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H5N1和H5N8亚型HPAI病毒的时空分布及长距离传播特征研究

发布时间:2024-06-28 04:02
  禽流感(Avian Influenza)是指由禽流感病毒引起的禽类的一种综合症。其病原根据致死性的强弱分为高致病性禽流感病毒和低致病性禽流感病毒。近年来,高致病性禽流感病毒因出现跨种间传播、高致死性等特点而受到人们的广泛关注。其中H5亚型是较早发现,分布广泛的高致病亚型。而对于禽流感病毒的远距离传播,迁徙候鸟的作用备受质疑。研究H5亚型高致病性禽流感病毒的暴发、传播和未来发展趋势,对野生鸟类疫情的防控具有重要意义。本研究首先从整体上对近年来高致病性禽流感病毒H5N1和H5N8亚型的暴发及进化规律进行了初步统计分析。再利用MaxEnt模型分别对H5N1和H5N8亚型高致病性禽流感毒株的当前及未来空间适宜性分布进行了预测。最后对我国目前以野生鸟类为保护对象的自然保护区所呈现出来的疾病压力情况进行了探讨。具体研究结果如下:(1)世界范围内高致病性禽流感H5N1发生过两次大的暴发,分别在2006年及2016年前后,暴发次数有减弱现象;而H5N8禽流感病毒主要的暴发时间在2016至2017年间,暴发次数有增强的趋势,而亚洲为两次禽流感暴发的中心地区。(2)预测模型中可见高致病性禽流感H5N1亚型...

【文章页数】:230 页

【学位级别】:博士

【文章目录】:
摘要
Abstract
1 绪论
    1.1 引言
    1.2 H5N1的概述
        1.2.1 H5N1的结构
        1.2.2 H5N1的危害和特征
    1.3 H5N8的概述
    1.4 最大熵模型(MAXENT)的应用
    1.5 Logistic回归模型的应用
    1.6 系统发育分析方法的简介
    1.7 地理信息系统(GIS)的简介
    1.8 全球鸟类迁徙路线的分布
    1.9 本课题的立题背景与主要研究内容
2 H5亚型禽流感病毒的暴发规律、进化模式及其在遗传上的地理传播路径分析
    2.1 引言
    2.2 实验数据和方法
        2.2.1 禽流感暴发数据的收集
        2.2.2 禽流感暴发趋势分析
        2.2.3 病毒HA蛋白序列的收集
        2.2.4 病毒HA蛋白序列的进化分析
    2.3 实验结果
        2.3.1 H5N1亚型高致病性禽流感在不同国家暴发数量统计
        2.3.2 H5N1亚型高致病性禽流感暴发的时间与变化规律
        2.3.3 H5N1亚型高致病性禽流感病毒进化关系
        2.3.4 H5N8亚型高致病性禽流感在不同国家暴发数量统计
        2.3.5 H5N8亚型高致病性禽流感暴发的时间与变化规律
        2.3.6 H5N8亚型高致病性禽流感病毒进化关系
    2.4 本章讨论
        2.4.1 通过H5N1病毒基因进化关系推测与其关联的鸟类迁徙路线
        2.4.2 通过H5N8病毒基因进化关系推测与其关联的鸟类迁徙路线
        2.4.3 H5亚型高致病性禽流感病毒的暴发与传播规律
    2.5 本章小结
3 HPAI-H5N1在不同环境因子组合条件下的空间分布比较和环境因子影响分析
    3.1 引言
    3.2 实验材料与方法
        3.2.1 实验材料
        3.2.2 实验方法
    3.3 实验结果
        3.3.1 环境气候因子的筛选及适生区评价
        3.3.2 家禽对当前全球范围内H5N1适生区分布预测的影响(第一组分组)
        3.3.3 未来全球范围内H5N1适生区分布的预测(第二组分组)
        3.3.4 适宜性区域质心移动趋势分析
    3.4 本章讨论
    3.5 本章小结
4 HPAI-H5N8在不同环境因子组合条件下的空间分布比较和环境因子影响分析
    4.1 引言
    4.2 实验材料及方法
        4.2.1 实验材料
        4.2.2 实验方法
    4.3 实验结果
        4.3.1 重要环境气候变量的筛选
        4.3.2 当前全球范围内H5N8适生区的分布预测(第一组分组)
        4.3.3 未来全球范围内H5N8适生区的分布预测(第二组分组)
    4.4 本章讨论
    4.5 本章小结
5 在人类足迹影响下野鸟感染HPAI-H5N1和HPAI-H5N8的风险区域分布
    5.1 引言
    5.2 实验材料和方法
        5.2.1 实验数据的收集和处理
        5.2.2 实验步骤
    5.3 实验结果
        5.3.1 重要环境气候变量的筛选
        5.3.2 存在人类足迹等变量条件下HPAI-H5N1的适宜性区域分布预测
        5.3.3 人类足迹等变量条件下野鸟HPAI-H5N8的适宜性区域分布预测
    5.4 本章讨论
    5.5 本章小结
6 HPAI-H5N1和HPAI-H5N8亚型在我国以鸟类为保护对象的自然保护区的分布体现
    6.1 引言
    6.2 实验原理和方法
        6.2.1 实验原理
        6.2.2 实验方法
    6.3 实验结果
        6.3.1 野生鸟类暴发H5N1和H5N8亚型禽流感与全球湿地分布的关系
        6.3.2 HPAI-H5N1亚型毒株引发野鸟死亡的热点地区分析
        6.3.3 334个自然保护区目前可能受到HPAIV-H5N1影响的情况
        6.3.4 野生鸟类感染HPAIV-H5N8亚型毒株的时间变化趋势分析
        6.3.5 同时对两种亚型毒株表现出适生性的自然保护区分析
    6.4 本章讨论
    6.5 本章小结
结论
参考文献
附录
攻读学位期间发表的学术论文
致谢



本文编号:3996407

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