新疆部分地区牛病毒性腹泻的流行病学调查
发布时间:2024-04-14 23:55
为调查新疆部分地区规模化牛养殖场牛病毒(BVDV)性腹泻病毒的感染情况,本试验采用RT-PCR方法对640份牛全血进行牛病毒性腹泻病毒检测,并对检测基因序列进行分析及同源性比较。结果表明:各地区牛养殖场BVDV阳性检出率为22.5%~62.5%,平均总阳性率为40.0%(256/640),不同年龄段牛群感染BVDV的平均阳性率为22.5%(27/120)。将目的片段克隆至T载体,经测序获得5株BVDV部分基因序列,与预期的大小一致为288 bp。根据同源性分析表明,本研究的5株克隆毒株序列之间的同源性为98.3%~99.7%。遗传演化分析可知,本研究获得的毒株在同一簇,与中国北京株BVDV1a亚型归为同一簇,亲缘关系比较接近,但与BVDV2型、BVDV3型的遗传关系较远。研究结果表明,新疆地区BVDV普遍存在,经测序核苷酸序列之间的同源性较高,遗传关系较接近,该结果为新疆地区牛病毒性腹泻病毒病的防控工作奠定基础。
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【部分图文】:
本文编号:3955420
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图2BVDV病原生态学地区分布
2期王龙等:新疆部分地区牛病毒性腹泻病毒的分离、鉴定及分子流行病学调查2.3BVDV病原生态学地区分布通过绘制BVDV的病原生态学地区分布图可知,五家渠、沙湾、奇台、伊犁地区、阿克苏地区、喀什地区、克拉玛依市主要为BVDVⅠ型未知亚型,石河子市周边为BVDV型未知亚型、BVDV1....
图1BVDV的PCR检测结果
对采集的13个地区规模化养牛场640份牛全血样品进行基因检测,凝胶电泳结果表明,阳性条带大小与预期目的片段大小一致(288bp),结果见图1。此次研究共检测出BVDV阳性样品256份,平均总阳性率为40.0%(256/640)。各地区均检测到BVDV的存在,检出率为22.5%~....
图2BVDV核苷酸序列的同源性分析
测序结果表明,样品基因片段大小为288bp。运用DNAMan、MegAlign软件和NCBI,将本研究得到的5株BVDV核苷酸序列与国内外17株BVDV基因序列进行同源性比较,发现获得的5株BVDV核苷酸序列之间有较高的同源性为98.3%~99.7%,其中ChangJ-12和K....
图3BVDV核苷酸序列的遗传进化树
运用MEGA6.0软件将本研究所获得的5株BVDV基因核苷酸序列与国内外17株BVDV基因序列共同建立遗传进化树,见图3。根据遗传演化分析可知,本研究获得的ChangJ-12、KT-02、SHZ-06、ALT-05、AKS-2处在同一分支,与中国株BVDV1a亚型归为同一簇,....
本文编号:3955420
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