黄牛GPR41和GPR43基因多态性及其与生长性状相关性研究
发布时间：2023-04-04 01:11
本研究采用PCR-SSCP和DNA测序技术,检测了郏县红牛、鲁西牛和秦川牛3个黄牛品种共403个个体GPR41和GPR43基因的遗传变异,同时探讨黄牛群体的遗传多态性、遗传结构、遗传多态性与生长性状(体重、体高、体长、胸围、管围、腹围等)的关系,以期获取相应的分子遗传学信息,发掘与黄牛重要的经济性状显著相关的遗传标记,为进一步保护利用与开发黄牛种质资源、建立分子标记数据库以及改善与提高黄牛的生产性能提供重要的遗传学依据。本研究共检测了3个黄牛品种GPR41基因6个基因座(P1,P2,P3,P4,P5,P6)和GPR43基因7个基因座(P7,P8,P9,P10,P11,P12,P13)的遗传变异。并与黄牛的生长性状进行了相关分析,获得了以下研究结果:1.黄牛GPR41基因的遗传变异及其与生长性状的关系研究GPR41,又称FFAR3,是人体内最大的膜受体蛋白G蛋白偶联受体(GPCRS)超家族中的成员。高产反刍动物需要利用大量短链脂肪酸作为能源,营养物质的吸收调控的关键步骤是营养物质的感知,行使这一功能的主要是G蛋白偶联受体(GPCRS),GPR41作为脂肪酸感受器可以感知来自消化腔的短链脂...
【文章页数】：111 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
致谢
摘要
Abstract
1 引言
2 文献综述
2.1 短链脂肪酸概述
2.1.1 短链脂肪酸的种类及作用
2.2 G蛋白偶联受体的研究进展
2.2.1 G蛋白偶联受体的分类和基本结构
2.3 短链脂肪酸受体的研究进展
2.3.1 GPR41和GPR43基因的结构特点
2.3.2 GPR41和GPR43蛋白的结构特点
2.3.3 GPR41和GPR43蛋白的组织分布
2.3.4 GPR41和GPR43蛋白的信号转导
2.3.5 GPR41和GPR43蛋白的生理功能
2.3.6 GPR41和GPR43蛋白在动物胃肠道对营养物质吸收调控的研究进展
2.4 小结
3 材料与方法
3.1 实验材料
3.1.1 实验动物
3.1.2 实验试剂
3.1.3 溶液与缓冲液
3.1.4 仪器设备
3.2 实验方法
3.2.1 样本的采集保存与数据收集
3.2.2 生长指标的获得
3.2.3 全血中基因组DNA的提取
3.2.4 DNA质量的电泳检测、纯化及浓度计算
3.2.5 引物设计
3.2.6 PCR扩增及产物检测
3.2.7 图像分析
3.2.8 多态产物测序分析
3.2.9 统计分析方法
4 黄牛GPR41和GPR43基因遗传变异检测结果
4.1 黄牛的基因组DNA样品的检测
4.2 黄牛GPR41基因SNP检测结果
4.2.1 黄牛GPR41基因6个位点的PCR扩增结果
4.2.2 扩增产物PCR-SSCP分析结果
4.2.3 黄牛GPR41基因多态产物DNA测序结果
4.3 黄牛GPR43基因SNP检测结果
4.3.1 黄牛GPR43基因7个位点的PCR扩增结果
4.3.2 扩增产物PCR-SSCP分析结果
4.3.3 黄牛GPR43基因多态产物DNA测序结果
5 黄牛GPR41和GPR43基因的生物信息学分析
5.1 黄牛GPR41基因的生物信息学分析
5.1.1 黄牛GPR41基因同源进化分析
5.1.2 黄牛GPR41基因CDS密码子使用及氨基酸组成
5.1.3 黄牛GPR41蛋白一级结构特征分析与二级结构预测
5.2 黄牛GPR43基因的生物信息学分析
5.2.1 黄牛GPR43基因同源进化分析
5.2.2 黄牛GPR43基因CDS密码子使用及氨基酸组成
5.2.3 黄牛GPR43蛋白一级结构特征分析与二级结构预测
6 黄牛GPR41和GPR43基因群体遗传结构分析
6.1 黄牛GPR41基因群体遗传结构分析
6.1.1 P3位点基因群体遗传结构分析
6.2 黄牛GPR43基因群体遗传结构分析
6.2.1 P7位点位点基因群体遗传结构分析
6.2.2 P8位点位点基因群体遗传结构分析
6.2.3 P10位点位点基因群体遗传结构分析
6.2.4 P12位点位点基因群体遗传结构分析
6.2.5 P13位点位点基因群体遗传结构分析
7 黄牛GPR41和GPR43基因多态性及其与生长性状相关分析
7.1 黄牛GPR41基因多态性与生长性状相关分析
7.1.1 P3基因多态性与生长性状相关分析
7.2 黄牛GPR43基因多态性与生长性状相关分析
7.2.1 P7位点基因多态性与生长性状相关分析
7.2.2 P8位点基因多态性与生长性状相关分析
7.2.3 P10位点基因多态性与生长性状相关分析
