绵羊CARTPT基因的生物信息学分析

发布时间：2023-05-03 13:40

　　试验旨在探究绵羊CARTPT基因所编码蛋白的结构与功能,利用生物信息学软件研究其理化性质、亲疏水性、信号肽、跨膜区域、蛋白质二级结构与三级结构、亚细胞定位和蛋白结构域、糖基化和磷酸化位点,并构建不同物种的CARTPT基因的系统发育树。结果表明:绵羊CARTPT基因CDS区全序列长为351 bp,编码116个氨基酸,编码蛋白的相对分子质量12 790.18 Da,理论等电点8.22,脂肪系数114.48,总平均亲水性-0.006,属于分泌蛋白,没有跨膜区域结构;二级结构中主要以α-螺旋与无规则卷曲为主;亚细胞定位分析预测该蛋白最可能在细胞外基质发挥其生物学作用,有1个跨膜结构域;该蛋白质有5个丝氨酸(Ser)、1个苏氨酸(Thr)、2个酪氨酸(Tyr)磷酸化位点;系统进化树发现绵羊与山羊亲缘关系最近。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 CARTPT基因序列来源
    1.2 试验方法
2 结果与分析
    2.1 绵羊CARTPT蛋白基本理化性质
    2.2 绵羊CARTPT基因编码的蛋白质疏水性与亲水性分析
    2.3 绵羊CARTPT蛋白信号肽和跨膜螺旋结构预测
    2.4 绵羊CARTPT基因编码蛋白二级结构和三级结构预测
    2.5 绵羊CARTPT蛋白亚细胞定位与结构域的预测
    2.6 绵羊CARTPT蛋白磷酸化位点与糖基化位点预测
    2.7 物种间CARTPT基因核苷酸同源性比较
3 讨论
4 结论



本文编号：3806809