猪传染性胃肠炎病毒分离株JS2012全基因组序列分析

发布时间：2017-06-20 15:02

  本文关键词：猪传染性胃肠炎病毒分离株JS2012全基因组序列分析，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：设计32对PCR引物分片段扩增猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)江苏分离株JS2012全基因组,扩增产物克隆到p MD19-T载体并测序。用DNAstar软件将JS2012全基因组序列与Gen Bank中其他13株TGEV株和猪呼吸道冠状病毒(PRCV-ISU-1)序列进行比对以及同源性分析,并绘制基因进化树。JS2012基因组序列全长28 542 bp,不包括poly A。基因组的排列为TGEV典型的基因排列序:5'-ORF1a-ORF1b-S-3a-3b-E-M-N-7-3'。TGEV JS2012株的ORF3基因和Miller组病毒一样有2个大片段的缺失。JS2012的S基因和Miller M6以及Virulent Purdue 2个强毒株有同样的序列特征。除Virulent Purdue外,其余Purdue株在1 123~1 128 bp处均有6 bp的缺失,JS2012与所有Miller株及Virulent Purdue一样,此处没有缺失。JS2012与其他TGEV毒株之间的碱基序列同源性为98.6%~99.9%,与Miller M6的碱基序列同源性最高,亲缘关系最近,同属于Miller组,与Purdue组相对较远。
【作者单位】： 江苏省农业科学院兽医研究所/农业部兽用生物制品工程技术重点实验室/国家兽用生物制品工程技术研究中心;
【关键词】： 猪传染性胃肠炎病毒(TGEV) 全基因组 序列分析
【基金】：江苏省农业科技自主创新基金项目(CX(15)1056)
【分类号】：S858.28
【正文快照】： 猪传染性胃肠炎病毒(Transmissible gastroenter-itis virus,TGEV)属于冠状病毒科(Coronaviridae)冠状病毒属(Coronavirus),引起猪急性、高度接触性传染性胃肠炎(Transmissible gastroenteritis,TGE),不同品种和年龄的猪均易感染,2周龄以下仔猪主要症状为呕吐、严重腹泻、脱水

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本文编号：465959