绵羊肺炎支原体NM2010株P60基因的生物信息学分析及原核表达
发布时间:2023-04-12 05:10
为了探讨绵羊肺炎支原体NM2010株假定P60样脂蛋白用于制备基因工程亚单位疫苗的可能性,试验运用ExPASy、SignalP 4.0、TMHMM 2.0、SOPMA、 PSORT 6.4、IEDB、BlastP、Hclustersg、Muscle等生物信息学软件,对绵羊肺炎支原体NM2010株P60基因编码蛋白的理化性质、跨膜区、信号肽、二级结构、亚细胞定位、B细胞抗原表位、蛋白功能和基因家族进行预测分析。利用人工合成方法获得P60成熟肽编码区基因序列,并克隆到表达载体pET-32a(+)上进行原核表达及Western-blot分析。结果表明:绵羊肺炎支原体NM2010株P60基因编码蛋白的二级结构以α-螺旋和随机卷曲为主,其结构稳定,可溶性较高;该编码蛋白有信号肽,亚细胞定位在外膜,可能是一种外膜蛋白,具有较好的抗原性;参与绵羊肺炎支原体烟酸和烟酰胺代谢途径,与绵羊肺炎支原体SC01株的GL000100(WP010321430.1)、猪肺炎支原体7448株的0353(WP011290189)属于同一家族,均为P60样...
【文章页数】:6 页
【文章目录】:
1 材料
1.1 质粒和血清
1.2 主要试剂
2 方法
2.1 P60基因的生物信息学分析
2.1.1 假定P60样脂蛋白理化性质分析
2.1.2 信号肽与跨膜区预测
2.1.3 二级结构预测
2.1.4 亚细胞定位预测
2.1.5 B细胞抗原表位预测
2.1.6 假定P60样脂蛋白功能预测
2.1.7 基因家族预测
2.2 P60基因序列的人工合成
2.3 重组蛋白的诱导表达
2.4 重组蛋白的Western-blot分析
3 结果与分析
3.1 P60基因的生物信息学分析
3.1.1 假定P60样脂蛋白理化性质分析
3.1.2 信号肽与跨膜区预测
3.1.3 二级结构预测
3.1.4 亚细胞定位预测
3.1.5 B细胞抗原表位预测
3.1.6 假定P60样脂蛋白功能预测
3.1.7 基因家族预测
3.2 P60基因序列的人工合成
3.3 重组蛋白的诱导表达
3.4 重组蛋白的Western-blot分析
4 讨论与结论
本文编号:3790498
【文章页数】:6 页
【文章目录】:
1 材料
1.1 质粒和血清
1.2 主要试剂
2 方法
2.1 P60基因的生物信息学分析
2.1.1 假定P60样脂蛋白理化性质分析
2.1.2 信号肽与跨膜区预测
2.1.3 二级结构预测
2.1.4 亚细胞定位预测
2.1.5 B细胞抗原表位预测
2.1.6 假定P60样脂蛋白功能预测
2.1.7 基因家族预测
2.2 P60基因序列的人工合成
2.3 重组蛋白的诱导表达
2.4 重组蛋白的Western-blot分析
3 结果与分析
3.1 P60基因的生物信息学分析
3.1.1 假定P60样脂蛋白理化性质分析
3.1.2 信号肽与跨膜区预测
3.1.3 二级结构预测
3.1.4 亚细胞定位预测
3.1.5 B细胞抗原表位预测
3.1.6 假定P60样脂蛋白功能预测
3.1.7 基因家族预测
3.2 P60基因序列的人工合成
3.3 重组蛋白的诱导表达
3.4 重组蛋白的Western-blot分析
4 讨论与结论
本文编号:3790498
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