威宁绵羊和贵州半细毛羊SOCS7、GFAP基因克
发布时间：2023-02-10 21:23
本试验以6月龄、1周岁和两周岁的威宁绵羊和贵州半细毛羊公母羊为研究对象,利用分子手段对威宁绵羊和贵州半细毛羊JAK/STAT信号转导通路相关基因(SOCS7和GFAP)编码区序列进行克隆,并进行生物信息学性分析。此外,本试验同时采用实时荧光定量PCR的手段对SOCS7和GFAP两个基因在威宁绵羊和贵州半细毛羊不同性别及不同生长阶段心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、小肠及脑组织7个组织中mRNA水平上的表达规律进行探究,以期得到SOCS7和GFAP两个基因在威宁绵羊和贵州半细毛羊各组织内的表达规律。试验的主要研究结果如下:(1)本试验成功克隆得到威宁绵羊和贵州半细毛羊SOCS7基因的CDS区全序列,并发现了的两种不同的可变剪接体,分别命名为SOCS7-V1和SOCS7-V2,进一步对序列进行比对发现两种可变剪接体CDS区长度的不同是由于发生剪接时绵羊SOCS7基因第五外显子和部分第六外显子是否保留所引起的。SOCS7-V1基因CDS区长度为1827bp,编码609个氨基酸,SOCS7-V2基因CDS区长度为1662bp,共编码554个氨基酸,SOCS7-V2相比于SOCS7-V1缺少165b...
【文章页数】：70 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 文献综述
1.1 中国绵羊产业概况
1.1.1 我国绵羊存栏量
1.1.2 我国羊毛产业
1.1.3 我国羊肉产业
1.1.4 贵州省绵羊产业概况
1.2 威宁绵羊品种概述
1.3 贵州半细毛羊品种概述
1.4 JAK/STAT信号通路
1.4.1 SOCS7基因
1.4.2 GFAP基因
1.5 高等生物可变剪接研究现状
1.6 研究目的及意义
第二章 材料与方法
2.1 试验材料
2.1.1 试验样品
2.1.2 主要试验仪器
2.1.3 主要试验试剂
2.1.4 1‰DEPC处理水的配制过程
2.1.5 LB培养基的配制过程
2.1.6 感受态细胞的培养(CaCl2法)
2.1.7 5×TBE的配制
2.2 试验方法
2.2.1 威宁绵羊和贵州半细毛羊采样前准备
2.2.2 威宁绵羊和贵州半细毛组织样总RNA提取
2.2.3 组织总RNA检测
2.2.4 cDNA第一条链合成
2.2.5 引物的设计和合成
2.2.6 PCR反应扩增目的序列
2.2.7 基因CDS区克隆
2.2.8 SOCS7基因部分CDS区克隆
2.2.9 实时荧光定量PCR(qPCR)
2.3 统计与分析数据
第三章 结果与分析
3.1 总RNA提取结果
3.2 PCR扩增目的片段及CDS区克隆
3.3 威宁绵羊和贵州半细毛羊SOCS7基因CDS区克隆
3.4 威宁绵羊和贵州半细毛羊SOCS7基因克隆和序列分析
3.4.1 威宁绵羊和贵州半细毛羊SOCS7及其可变剪接体的蛋白质一级结构分析
3.4.2 威宁绵羊和贵州半细毛羊SOCS7可变剪接体的蛋白理化性质分析
3.4.3 威宁绵羊和贵州半细毛羊SOCS7基因可变剪接体编码蛋白的疏水性与亲水性预测
3.4.4 威宁绵羊和贵州半细毛羊SOCS7可变剪接体蛋白质的三级结构预测
3.5 威宁绵羊和贵州半细毛羊GFAP基因克隆和序列分析
3.5.1 威宁绵羊和贵州半细毛羊GFAP基因的蛋白理化性质分析
3.5.2 威宁绵羊和贵州半细毛羊GFAP基因编码蛋白的疏水性与亲水性预测
3.5.3 威宁绵羊和贵州半细毛羊GFAP蛋白质的三级结构预测
