气肿疽梭菌NanA基因克隆及生物信息学分析

发布时间：2022-12-09 00:22

　　为了对气肿疽梭菌NanA基因进行克隆及生物信息学分析,试验根据GenBank中已发表的气肿疽梭菌NanA基因序列设计并合成1对特异性引物,以气肿疽梭菌总DNA为模板,扩增出NanA目的基因并克隆至pMD18-T载体中,对测序正确的NanA基因进行序列对比分析,对NanA蛋白进行理化性质分析与二级结构预测,同时使用在线软件预测NanA蛋白三级结构。结果表明:成功扩增出气肿疽梭菌Nan A基因,与参考序列相比,共存在3处核苷酸突变,核苷酸序列和氨基酸序列与NCBI公布的JF4135 NanA基因序列的同源性均为99.8%。NanA蛋白分子质量约为71 ku,具有较高的抗原指数,二级结构以β-折叠和无规则卷曲为主,有多个抗原表位区域。 

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 菌株及主要试剂
    1.2 Nana基因引物的设计与合成
    1.3 NanA基因的PCR扩增与克隆
    1.4 NanA基因序列对比分析
    1.5 NanA蛋白理化性质分析与二级结构预测
    1.6 NanA蛋白三级结构预测
2 结果与分析
    2.1 NanA基因PCR扩增与克隆
    2.2 NanA基因序列比对分析
    2.3 NanA蛋白理化性质分析
    2.4 NanA蛋白二级结构预测
    2.5 NanA蛋白三级结构预测
3 讨论与结论


【参考文献】：
期刊论文
[1]利用SOE-PCR与TD-PCR技术对气肿疽梭菌FliA（C）-NanA融合基因扩增方法的构建[J]. 李香春,金鑫,朴春宇,金成德,朴春实.  安徽农业科学. 2013(24)
[2]吉林延边地区牛气肿疽病的诊断报告[J]. 段雪岩,金东春,任春宇,车达,云巾宴,齐强,金鑫.  中国畜牧兽医. 2015(10)
[3]气肿疽梭菌PCR检测方法的建立[J]. 云巾宴,任春宇,车达,段雪岩,司唯,金鑫.  江苏农业科学. 2015(10)
[4]肉牛气肿疽病的流行与综合防控措施分析[J]. 武成威.  畜禽业. 2018(07)

硕士论文
[1]延边株气肿疽梭菌的分离鉴定及cctA基因的克隆和表达[D]. 云巾宴.延边大学 2015



本文编号：3714432