不同绵羊品种的leptin基因多态性检测及分析

发布时间：2023-11-24 19:22

　　本实验是以104头常年发情的湖羊和90头季节性发情的阿勒泰羊，两个绵羊品种为主要研究对象。利用PCR-SSCP技术对两个品种绵羊的leptin基因多态性进行检测，并对筛查到的leptin基因位点多态性与绵羊季节性发情进行相关分析。结果如下： 在Leptin外显子2扩增片段上检测到AA、AB、BB三种SSCP基因型，BB基因型在阿勒泰羊群体中属于优势基因型，而AA基因型在湖羊中属于优势基因型。对两个群体进行基因型频率独立性χ2检验，差异极显著（P<0.001），说明BB基因型是影响季节性发情的有利基因型，并且该位点基因型分布处于Hardy-Weinberg平衡。在leptin外显子3扩增片段上检测的到CC、CD、DD三种SSCP基因型。CC基因型在湖羊上是优势基因型，并且未检测到DD基因型。对两个群体进行基因型频率独立性χ2检验，差异显著（P<0.01），该位点基因型分布处于Hardy-Weinberg平衡。 DNA测序结果表明，与湖羊相比，在阿勒泰羊leptin基因第一内含子上发现有三个连续碱基TTG的插入和C/T碱基突变；而第三外显子上发生G/T碱基突变，编码氨基酸由缬氨...

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摘要
Abstract
中英文对照表
文献综述
    1.Leptin 的研究进展
        1.1 ob 基因的发现和起源
        1.2 Leptin 的结构
        1.3 Leptin 受体
        1.4 Leptin 基因的生物学功能
            1.4.1 Leptin 对摄食的调控
            1.4.2 Leptin 对糖代谢和胰岛素作用的影响
            1.4.3 Leptin 对能耗的调节
            1.4.4 调节生殖和发育
        1.5 Leptin 与绵羊季节性繁殖的相关联系
            1.5.1 季节性繁殖的生理调控通路
            1.5.2 Leptin 与季节性发情的相关分析
        1.6 Leptin 在畜牧业的应用前景
    2.湖羊和阿勒泰羊品种资源的简介
        2.1 常年发情绵羊品种——湖羊
        2.2 季节性发情绵羊品种——阿勒泰羊
    3.SNP 与 PCR-SSCP 技术
        3.1 SNP 的概念及存在形式
        3.2 SNP 检测方法与手段
            3.2.1 限制性片段长度多态性法
            3.2.2 DNA 测序法
            3.2.3 基因芯片技术
            3.2.4 焦磷酸测序法
            3.2.5 变性高效液相色谱
        3.3 PCR-SSCP 技术原理
        3.4 PCR-SSCP 技术发展历程
        3.5 PCR-SSCP 技术的应用
    4.研究目的和意义
第一章 绵羊 Leptin 基因第二、三外显子 PCR-SSCP 检测及序列分析
    1.材料与方法
        1.1 实验动物
        1.2 实验试剂
        1.3 实验仪器
        1.4 实验方法
            1.4.1 基因组 DNA 的提取
            1.4.2 基因组浓度及纯度测定
            1.4.3 引物设计和 PCR 反应程序
            1.4.4 PCR-SSCP 检测
            1.4.5 DNA 测序
        1.5 数据处理及方法
            1.5.1 基因型频率和基因频率
            1.5.2 Hardy-Weinberg 平衡检测
            1.5.3 位点纯合度和杂合度
            1.5.4 有效等位基因数
            1.5.5 多态信息含量
    2.结果与分析
        2.1 PCR 产物检测
        2.2 SSCP 检测及电泳结果分析
            2.2.1 Leptin 第二外显子扩增片段 SSCP 结果分析
            2.2.2 Leptin 第三外显子扩增片段 SSCP 结果分析
        2.3 基因型频率和等位基因频率的统计和分析
            2.3.1 基因型和基因频率分析
            2.3.2 基因型和基因频率分析
第二章 绵羊 Leptin 基因多态性及其绵羊季节性发情的相关分析
    1.材料与方法
        1.1 实验材料
        1.2 数据处理方法和分析软件
    2.结果和分析
        2.1 基因频率和等位基因频率差异性分析
        2.2 两个绵羊群体 leptin 基因遗传特性分析
        2.3 氨基酸理化性质分析
            2.3.1 分子式及等电点
            2.3.2 蛋白二级结构中蛋白结合位点
            2.3.3 其他理化性质参数
        2.4 蛋白三维结构比对分析
    3.讨论
全文结论
参考文献
附录Ⅰ 主要仪器设备
附录Ⅱ 试剂配制
致谢
作者简介



本文编号：3866438