牛IRS1基因3’UTR的克
发布时间:2023-04-20 04:36
以奶牛乳腺组织为材料,采用3’RACE技术克隆到奶牛IRS1基因3’UTR的全长,进一步对测得的序列进行了验证,同时利用Target Scan 7.0和Pic Tar软件预测可能结合的microRNA,并对多个软件预测结合的microRNA,进行最小结合自由能分析。结果表明,成功克隆了1 327 bp的牛IRS1 3’UTR全长,与NCBI上的预测序列一致率达到99%;miR-128、miR-96、miR-27a为2个软件共同预测到的结合microRNA;3个结合位点的最小自由能分别为-89.58、-87.91、-100.88 k J·mol-1,表明牛IRS1基因表达可能受到这3个microRNA的调控。
【文章页数】:5 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 试验材料
1.1.2 菌株和试剂
1.1.3 引物设计与合成
1.2 方法
1.2.1 牛乳腺组织Total RNA提取
1.2.2 牛IRS1基因3’UTR的扩增
1.2.3 序列拼接
1.2.4 牛IRS1基因3’UTR的克隆、鉴定及分析
1.2.5 序列BLAST比对分析
1.2.6 靶位点预测
2 结果与分析
2.1 牛乳腺组织Total RNA提取结果
2.2 已知序列验证结果
2.3 3'端序列获取结果
2.4 RACE序列验证结果
2.5 序列拼接和同源比对结果
2.6 靶位点预测及同源性分析
3 讨论
本文编号:3794903
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1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 试验材料
1.1.2 菌株和试剂
1.1.3 引物设计与合成
1.2 方法
1.2.1 牛乳腺组织Total RNA提取
1.2.2 牛IRS1基因3’UTR的扩增
1.2.3 序列拼接
1.2.4 牛IRS1基因3’UTR的克隆、鉴定及分析
1.2.5 序列BLAST比对分析
1.2.6 靶位点预测
2 结果与分析
2.1 牛乳腺组织Total RNA提取结果
2.2 已知序列验证结果
2.3 3'端序列获取结果
2.4 RACE序列验证结果
2.5 序列拼接和同源比对结果
2.6 靶位点预测及同源性分析
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