中国地方山羊品种群体遗传结构和选择信号分析

发布时间：2024-02-04 05:07

　　我国山羊品种资源丰富,特征明显,具有高繁、抗逆、耐粗饲等特性。山羊遗传资源的保护和开发利用,是我国羊产业发展的重要基础。但是随着近年来畜牧业飞速发展以及外来优良品种的大量引进,地方山羊的遗传多样性和种质特性受到一定的威胁,因此研究我国山羊品种的种群历史、群体结构、遗传多样性和基因组选择痕迹,可以摸清我国山羊遗传资源家底,为优良山羊品种的保护和利用提供理论依据。因此本论文利用Illumina山羊SNP 50K Beadchip对我国14个山羊品种和2个野生山羊种群共计240个个体进行了遗传多样性、群体遗传结构和基因组选择痕迹分析,并根据此结果提出了我国山羊遗传资源保护的相关对策,获得相关结果如下:(1)遗传多样性分析发现戴云山羊的近交系数最高,杂合度最低;而新疆山羊的近交系数最低,杂合度最高,说明戴云山羊品种内存在着一定程度的近交,遗传多样性不丰富。利用主成分分析(PCA)、STRUCTURE、NETVIEW和邻接(NJ)树分析群体遗传结构,结果表明我国地方山羊品种可以划分为三个类群:北方群体、西南群体和南方群体;野生岩羊和北山羊则与北方群体的聚类关系更近;群体遗传结构分析还显示成都麻羊...

【文章页数】：45 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图2-1中国14个地方山羊品种和野生岩羊、北山羊地理分布

图2-1中国14个地方山羊品种和野生岩羊、北山羊地理分布Figure2-1Distributionof14Chineseindigenousgoatbreeds,C.aegagrusandC.ibex2.2.3基因分型与质量控制2.2.3.1....

图2-2PCA分析结果

州大学硕士研究生学位论文中国地方山羊品种群体遗传结构和选择信号分析

图2-3中国14个地方山羊品种的最大似然法进化树

图2-2PCA分析结果Figure2-2TheresultofthePCAanalysis

图2-4K=2-8STRUCTURE结果

兰州大学硕士研究生学位论文中国地方山羊品种群体遗传结构和选择信号分析如图2-4所示的结果，当K=2时野羊种群Y和B其他品种明显分开。可以看出当K值增加时，部分山羊品种从大的聚类中分离了出来，当K=3时，LZS、DYS有着比较明显的分离，同时MTS、....

本文编号：3895262