蝙蝠病毒组学及其新病毒的发现与鉴定

发布时间：2024-02-04 19:16

　　蝙蝠是世界上仅次于啮齿类的第二大类哺乳动物，其分布于除两极以外的地方，同时也是许多病毒的自然宿主。我国云南省地处西南边陲，与缅甸、老挝、越南等东南亚国家接壤，战略意义突出。该地区是多种疾病的疫源地，研究发现该地区蝙蝠携带有多种人兽共患病毒，如尼帕病毒(Nipah virus)、乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis virus)、基孔肯雅病毒(Chikungunya virus)、狂犬病毒(Rabiesvirus)、圆环病毒(Circovirus)等。为了有效地监控云南省及周边地区新发传染病(emerging infectious diseases, EID)，防止野生动物(特别是蝙蝠)疫病，跨种和跨境传播给其它动物甚至是人类，保障边境地区人民生命安全，彻底调查该地区蝙蝠病毒生态学具有重要的意义。而基于第二代高通量测序(High-throughputsequencing)的病毒宏基因组学(Viral metagenomics, ViralMeta)则为调查已知和未知病毒提供了高效的工具。 本研究于2008年到2011年间，共收集到1,219份外表健康蝙蝠样品，收集地点...

【文章页数】：141 页

【学位级别】：博士

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英文缩略词表
伦理证明
摘要
Abstract
前言
实验设计
第一章 蝙蝠病毒宏基因组学研究
    1.1 材料
        1.1.1 蝙蝠样品采集
        1.1.2 主要试剂与耗材
        1.1.3 实验仪器
        1.1.4 生物信息学软件
    1.2 方法
        1.2.1 蝙蝠种类鉴定及解剖
        1.2.2 蝙蝠样品研磨
        1.2.3 蝙蝠样品病毒宏基因组学前期处理
        1.2.4 蝙蝠样品 RNA 提取
        1.2.5 ViralMeta 反转录及 SISPA 扩增
        1.2.6 病毒宏基因组学测序
        1.2.7 特定病毒 PCR/RT-PCR 检测
    1.3 结果
        1.3.1 蝙蝠样品采集结果
        1.3.2 核酸 SISPA 扩增结果
        1.3.3 病毒宏基因组学测序结果
        1.3.4 腺病毒检测结果
        1.3.5 正嗜肝病毒检测结果
        1.3.6 星状病毒检测结果
        1.3.7 冠状病毒检测结果
        1.3.8 轮状病毒检测结果
        1.3.9 软腐病毒检测结果
    1.4 讨论
第二章 新型蝙蝠病毒的鉴定
    2.1 材料
        2.1.1 蝙蝠样品
        2.1.2 主要试剂与耗材
        2.1.3 细胞系与实验动物
        2.1.4 实验仪器
        2.1.5 生物信息学软件
    2.2 方法
        2.2.1 引物设计
        2.2.2 核酸提取
        2.2.3 全基因扩增及测序
        2.2.4 冠状病毒 S1 结构域表达及 Western Blot 分析
        2.2.5 病毒分离
        2.2.6 轮状病毒 TCID50测定
        2.2.7 病毒粒子电镜观察
        2.2.8 病毒核酸电泳
        2.2.9 轮状病毒动物试验
        2.2.10 生物信息分析
    2.3 结果
        2.3.1 蝙蝠肝炎病毒(Bat hepatitis virus, BtHV)鉴定结果
        2.3.2 蝙蝠 SARS 样冠状病毒鉴定结果
        2.3.3 蝙蝠轮状病毒鉴定结果
    2.4 讨论
结论
参考文献
附录
    溶液配制
    附表
文献综述——蝙蝠与蝙蝠病毒
    参考文献
代表性论著
个人简介
导师简介
致谢



本文编号：3895713