优质鸡MyD88基因多态性及其与白痢易感性的关联分析

发布时间：2024-01-21 09:39

　　鸡白痢是一种严重威胁现代家禽养殖业的细菌性疾病,该病不仅可造成雏鸡的大规模死亡,同时隐性感染使得感染鸡生长迟缓、生产性状降低等,从而给养殖业造成重大的经济损失。养殖场主要疫苗接种和添加抗生素等药物的方法对其进行防治,同时也造成了致病菌耐药升高和禽产品抗生素残留等问题。随着研究的不断深入,人们发现鸡白痢的发生与个体的遗传因素相关。已有研究表明,NRAMP1、TLR4及MHC等基因多态性与抗鸡白痢沙门氏菌性状相关联。MyD88基因作为先天免疫通路中的一种重要的衔接蛋白,在免疫应答反应中发挥着重要作用。但是MyD88基因的多态性与鸡白痢疾病的关系却尚未见报道。为了探究鸡MyD88基因的多态性和鸡白痢沙门氏菌易感性之间的关联性分析。本试验基于病例-对照试验设计,以二郎山山地鸡为试验材料,采集阳性鸡样本血样128份,阴性鸡血样156份,共284份血样提取全基因组DNA,采用制作DNA池进行直接测序的方法筛选MyD88基因CDS区的变异位点,然后对采集的所有样本进行直接测序来检测MyD88基因CDS区的单核苷酸多态性,并进行基因分型,最后使用SPASS21.0软件和Hploview 4.2软件分别...

【文章页数】：52 页

【学位级别】：硕士

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摘要
ABSTRACT
1. 文献综述
    1.1 选题背景
    1.2 鸡白痢的流行特点
    1.3 鸡白痢的临床诊断
    1.4 鸡白痢的剖检变化
    1.5 鸡白痢的检测方法
    1.6 鸡白痢的预防
    1.7 鸡白痢沙门氏菌感染生物学
        1.7.1 胃肠道的侵入
        1.7.2 全身系统感染
        1.7.3 清除、持续感染或死亡
    1.8 先天免疫中的模式识别受体-TLR
        1.8.1 MyD88依赖性途径
        1.8.2 TRIF依赖性途径
    1.9 TLR间的协同作用
    1.10 鸡TLR4/MyD88/NF-κB信号通路与沙门氏菌感染的关系
    1.11 MyD88基因研究现状
        1.11.1 MyD88的发现
        1.11.2 MyD88的信号
    1.12 SNP的检测方法
    1.13 本研究的内容及目的意义
2. 材料和方法
    2.1 试验材料
    2.2 试剂与仪器
    2.3 主要生物学软件
    2.4 试验方法
        2.4.1 鸡白痢检测
        2.4.2 全基因组DNA提取与检测
        2.4.3 目的基因扩增
        2.4.4 构建DNA池
        2.4.5 SNP引物的筛选
        2.4.6 统计分析
3. 结果与分析
    3.1 基因组DNA提取结果
    3.2 鸡MyD88基因PCR扩增结果
    3.3 目的片段的确定与DNA池测序结果
    3.4 哈迪-温伯格平衡
    3.5 MyD88基因多态位点的等位基因频率与基因型频率
    3.6 单倍型分析
        3.6.1 单倍型组的构建
        3.6.2 单倍型与抗鸡白痢性状的关联性
4. 讨论
    4.1 病例-对照研究分析
    4.2 鸡MyD88基因CDS区的SNPs的分析
    4.3 MyD88基因的多态性与抗鸡白痢性状的关联分析
    4.4 单倍型分析
5. 结论
参考文献
致谢
攻读硕士期间的研究成果



本文编号：3881729