猪LEF-1基因多态性与乳头数性状关联性分析

发布时间：2023-10-06 16:20

　　猪乳头数数量性状是种猪选育的重要指标之一，其数目的多少及对称情况是影响窝仔数、母猪哺育率和仔猪成活率的重要因素。因此，研究与乳头数数量性状相关基因多态性和评估它们对乳头数数量性状的影响，有利于加速中国高乳头数地方猪种的选育。淋巴增强因子(LEF-1)是TCF(T-cell specific factor (TCF) family)家族成员之一，在乳腺上皮细胞发育中有重要作用。LEF-1基因位于猪第八染色体，由12个外显子和11个内含子组成。研究表明，猪LEF-1基因是影响乳头数数量性状的候选基因，但目前研究其多态性较少且不够深入，因此有必要进一步搜寻挖掘LEF-1基因多态性，并评估其与猪乳头数数量性状之间的关联性。 本实验首先通过qPCR的方法检验3日龄和180日龄关中黑猪各组织以及不同发育时期乳头组织中LEF-1基因的表达情况，初步评估LEF-1基因在乳头发育过程中的作用潜能。其次，提取关中黑猪、汉江黑猪、大白猪和八眉猪耳组织样中的基因组DNA，并构建基因池。然后，通过基因池测序和PCR-RFLP方法鉴定猪LEF-1基因的多态位点。再次，通过生物信息学分析LEF-1基因多态位点与乳头...

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【学位级别】：硕士

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摘要
ABSTRACT
文献综述
    第一章 乳腺和乳头的形态发生及调控
        1.1 乳腺和乳头的形态发生
            1.1.1 乳线的形成与特化
            1.1.2 乳腺基板的形成
            1.1.3 腺芽的形成
            1.1.4 原始乳腺导管分支的形成
        1.2 乳腺和乳头形态发生的调控
            1.2.1 Wnt 信号通路对乳腺和乳头的发育调控
            1.2.2 Fgf 信号通路对乳腺和乳头的发育调控
            1.2.3 Tbx3 信号通路对乳腺和乳头的发育调控
            1.2.4 Neuregulin 3 (Nrg3)对乳腺和乳头的发育调控
            1.2.5 IGF-1/P190-B 对乳腺和乳头的发育调控
        1.3 胚胎时期乳腺形态发生与乳腺癌
    第二章 猪乳头数数量性状位点的研究进展
        2.1 猪乳头数数量性状位点(QTL)的定位
            2.1.1 资源群体组建
            2.1.2 初步定位和精确定位
            2.1.3 高密度的 SNP
            2.1.4 候选基因的筛选
        2.2 猪乳头数性状 QTL 定位及候选基因的相关报道
    第三章 LEF-1 基因和其多态性研究
        3.1 LEF-1 基因概述
        3.2 LEF-1 基因与乳头和乳腺形态发生相关通路之间的联系
        3.3 猪 LEF-1 基因多态研究
实验研究
    前言
    第四章 猪乳头结构形态观察
        4.1 材料和方法
            4.1.1 样品与试剂
            4.1.2 溶液试剂配方
            4.1.3 仪器与设备
            4.1.4 冰冻切片
            4.1.5 HE 染色
        4.2 结果
            4.2.1 八眉猪乳头组织形态学观察
            4.2.2 关中黑猪乳头组织形态学观察
        4.3 讨论
        4.4 小结
    第五章 猪 LEF-1 基因组织表达谱
        5.1 材料方法
            5.1.1 道德声明
            5.1.2 材料
            5.1.3 溶液试剂配方
            5.1.4 仪器与设备
            5.1.5 RNA 提取
            5.1.6 qPCR 检测
            5.1.7 统计分析
        5.2 结果
            5.2.1 LEF-1 基因在 3 日龄关中黑猪各组织中的差异表达
            5.2.2 LEF-1 基因在 180 日龄关中黑猪各组织中的差异表达
            5.2.3 LEF-1 基因在关中黑猪乳腺发育不同时期中的差异表达
        5.3 讨论
        5.4 小结
    第六章 猪 LEF-1 基因多态性鉴定和与乳头数性状关联分析
        6.1 材料和方法
            6.1.1 样品与试剂
            6.1.2 溶液试剂配方
            6.1.3 仪器与设备
            6.1.4 DNA 提取
            6.1.5 引物设计
            6.1.6 统计分析
        6.2 结果
            6.2.1 猪 LEF-1 基因多态位点鉴定
            6.2.2 群体遗传指标
            6.2.3 基因型和等位基因频率分析
            6.2.4 猪 LEF-1 基因多态位点与总乳头数数量性状关联分析
            6.2.5 单体型分析
        6.3 讨论
        6.4 小结
    第七章 干扰 LEF-1 基因对猪原代乳腺上皮细胞的影响
        7.1 材料方法
            7.1.1 样品与试剂
            7.1.2 溶液试剂配方
            7.1.3 仪器与设备
            7.1.4 猪乳腺上皮细胞分离和培养
            7.1.5 转染
            7.1.6 统计分析
        7.2 结果
            7.2.1 猪乳腺上皮细胞分离和培养
            7.2.2 猪 LEF-1 基因干扰序列合成
            7.2.3 猪 LEF-1 基因干扰效率检验
            7.2.4 干扰猪 LEF-1 基因对乳腺发育相关基因的影响
        7.3 讨论
        7.4 小结
结论
创新点
进一步研究
参考文献
附录
致谢
作者简介



本文编号：3852044