]. 史仍飞.第二军医大学 2007
[6]鸡肉品质相关脂肪代谢功能基因的筛选及营养调控研究[D]. 李文娟.中国农业科学院 2008
[7]脂肪型和瘦肉型猪肌肉生长和脂肪沉积相关基因的差异表达分析和分子网络构建[D]. 李明洲.四川农业大学 2008
[8]烟酸对鸡脂肪代谢和肉品质的影响及作用机理[D]. 蒋瑞瑞.中国农业科学院 2010
[9]肉鸡肌纤维特性与肉质性状的形成规律及日粮营养调控研究[D]. 赵景鹏.中国农业科学院 2010
硕士论文
[1]后肢悬吊大鼠骨骼肌废用性肌萎缩的蛋白组学研究[D]. 任媛媛.北京体育大学 2010
本文编号：3711921
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