miR-122和miR-449a在草原红牛睾丸组织不同发育阶段的表达规律及其功能
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【摘要】:本研究以中国草原红牛为研究对象,采用实时荧光定量PCR方法检测了miR-122、miR-185、miR-146b、miR-140、miR-449a、miR-204、miR-375、miR-221在草原红牛不同发育时期睾丸组织和以及其他组织中的表达差异,筛选出在睾丸中特异表达或倾向表达的miRNA,并通过预测软件对选择对miRNA进行靶基因预测,构建双荧光素酶报告载体。初步阐明这8个miRNAs调控睾丸发育的分子机制,为中国草原红牛公牛发育的遗传机理和在肉牛生产中进行分子育种提供了理论基础。本研究主要结果如下:通过对miR-122、miR-185、miR-146b、miR-140、miR-449a、miR-204、miR-375、miR-221草原红牛不同组织中相对表达量水平分析,它们在各组织中有不同程度的表达,其中mir-122和mir-449a在草原红牛睾丸中相对表达量较高,miR-122、miR-449a在睾丸中具有倾向性表达的特点,而且miR-122在睾丸中的表达量与其它组织相比差异极其显著。这8个miRNA在在不同发育阶段牛睾丸组织中的相对表达量差异显著,miR-221和miR-204在初生牛中相对表达量最高,miR-140和miR-185在12月龄睾丸中表达量最高,miR-449a、miR-375、miR-146b和miR-122在24月龄睾丸中相对表达量最高。这8个miRNA的荧光定量结果与课题组前期出生公牛和24月龄公牛solexa高通量测序结果一致,miR-146b、miR-449a、miR-375和miR-122表达上调,miR-185、miR—140、miR-204和miR-221表达下调。通过软件预测miR-122可能的靶基因有MAF1、PDK4、DUSP4、FUT8、PRKRA,miR-449a可能的靶基因FKBP1B,3'UTR区进行扩增,插入到PGL3-control载体构建构建双荧光素酶报告载体,与pre-mir共同转入牛脂肪细胞中,通过多功能酶标仪检测荧光素酶活性。结果验证,DUSP4和FKBP1B可能分别是是miR-122和miR-449a的靶基因。本研究分析了miRNAs在不同发育阶段睾丸组织及其他组织中的表达差异,预测了睾丸组织中高表达mir-122和mir-449a的靶基因,并进行了体外验证,为以后研究miRNA对肉牛生殖器官的发育及生殖活动的调控机理具有重要作用。
【关键词】:草原红牛 睾丸组织 miR-122 miR-449a DUSP4 FKBP1B
【学位授予单位】:吉林农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:S823
【目录】:
- 摘要3-4
- Abstract4-8
- 第一篇 文献综述8-17
- 第一章 miRNA的研究进展概述8-14
- 1.1 miRNA概述8
- 1.2 miRNA生物合成8-9
- 1.3 miRNA的作用机制9
- 1.4 miRNA的表达检测9-12
- 1.5 miRNA靶基因的预测12-13
- 1.6 miRNA靶基因的验证13-14
- 第二章 雄性哺乳动物的繁殖机制14-17
- 2.1 精子发生过程14
- 2.2 miRNAs与精子发生的关系14-15
- 2.3 睾丸组织中miRNAs的表达15-16
- 2.4 本研究的目的和意义16-17
- 第二篇 研究内容17-46
- 第一章 材料与方法17-29
- 1.1. 实验材料17-19
- 1.2. 试验方法19-29
- 第二章 结果29-41
- 2.1 mi RNAs在不同组织中的表达规律分析29-31
- 2.2 mi RNAs在不同发育阶段牛睾丸中表达规律分析31-35
- 2.3 miR-122和miR-449a的靶基因验证35-41
- 第三章 讨论41-46
- 3.1 生物信息对miRNA靶基因的预测41
- 3.2 关于本实验靶基因的预测41
- 3.3 miR-122和miR-449a在牛睾丸组织中的调控靶基因的机制41-43
- 3.4 miR-122调控睾丸组织的功能43
- 3.5 miR-449a调控睾丸组织的功能43-44
- 3.6 关于引物的设计44
- 3.7 关于载体构建44-45
- 3.8 不足之处45-46
- 结论46-47
- 参考文献47-52
- 作者简介52-53
- 致谢53
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