7.2.4 P12位点基因多态性与生长性状相关分析
7.2.5 P13位点基因多态性与生长性状相关分析
8 讨论与结论
8.1 讨论
8.1.1 黄牛GPR41基因遗传变异及其与生长性状相关分析
8.1.2 黄牛GPR43基因遗传变异及其与生长性状相关分析
8.1.3 黄牛GPR41和GPR43基因多态位点遗传效应的相关分析
8.2 结论与创新点
8.2.1 结论
8.2.2 创新点
参考文献
作者简历
学位论文数据集
本文编号：3781498
【文章页数】：111 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
致谢
摘要
Abstract
1 引言
2 文献综述
2.1 短链脂肪酸概述
2.1.1 短链脂肪酸的种类及作用
2.2 G蛋白偶联受体的研究进展
2.2.1 G蛋白偶联受体的分类和基本结构
2.3 短链脂肪酸受体的研究进展
2.3.1 GPR41和GPR43基因的结构特点
2.3.2 GPR41和GPR43蛋白的结构特点
2.3.3 GPR41和GPR43蛋白的组织分布
2.3.4 GPR41和GPR43蛋白的信号转导
2.3.5 GPR41和GPR43蛋白的生理功能
2.3.6 GPR41和GPR43蛋白在动物胃肠道对营养物质吸收调控的研究进展
2.4 小结
3 材料与方法
3.1 实验材料
3.1.1 实验动物
3.1.2 实验试剂
3.1.3 溶液与缓冲液
3.1.4 仪器设备
3.2 实验方法
3.2.1 样本的采集保存与数据收集
3.2.2 生长指标的获得
3.2.3 全血中基因组DNA的提取
3.2.4 DNA质量的电泳检测、纯化及浓度计算
3.2.5 引物设计
3.2.6 PCR扩增及产物检测
3.2.7 图像分析
3.2.8 多态产物测序分析
3.2.9 统计分析方法
4 黄牛GPR41和GPR43基因遗传变异检测结果
4.1 黄牛的基因组DNA样品的检测
4.2 黄牛GPR41基因SNP检测结果
4.2.1 黄牛GPR41基因6个位点的PCR扩增结果
4.2.2 扩增产物PCR-SSCP分析结果
4.2.3 黄牛GPR41基因多态产物DNA测序结果
4.3 黄牛GPR43基因SNP检测结果
4.3.1 黄牛GPR43基因7个位点的PCR扩增结果
4.3.2 扩增产物PCR-SSCP分析结果
4.3.3 黄牛GPR43基因多态产物DNA测序结果
5 黄牛GPR41和GPR43基因的生物信息学分析
5.1 黄牛GPR41基因的生物信息学分析
5.1.1 黄牛GPR41基因同源进化分析
5.1.2 黄牛GPR41基因CDS密码子使用及氨基酸组成
5.1.3 黄牛GPR41蛋白一级结构特征分析与二级结构预测
5.2 黄牛GPR43基因的生物信息学分析
5.2.1 黄牛GPR43基因同源进化分析
5.2.2 黄牛GPR43基因CDS密码子使用及氨基酸组成
5.2.3 黄牛GPR43蛋白一级结构特征分析与二级结构预测
6 黄牛GPR41和GPR43基因群体遗传结构分析
6.1 黄牛GPR41基因群体遗传结构分析
6.1.1 P3位点基因群体遗传结构分析
6.2 黄牛GPR43基因群体遗传结构分析
6.2.1 P7位点位点基因群体遗传结构分析
6.2.2 P8位点位点基因群体遗传结构分析
6.2.3 P10位点位点基因群体遗传结构分析
6.2.4 P12位点位点基因群体遗传结构分析
6.2.5 P13位点位点基因群体遗传结构分析
7 黄牛GPR41和GPR43基因多态性及其与生长性状相关分析
7.1 黄牛GPR41基因多态性与生长性状相关分析
7.1.1 P3基因多态性与生长性状相关分析
7.2 黄牛GPR43基因多态性与生长性状相关分析
7.2.1 P7位点基因多态性与生长性状相关分析
7.2.2 P8位点基因多态性与生长性状相关分析
7.2.3 P10位点基因多态性与生长性状相关分析
7.2.4 P12位点基因多态性与生长性状相关分析
7.2.5 P13位点基因多态性与生长性状相关分析
8 讨论与结论
8.1 讨论
8.1.1 黄牛GPR41基因遗传变异及其与生长性状相关分析
8.1.2 黄牛GPR43基因遗传变异及其与生长性状相关分析
8.1.3 黄牛GPR41和GPR43基因多态位点遗传效应的相关分析
8.2 结论与创新点
8.2.1 结论
8.2.2 创新点
参考文献
作者简历
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本文编号：3781498
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