OCX-32基因内含子变异对长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质的影响

发布时间：2023-01-03 11:23

　　【目的】探讨OCX-32基因对长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质的遗传效应,为长顺绿壳蛋鸡的保种选育及开发利用提供参考依据。【方法】以长顺绿壳蛋鸡为材料,采用PCR产物直接测序法筛选OCX-32基因SNP多态位点,实时荧光定量PCR检测组织表达谱,运用SPSS 19.0广义线性模型（GLM）分析SNP位点基因型或双倍型与所测定性状指标的相关性。【结果】在长顺绿壳蛋鸡OCX-32基因中检测到3个SNPs位点,分别是位于内含子1上的g.22592323G＞T及内含子3上的g.22597350T＞C和g.22597555G＞A。卡方（χ2）检测结果发现,g.22597350T＞C位点的基因型分布显著偏离HardyWeinberg平衡（P＜0.05,下同）。连锁不平衡分析结果显示,3个SNPs突变位点不存在强连锁不平衡,共发现4种单倍型和8种双倍型,单倍型H1和双倍型H1H2频率最高,分别为0.523和0.345。实时荧光定量PCR检测结果显示,OCX-32基因在长顺绿壳蛋鸡12个组织中存在不同程度的表达,表达量排序为肾脏＞心脏＞子宫＞腹脂＞小肠＞脾脏＞肝脏＞腺胃＞胸肌＞胰腺＞肺脏＞肌胃。关联分析结果显示,... 

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
0 引言
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 基因组DNA和总RNA提取及c DNA合成
    1.3 引物设计
    1.4 长顺绿壳蛋鸡OCX-32基因表达检测
    1.5 长顺绿壳蛋鸡OCX-32基因多态性检测
    1.6 统计分析
2 结果与分析
    2.1 长顺绿壳蛋鸡OCX-32基因SNP位点鉴定结果
    2.2 长顺绿壳蛋鸡OCX-32基因SNP位点遗传特性
    2.3 长顺绿壳蛋鸡OCX-32基因SNP位点的连锁不平衡、单倍型及双倍型分析结果
    2.4 长顺绿壳蛋鸡OCX-32基因实时荧光定量PCR检测结果
    2.5 OCX-32基因SNP位点与长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质的关联分析结果
3 讨论
4 结论


【参考文献】：
期刊论文
[1]ITPR2基因内含子遗传变异与鸭蛋壳品质关联性分析[J]. 谭光辉,李杰章,吴磊,覃媛钰,张依裕.  山地农业生物学报. 2020(02)
[2]杜洛克猪HLCS基因组织表达分析及其编码区多态性与剩余采食量的关联[J]. 张跃博,蒲蕾,张金山,颜华,王立刚,侯欣华,刘欣,高红梅,王立贤,张龙超.  畜牧兽医学报. 2018(06)
[3]灵昆鸡视黄醇结合蛋白（CRBP4）和蛋壳基质蛋白（OCX-32）基因多态性与产蛋性状的相关性研究[J]. 张丽萍,曾涛,卢立志,刘均,周树和,林兴钦,田勇.  农业生物技术学报. 2015(10)
[4]蛋鸡不同产蛋期生殖器官中OC17,OC116和OCX32 mRNA相对定量研究[J]. 叶幼荣,孙杰,张璐,赵宗胜.  中国兽医学报. 2015(09)
[5]蛋壳特异性基质蛋白结构与功能特性研究进展[J]. 刘亚平,马美湖.  中国家禽. 2015(13)
[6]防护林散养草鸡不同产蛋期蛋形、蛋壳指数比较[J]. 杨智青,陈应江,金崇富,丁海荣,时凯,陈长宽.  畜牧兽医杂志. 2013(06)
[7]四种壳基质蛋白研究进展[J]. 肖俊峰,武书庚,张海军,岳洪源,齐广海.  中国家禽. 2012(09)

博士论文
[1]鸡蛋壳超微结构与晶体结构的测定及全基因组关联分析[D]. 段忠意.中国农业大学 2017

硕士论文
[1]汶上芦花鸡蛋品质及其候选基因遗传效应分析[D]. 夏佳豪.山东农业大学 2018
[2]灵昆鸡CRBP4、OCX-32、VLDLR和CTSD基因与产蛋性状的关联分析[D]. 张丽萍.浙江师范大学 2016



本文编号：3727377