普氏野马两种肠道寄生虫ITS序列的扩增与分析

发布时间：2023-03-29 21:25

　　普氏野马(Equus ferus ssp. przewalskii)作为一种濒危保护动物,其健康成长和种群数量的扩大对种质资源保护具有特殊价值,其体内寄生虫可对机体产生不同程度的病理损害。本研究拟鉴定国家林业局甘肃濒危动物保护中心普氏野马肠道内寄生虫的种类,首先分离普氏野马群体驱虫后粪便中的虫体,进行形态学特征初步鉴定,之后运用生物信息学方法对扩增虫体的内转录间隔区(internal transcribed spacer, ITS)序列进行比对。结果显示,普氏野马肠道共分离出2种虫体,形态学鉴定初步推断为马副蛔虫(Parascaris equorum)和杯环属线虫(Cylicocyclus sp.),分别命名为PE和CN;PE虫体ITS区全长865 bp(GenBank No. MT579850),其中ITS-1、5.8S r DNA和ITS-2的长度分别为421、156和288 bp,其与马副蛔虫的同源性为99.88%;CN虫体ITS区全长843 bp (GenBank No. MT581488),其中ITS-1、5.8S rDNA和ITS-2的长度分别为370、153和320 bp...

【文章页数】：10 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 样品采集
    1.2 主要试剂及实验仪器
    1.3 形态学鉴定
    1.4 虫体DNA的提取
    1.5 PCR扩增ITS序列
    1.6 ITS扩增片段克隆及测序分析
    1.7 进化树构建与遗传距离计算
2 结果与分析
    2.1 虫体形态学特征
    2.2 ITS序列PCR扩增产物鉴定
    2.3 ITS扩增序列的测序及同源性分析
        2.3.1 PE虫体
        2.3.2 CN虫体
    2.4 ITS序列系统发育树分析
        2.4.1 PE与其他蛔虫ITS序列的进化树
        2.4.2 CN与其他线虫ITS序列的进化树
    2.5 ITS序列遗传距离分析
        2.5.1 马副蛔虫(PE)与其他蛔虫ITS序列的遗传距离
        2.5.2 鼻状杯环线虫(CN)与其他线虫ITS序列的遗传距离
3 讨论
4 结论



本文编号：3774509