地方品种鸡ALV-J的分离鉴定及全基因组序列分析

发布时间：2024-10-04 20:41

　　 为研究扬州地方品种苏禽绿壳蛋鸡中禽白血病病毒(ALV)的来源及其变异趋势,本研究从扬州某规模化种鸡场病鸡中分离到多株病毒,并测定了1株ALV-J(JS18YZ09)的全基因组序列,对该全基因组序列进行比对分析,结果显示,分离株全基因组序列与2009年江苏地区蛋鸡分离株JS09GY3同源性最高,为93.7%,但其5'LTR和3'UTR区变异较大。其env基因则与2013年广东肉鸡分离株GD13GZ同源性最高。JS18YZ09株5'LTR序列含有多至6个潜在转录因子结合位点C/EBPalp,同时U3区有11 bp的缺失,在其3'UTR的rTM区存在175 bp的缺失。综合5'LTR,env和3'UTR区序列特征,推测引起本次地方品种苏禽绿壳蛋种鸡禽白血病的ALV-J很可能来源于江苏地区蛋鸡分离株JS09GY3,但其可能已经与广东地区株GD13GZ株发生了重组,且有新的变异趋势。本实验对苏禽绿壳蛋鸡ALV分子流行病学的分析研究丰富了ALV的生物信息数据库。

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 主要实验材料
    1.2 病毒分离与检测
    1.3 引物设计及合成
    1.4 病毒亚群鉴定与测序
    1.5 全基因组序列分析
2 结果
    2.1 病毒分离鉴定结果
    2.2 ALV-J分离株全基因组分析
    2.3 ALV-J分离株5'LTR基因序列分析
    2.4 ALV-J分离株env基因序列分析
    2.5 ALV-J分离株3'UTR基因序列分析
3 讨论



本文编号：4007126