鸡蛋用性状相关拷贝数变异位点筛选及作用机理研究

发布时间：2024-05-27 01:29

　　鸡作为重要的经济动物,为人类提供鸡蛋和鸡肉等优质动物性食品。鸡的蛋用性状包括产蛋性能和蛋品质,属于数量性状,由微效多基因控制。利用SNP芯片的方法进行全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWS)找到大量与蛋用性状关联的SNPs;然而一些SNPs在应用上并不能维持良好的重复性,即应用到其它群体或世代中重复不出所期望的效果。近年的研究发现CNV与SNP对基因组中遗传变异的解释是互补的。CNV属于结构变异,相比于碱基突变的遗传效应,结构变异属于DNA序列的变异,遗传效应更大,因此CNV作为一种新型的分子标记对蛋鸡育种具有重要意义。本研究的目的是在鸡基因组中筛选与蛋用性状相关的CNVs并进一步研究其对蛋用性状的影响机理。根据鸡蛋用性状相关数量性状基因座(quantitative trait loci,QTLs)与已发表的CNV图谱选择候选CNVs位点,然后检测其拷贝数变化,通过关联分析鉴定影响鸡蛋用性状的CNVs,解释这些CNVs对鸡产蛋过程的影响,主要研究结果如下:(1)结合已发表的鸡CNV图谱及鸡QTL数据库选择候选位点,每个位点设计两个探针进行拷...

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本文编号：3982579