鸭绿壳蛋表型与候选基因族及主选SLCO2B1基因关联功效研究

发布时间：2024-01-24 14:04

　　家禽蛋壳颜色作为现代家禽育种的重要性状之一广受业界关注。试验以鸭绿壳蛋为研究素材,利用转录组学和候选基因研究两种技术手段分析鸭蛋的绿壳表型关键基因突变,为阐明鸭蛋绿壳表型形成的分子机理提供依据。试验一鸭绿壳蛋表型调控候选基因与功能分析试验分别从35周龄的2个金定鸭种群中,每个群随机选取3只产绿壳蛋和3只产白壳蛋的鸭,共12只,利用转录组测序技术对蛋壳腺组织进行转录组测序分析。结果表明:(1)转录组测序共得到41000000个有效reads,其中55.9%的reads能够匹配到鸭参考基因组,并且组装成31542个转录本,平均长度为1839±86 bp。(2)绿壳表型候选基因共464个,其中230个基因在绿壳蛋性状形成中表达下调,234个基因表达上调。(3)候选基因中,有359个基因被富集到1515条生物学过程,363个基因注释到250条细胞组分,339个基因注释到469条分子功能GO富集条目中。基因过度表达分析表明,其中9条生物学过程、6条细胞组分和1条分子功能条目显著过度表达(P<0.05)。(4)候选基因中,有13个Ca2+,10个Na+,8个K+,5个H+,1个Cl-转运蛋白...

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【学位级别】：硕士

图1-1血红素代谢通路（Bonkovskyetal.2013）

图1-2OATP基因家族系统进化树

图1-3人OATP1B1基因跨膜结构域（HagenbuchandGui2008）

图2-112个转录本平均测序深度分布情况

本文编号：3883944