功能基因组注释探讨解淀粉芽孢杆菌的益生机制

发布时间：2023-03-03 19:55

　　旨在利用功能基因组注释的方法,深入挖掘解淀粉芽孢杆菌BLCC1-0238基因组中与益生作用密切相关的功能基因。结果表明,解淀粉芽孢杆菌BLCC1-0238的基因组大小约为3.88 Mb,含有3 941个编码序列,有8个基因簇参与聚酮类化物、非核糖体脂肽和芽孢杆菌素的生物合成,部分基因簇参与环状脂肽罗克霉素的合成;该菌还具有1个编码肽基脯氨酰异构酶的基因,12个与耐酸相关的基因和7个参与编码水解酶的基因。综上所述,这些基因的存在有助于动物机体对抗病原菌和胁迫因素,还有利于对营养物质的消化和吸收。

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 主要试剂和仪器
    1.2 基因组测序和注释
    1.3 基因组比较
    1.4 基因组数据挖掘次级代谢产物和水解酶
2 结果与分析
    2.1 基因组比较和注释
    2.2 抗菌代谢产物
        2.2.1 聚酮类化合物
        2.2.2 环二肽
        2.2.3 非核糖体合成的脂肽
        2.2.4 细菌黏附素和聚集素
    2.3 耐酸基因和水解酶
3 讨论与结论



本文编号：3753010