猪不同骨骼肌长链非编码RNA的鉴定及其功能分析

发布时间：2024-12-18 06:21

　　猪骨骼肌是一种高度异质性的组织类型,其中背最长肌和腰大肌作为猪最具经济价值且生理代谢迥异的两种骨骼肌,一直是猪分子育种改良的研究重点。长链非编码RNA (long non-coding RNA, lncRNA),尤其是环状RNA (circular RNA, circRNA)作为继microRNA之后调控性非编码RNA的重要新成员,已成为生命科学研究的前沿热点。然而相对于人和模式动物,猪lncRNA(包括circRNA)的鉴定和功能研究相当滞后。本研究利用RNA-seq技术对猪背最长肌(LDM)和腰大肌(PMM)进行了转录组测序,并结合自行建立的生物信息学鉴定流程,对各测序文库中的mRNA、lncRNA以及circRNA进行了分选鉴定以及深度分析,主要结果如下：(1)猪LDM的肌纤维横截面积(2.82×103μm2)显著大于PMM肌纤维横截面积(1.91 × 103μm2)(P<0.05)。(2)猪LDM组织中Ⅱb型肌纤维(MyHC4,快速酵解型)的比例极显著的高于PMM组织(P<0.001),而PMM组织中I型肌纤维(MyHC7,慢速氧化型)的含量极显著高于LDM(P<...

【文章页数】：183 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

图１－１?ＩｎｃＲＮＡ介导的染色质修饰模式图［８３］??Ｆｉｇ．?１－１?ＩｎｃＲＮＡ－ｍｅｄｉａｔｅｄ?ｃｈｒｏｍａｔｉｎ?ｍｏｄｉｆｉｃａｔｉｏｎ??

Ｈ?ｅｔｅｒｏｃ?ｈｒｏｍ?ａｔｉ?ｎ??图１－１?ＩｎｃＲＮＡ介导的染色质修饰模式图［８３］??Ｆｉｇ．?１－１?ＩｎｃＲＮＡ－ｍｅｄｉａｔｅｄ?ｃｈｒｏｍａｔｉｎ?ｍｏｄｉｆｉｃａｔｉｏ因印迹现象??参与介导了基因印迹现象。高等动物基

图１－７各种ＩｎｃＲＮＡ研巧方法的建立时间??Ｆｉ．?１－７?Ｔｈｅ?ｃｒｅａｔｉｏｎ?ｔｉｍｅ?ｏｆ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ?ｍｅ化ｏｄｓ?ｆｏｒ?化ｅ?ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?ＩｎｃＲＮＡ??

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图４－２不同骨骼肌肌纤维分型结果??

注：图中数据为Ｍｅｗ?±犯，检验方法为／－检验，＊＊表示尸＜０．００１。??Ｎｏ化：Ａｌｌ?ｖａｌｕｅｓ?ｗｅ化?Ｍｅａｎ?±?ＳＤ；?Ｓｔｕｄｅｎｔ?Ｍｅｓｔ，＊＊?ｉｎｄｉｃａｔｅ?尸?＜?０．００１．??不同骨骼肌姐织的肌纤维分型结果显示（图４－２），腰大肌（ＰＭＭ）中Ｉ型....

图４－３不同骨骼肌肌中氧化、酵解酶基因表达水平Ｌ：Ａ及线粒体拷贝数??

Ｎｏｔｅ：?Ａｌｌ?ｖａｌｕｅｓ?ｗｅｒｅ?Ｍｅａｎ?±?ＳＤ；?ｓｔｕｄｅｎｔ?Ｍｅｓｔ，?＊ｉｎｄｉｃａｔｅ?Ｐ?＜?０．０５，＊＊?ｉｎｄｉｃａｔｅ?Ｐ?＜?０．００１．??不同骨骼肌中氧化代谢关键酶和酵解代谢关键酶化公仕４）基因的??巧光定量结果显示（图４－３Ａ），季Ｌ酸....

本文编号：4017064