绵羊NRCAM基因的生物信息学分析

发布时间：2023-04-10 05:17

　　利用生物基因组学数据库,对绵羊神经原相关的细胞粘附分子基因(neuro-related celladhesion molecule,NRCAM)进行生物信息学分析,以初步了解其结构并对其编码的蛋白质的功能进行预测。结果表明,绵羊NRCAM基因含有1个最大长度为3 648 bp的开放阅读框,编码1215个氨基酸残基。NRCAM基因编码产物的分子质量为134 367.13 KDa,理论等电点为5.49。亚细胞定位主要位于细胞质(26.1%),属于分泌蛋白,且存在信号肽序列。存在5段IGc2区、1段IG区,1段低复杂性区域以及4段FN3区,且有1段跨膜结构;二级结构以无规卷曲和β折叠为主,三级结构主要由无规卷曲和β折叠缠绕形成。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 序列来源
    1.2 方法
2 结果与分析
    2.1 绵羊NRCAM基因开放阅读框分析
    2.2 绵羊NRCAM基因编码产物的理化性质分析
    2.3 绵羊NRCAM基因编码产物亚细胞定位分析
    2.4 绵羊NRCAM基因编码产物的同源性分析
    2.5 绵羊NRCAM基因编码产物潜在信号肽剪切位点预测
    2.6 绵羊NRCAM基因编码产物跨膜螺旋结构预测
    2.7 绵羊NRCAM基因编码产物保守结构域分析
    2.8 绵羊NRCAM基因编码产物亲疏水性分析
    2.9 绵羊NRCAM基因编码产物二级结构的预测
    2.1 0 绵羊NRCAM基因编码产物三级结构预测与分析
3 结论



本文编号：3788399