猪ARID5B基因多态性及其与脂肪沉积性状的相关性分析

发布时间：2024-05-27 19:39

　　为探究猪ARID5B基因多态性及其与脂肪沉积性状的相关性,在DNA水平上对藏猪、大白猪ARID5B(AT-rich interaction domain 5B)基因5′侧翼区进行了单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点筛选;在mRNA水平上对两猪种的肝脏、背脂和背最长肌组织中的ARID5B基因表达量进行了RT-qPCR检测;并对两猪种的背膘厚和背最长肌组织中IMF(Intramuscular fat)含量进行测定。结果表明:在ARID5B基因5’侧翼区,存在T-2 216C和In-2 029Del缺失2个连锁突变位点,藏猪与大白猪呈极显著差异(P<0.01);在相同组织不同品种间,ARID5B基因在肝脏、背脂和背最长肌中mRNA相对表达量趋势完全一致,且藏猪ARID5B基因表达量均极显著低于大白猪(P<0.01);藏猪背膘厚和IMF含量均极显著高于大白猪(P<0.01);经DNA、mRNA水平、背膘厚和IMF含量相关性分析发现,ARID5B基因mRNA相对表达量与背膘厚和IMF含量呈显著负相关(P<0.05)。

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【部分图文】：

图1ARID5B基因突变位点测序峰图

在5′侧翼区共发现2个多态性位点（图1），其中在该基因起始密码子上游2216bp位置发现T/C突变，记为T-2216C（图1(a））；在起始密码子上游第2029～2036bp的8个碱基（ATTTATTT）的插入/缺失突变，记为In-2029Del（图1(b））。在藏猪（....

图2ARID5B基因在TP和LW两个品种猪背脂、背最长肌和肝脏中mRNA的相对表达量

由表5可知，180日龄藏猪、大白猪背最长肌IMF含量分别为4.11%和2.28%，藏猪IMF含量极显著高于大白猪（P<0.01）。2.6ARID5B基因表达量与背膘厚和IMF含量相关性分析

本文编号：3983013