一株猪瘟病毒的分离鉴定及E2基因遗传变异分析

发布时间：2023-12-24 14:00

　　为分析广西猪瘟病毒(CSFV)遗传变异情况及其与疫苗株的差异,通过RT-PCR方法在猪瘟常规免疫猪场发病材料中检测到1份猪瘟病毒阳性的病料。将病料研磨、过滤后接种PK-15细胞,并在细胞上连续传代进行病毒的分离,通过RT-PCR和间接免疫荧光(IFA)方法鉴定,成功分离到了1株猪瘟病毒,命名为CSFV GXNN1896株。对GXNN1896株E2基因进行扩增、克隆测序和序列比对,结果表明该毒株E2基因与HCLV株、Shimen株等参考毒株E2基因的核苷酸序列同源性为81.9%～97.5%,氨基酸相似度为87.7%～96.8%,E2基因结构域的B、C亚区分别在12个和19个氨基酸的变异,与我国2.1 d亚型哈尔滨分离株NK150425株(GenBank;MF150643.1)同源性最高(96.8%),与德国疫苗毒株Reims(GenBank;AY259122.1)同源性最低(87.7%),与中国猪瘟兔化弱毒疫苗株C株(GenBank;Z46258.1)相比有46个氨基酸的突变。遗传进化树分析发现GXNN1896株的E2基因与参考疫苗毒株遗传距离较远,且位于2.1 d亚群,属于野毒株。说明...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
        1.1.1 细胞
        1.1.2 主要试剂
        1.1.3 主要仪器设备
    1.2 方法
        1.2.1 猪场送检样品检测和CSFV E2基因的扩增
        1.2.2 病毒分离
        1.2.3 间接免疫荧光试验
        1.2.4 猪瘟病毒RNA的提取及RT-PCR鉴定
        1.2.5 猪瘟病毒E2基因比较和遗传进化分析
2 结果
    2.1 猪瘟病料的检测
    2.2 CSFV阳性样品的检测
    2.3 猪瘟病毒的分离和鉴定
    2.4 序列比对结果及结构域分析
    2.5 遗传进化树分析
3 讨论



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