牦牛PAF，PAFR基因克

发布时间：2023-02-25 23:05

　　目的:血小板活化因子(Platelet-activating factor, PAF)广泛存在于哺乳动物多种器官组织当中，它通过其受体(Platelet-activating factor receptor, PAFR)表达生物学活性。为了进一步了解PAF及PAFR的功能，本研究拟克隆这两个基因，并对其进行生物信息学分析，然后检测它们在牦牛妊娠前后子宫中的表达量，以探究PAF和PAFR与牦牛妊娠之间的关系。 方法：首先根据黄牛PAF、PAFR和β-actin基因的cDNA序列设计引物，然后通过RT-PCR方法克隆牦牛PAF和PAFR基因序列，再利用网络资源及相关软件对这两个基因进行生物信息学分析；通过qRT-PCR方法检测PAF和PAFR基因在牦牛妊娠前后子宫中的表达量。 结果:PAF基因包含一个1179bp的开放阅读框，编码392个氨基酸。经软件分析得出：PAF蛋白无跨膜区、无信号肽片段、无蛋白结构域，整体表现为亲水性。牦牛PAF氨基酸序列与黄牛同源性最高，为98.7%。二级结构预测分析表明其主要由α-螺旋、无规卷曲和延伸链组成，与按同源建模法构建的三级结构结果相符。PAFR基因包含...

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【学位级别】：硕士

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摘要
Summary
第一部分 文献综述
    1. PAF，PAFR
        1.1 PAF 简介
        1.2 PAFR 简介
        1.3 PAF 的作用机制
        1.4 PAF 的合成与代谢
        1.5 PAF，PAFR 在附植中的作用
            1.5.1 PAF 与子宫
            1.5.2 PAFR 与子宫
            1.5.3 PAF-AH 与子宫
            1.5.4 PAF 与前列腺素
    2. 牦牛概况
    3. 生物信息学分析
        3.1 生物信息学概况
        3.2 生物信息学的研究内容
第二部分 牦牛 PAF，PAFR 基因克隆及生物信息学分析
    1 实验材料与研究方法
        1.1 实验材料
            1.1.1 实验样品
            1.1.2 主要试剂
            1.1.3 主要仪器
        1.2 实验方法
            1.2.1 引物设计
            1.2.2 总 RNA 的提取及反转录
            1.2.3 牦牛 PAF，PAFR 基因的克隆与扩增
            1.2.4 牦牛 PAF，PAFR 基因的生物信息学分析
    2 实验结果
        2.1 牦牛 PAF，PAFR 基因的克隆与扩增
        2.2 牦牛 PAF，PAFR 基因的生物信息学分析
            2.2.1 牦牛 PAF，PAFR 基因编码蛋白的理化性质
            2.2.2 牦牛 PAF，PAFR 基因编码蛋白的系统发育分析
            2.2.3 牦牛 PAFR 基因编码蛋白信号肽、跨膜区及结构域分析
            2.2.4 牦牛 PAFR 基因编码蛋白二级结构、三级结构预测
    3 讨论
第三部分 牦牛 PAF、PAFR 基因在妊娠前后子宫中的表达
    1. 实验材料与研究方法
        1.1 实验材料
            1.1.1 实验样品
            1.1.2 主要试剂
            1.1.3 主要仪器
        1.2 研究方法
            1.2.1 引物设计
            1.2.2 总 RNA 的提取及反转录
            1.2.3 qRT-PCR 法检测妊娠前后牦牛子宫中 PAF，PAFR 基因的表达
    2. 实验结果
        2.1 PAF 在妊娠前后牦牛子宫中的表达
        2.2 PAFR 在妊娠前后牦牛子宫中的表达
    3. 讨论
第四部分 结论
参考文献
致谢
个人简介
导师简介



本文编号：3749361