基于高通量测序技术分析笼养熊猴肠道细菌菌群多样性

发布时间：2023-08-06 20:15

　　为了明确熊猴(Macaca assamensis)肠道菌群的组成,试验采用高通量测序技术对2只成年(雌雄各1只)和2只少年(雄性)笼养熊猴粪便中的细菌16S rRNA基因V3和V4区域扩增子进行分析。结果表明:本试验共获得460种OTUs聚类信息,每个样品平均(395.00±8.54)个。共注释到15个门,平均相对丰度高于1%的有4个,分别为厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门和螺旋体门,丰度分别为(61.66±8.47)%、(31.84±7.23)%、(3.16±1.09)%和(1.73±0.50)%。共注释到115个属,平均相对丰度高于1%的属有19个,其中占比最高的是乳酸杆菌属,其次为理研菌科_RC9菌属和普雷沃菌属₉,丰度分别为(14.61±3.17)%、(11.68±3.49)%和(8.69±1.03)%。笼养熊猴肠道菌群在少年雄性与成年雄性个体间差异较小,性别间差异相对较大。肠道微生物组成在门水平上与其他猕猴属基本一致,但在属水平上有较大差异。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 粪便样品的采集
    1.2 DNA的提取和PCR扩增
    1.3 数据的统计分析
2 结果与分析
    2.1 OTUs分析
    2.2 α多样性和β多样性分析
    2.3 门和属水平上的菌群结构
3 讨论与结论



本文编号：3839982