乏情和发情初产母猪下丘脑–垂体–卵巢轴中lincRNAs表达谱比较分析

发布时间：2023-04-27 00:00

　　初产母猪断奶后能否正常发情对养猪生产影响重大,也是初产母猪被淘汰的主要原因。本研究以乏情和发情初产母猪为研究对象,首次利用RNA-seq技术对其下丘脑-垂体-卵巢轴中的基因间长链非编码RNAs(long intergenic noncoding RNAs, lincRNAs)进行筛选比较,得到lincRNAs的表达图谱,并对其特征和功能进行了初步分析。结果显示,在乏情和发情初产母猪下丘脑–垂体–卵巢轴中鉴定得到3519个lincRNAs,以发情组为对照共有17个lincRNAs存在差异表达,其中12个表达上调,5个表达下调(FC≥2, P<0.05)。选择4个差异表达的lincRNAs经qRT-PCR验证,其表达水平与测序结果基本一致。对这17个差异表达的lincRNAs进行GO分析、KEGG通路分析及lincRNA-mRNA共表达网络分析,发现这些lincRNAs主要与猪卵母细胞减数分裂成熟、卵巢细胞分化及颗粒细胞凋亡等生殖活动相关。本研究结果丰富了猪lincRNAs数据资源,为进一步深入研究初产母猪的生殖机能提供了理论依据。

【文章页数】：15 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 实验动物和样品制备
    1.2 样品总RNA提取
    1.3 cDNA文库构建和RNA-seq
    1.4 序列比对和转录本构建
    1.5 lincRNAs鉴定
    1.6 差异表达的linc RNAs和差异表达的m RNAs筛选
    1.7 lincRNAs功能预测
    1.8 lincRNA-mRNA共表达网络分析
    1.9 差异表达lincRNAs qRT-PCR验证
2 结果与分析
    2.1 转录本组装及lincRNAs鉴定
    2.2 lincRNAs结构特征分析
    2.3 差异表达lincRNAs和差异表达mRNAs的表达谱
    2.4 差异表达lincRNAs验证
    2.5 GO富集和KEGG通路分析
    2.6 lincRNA-mRNA共表达网络分析
3 讨论



本文编号：3802451