3.6 实时荧光定量PCR
3.6.1 威宁绵羊SOCS7、GFAP基因荧光定量PCR相关曲线
3.6.2 贵州半细毛羊SOCS7、GFAP荧光定量PCR相关曲线
3.6.3 威宁绵羊SOCS7基因表达规律
3.6.4 威宁绵羊GFAP基因表达规律
3.6.5 贵州半细毛羊SOCS7基因表达规律
3.6.6 贵州半细毛羊GFAP基因表达规律
第四章 讨论
4.1 威宁绵羊和贵州半细毛羊SOCS7基因研究
4.2 威宁绵羊和贵州半细毛羊GFAP基因研究
第五章 结论
参考文献
致谢
附录
本文编号：3739937
【文章页数】：70 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 文献综述
1.1 中国绵羊产业概况
1.1.1 我国绵羊存栏量
1.1.2 我国羊毛产业
1.1.3 我国羊肉产业
1.1.4 贵州省绵羊产业概况
1.2 威宁绵羊品种概述
1.3 贵州半细毛羊品种概述
1.4 JAK/STAT信号通路
1.4.1 SOCS7基因
1.4.2 GFAP基因
1.5 高等生物可变剪接研究现状
1.6 研究目的及意义
第二章 材料与方法
2.1 试验材料
2.1.1 试验样品
2.1.2 主要试验仪器
2.1.3 主要试验试剂
2.1.4 1‰DEPC处理水的配制过程
2.1.5 LB培养基的配制过程
2.1.6 感受态细胞的培养(CaCl2法)
2.1.7 5×TBE的配制
2.2 试验方法
2.2.1 威宁绵羊和贵州半细毛羊采样前准备
2.2.2 威宁绵羊和贵州半细毛组织样总RNA提取
2.2.3 组织总RNA检测
2.2.4 cDNA第一条链合成
2.2.5 引物的设计和合成
2.2.6 PCR反应扩增目的序列
2.2.7 基因CDS区克隆
2.2.8 SOCS7基因部分CDS区克隆
2.2.9 实时荧光定量PCR(qPCR)
2.3 统计与分析数据
第三章 结果与分析
3.1 总RNA提取结果
3.2 PCR扩增目的片段及CDS区克隆
3.3 威宁绵羊和贵州半细毛羊SOCS7基因CDS区克隆
3.4 威宁绵羊和贵州半细毛羊SOCS7基因克隆和序列分析
3.4.1 威宁绵羊和贵州半细毛羊SOCS7及其可变剪接体的蛋白质一级结构分析
3.4.2 威宁绵羊和贵州半细毛羊SOCS7可变剪接体的蛋白理化性质分析
3.4.3 威宁绵羊和贵州半细毛羊SOCS7基因可变剪接体编码蛋白的疏水性与亲水性预测
3.4.4 威宁绵羊和贵州半细毛羊SOCS7可变剪接体蛋白质的三级结构预测
3.5 威宁绵羊和贵州半细毛羊GFAP基因克隆和序列分析
3.5.1 威宁绵羊和贵州半细毛羊GFAP基因的蛋白理化性质分析
3.5.2 威宁绵羊和贵州半细毛羊GFAP基因编码蛋白的疏水性与亲水性预测
3.5.3 威宁绵羊和贵州半细毛羊GFAP蛋白质的三级结构预测
3.6 实时荧光定量PCR
3.6.1 威宁绵羊SOCS7、GFAP基因荧光定量PCR相关曲线
3.6.2 贵州半细毛羊SOCS7、GFAP荧光定量PCR相关曲线
3.6.3 威宁绵羊SOCS7基因表达规律
3.6.4 威宁绵羊GFAP基因表达规律
3.6.5 贵州半细毛羊SOCS7基因表达规律
3.6.6 贵州半细毛羊GFAP基因表达规律
第四章 讨论
4.1 威宁绵羊和贵州半细毛羊SOCS7基因研究
4.2 威宁绵羊和贵州半细毛羊GFAP基因研究
第五章 结论
参考文献
致谢
附录
本文编号：3739937
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/3739937.html
