宁都黄鸡BMP15、INHA基因多态性与生长、繁殖性状的关联分析

发布时间：2017-06-28 09:03

  本文关键词：宁都黄鸡BMP15、INHA基因多态性与生长、繁殖性状的关联分析，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：宁都黄鸡是江西省地方优质肉用型鸡种,具有性成熟时间早、肉质鲜嫩等特点。性早熟是由多基因控制的一个复杂性状,为了探索宁都黄鸡早熟性分子调控机制并发现控制早熟性的主效基因,或者与之紧密连锁的分子标记。本研究以纯种宁都黄鸡母鸡两个批次群体共195个样本为试验材料,测定其生长和繁殖性能指标,并进行各性状相关性分析;以骨形态发生蛋白15(BMP15)基因和抑制素α(INHA)基因为候选基因,采用直接测序法对宁都黄鸡BMP15基因两外显子区域和INHA整个基因进行序列扫描,筛选SNP,并与生长和繁殖性状进行相关性分析,主要结果如下:1.不同日龄生长性状之间的相关性多数均达到了显著水平,说明宁都黄鸡生长发育状况良好,符合正常营养水平下的生长规律,宁都黄鸡育成期体重越大,开产日龄越早;开产日龄越晚,开产蛋重就越大。2.通过对BMP15基因外显子及两侧翼序列测序,共发现12个SNP突变位点,其中4个为错义突变(c.34CT突变使亮氨酸变成苯丙氨酸,c.473GA突变使精氨酸变成组氨酸,c.656TC突变使亮氨酸变成脯氨酸,c.709GA突变使甘氨酸变成丝氨酸),c.473GA和c.656TC为新发现位点。在INHA基因中共搜寻到突变位点21个,均为SNP。其中1个为错义突变(c.619CT突变使精氨酸变成半胱氨酸)。3.BMP15基因12个SNP与宁都黄鸡两批次群体生长、繁殖性状关联分析,结果表明,存在多个与生长性状显著相关的突变位点,说明BMP15基因与动物机体的生长发育有紧密联系,c.633CT与开产冠高、开产冠长和开产体重极显著或显著相关,但未发现与性早熟紧密关联的突变位点。4.INHA基因内c.240TC(Exon1)、g.816TC(Intron1)和外显子2共10个SNP与宁都黄鸡两批次群体生长、繁殖性状关联分析。结果显示,存在多个与生长性状显著相关的突变位点,说明INHA基因与动物机体的生长发育有紧密联系,其中c.849CT与出雏体重、开产日龄/体重/冠高/胫长、70日龄体重、98日龄体重/冠高/冠长显著或极显著相关,但未发现与性早熟紧密关联的突变位点。
【关键词】：宁都黄鸡 BMP15基因 INHA基因 SNP 生长性状 繁殖性状
【学位授予单位】：江西农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S831
【目录】：

• 摘要6-7
• Abstract7-8
• 第一章 文献综述8-15
• 1.1 宁都黄鸡概述8-9
• 1.1.1 宁都黄鸡的生长及屠体性能8-9
• 1.1.2 宁都黄鸡的繁殖特性9
• 1.2 性成熟的影响因素9-11
• 1.2.1 环境因素9-10
• 1.2.2 营养因素10
• 1.2.3 遗传因素10-11
• 1.3 遗传标记11
• 1.4 BMP15和INHA基因概述11-14
• 1.4.1 BMP15基因概述13
• 1.4.2 INHA基因概述13-14
• 1.5 本实验的研究内容和意义14-15
• 第二章 宁都黄鸡生长和繁殖性状相关性分析15-21
• 2.1 材料和方法15
• 2.1.1 试验材料15
• 2.1.2 试验方法15
• 2.2 结果与分析15-19
• 2.2.1 表型性状简单统计分析15-16
• 2.2.2 表型性状相关性分析16-19
• 2.3 讨论19
• 2.3.1 宁都黄鸡生长和繁殖性状数据分析19
• 2.3.2 宁都黄鸡生长和繁殖性状相关性分析19
• 2.4 小结19-21
• 第三章 宁都黄鸡BMP15基因多态性与生长、繁殖性状关联性分析21-34
• 3.1 材料和方法21-25
• 3.1.1 试验材料21-22
• 3.1.1.1 试验主要仪器21
• 3.1.1.3 试验主要试剂21
• 3.1.1.4 试剂配制21-22
• 3.1.2 试验方法22-25
• 3.1.2.1 表型性状测定22
• 3.1.2.2 血样采集与基因组DNA的提取22
• 3.1.2.3 引物的设计与合成22
• 3.1.2.4 PCR扩增体系及产物检测22-23
• 3.1.2.5 宁都黄鸡BMP15基因遗传多态性分析23-24
• 3.1.2.6 数据统计分析24-25
• 3.2 试验结果分析25-32
• 3.2.1 SNPs筛选25
• 3.2.2 BMP15基因多态位点群体遗传学分析25-27
• 3.2.3 BMP15基因多态性与宁都黄鸡生长、繁殖性状的关联分析27-32
• 3.3 讨论32-33
• 3.3.1 BMP15基因遗传多样性分析32
• 3.3.2 BMP15基因与宁都黄鸡生长、繁殖性状的关联分析32-33
• 3.4 小结33-34
• 第四章 宁都黄鸡INHA基因多态性与生长、繁殖性状关联性分析34-44
• 4.1 材料和方法34-35
• 4.1.1 试验材料34
• 4.1.2 试验方法34-35
• 4.1.2.1 表型性状测定34
• 4.1.2.2 血样采集与基因组DNA的提取34
• 4.1.2.3 引物的设计与合成34
• 4.1.2.4 PCR扩增体系及产物检测34
• 4.1.2.5 宁都黄鸡INHA基因遗传多态性分析34-35
• 4.1.2.6 数据统计分析35
• 4.2 试验结果及分析35-42
• 4.2.1 SNPs筛选35-36
• 4.2.2 INHA 基因在宁都黄鸡群体中的变异位点多态性的检测36-37
• 4.2.3 INHA基因多态位点群体遗传学分析37-39
• 4.2.4 INHA基因多态性与宁都黄鸡生长、繁殖性状的关联分析39-42
• 4.3 讨论42-43
• 4.3.1 INHA 基因多态位点鉴别和基本统计分析42
• 4.3.2 INHA基因与宁都黄鸡生长、繁殖性状的关联分析42-43
• 4.4 小结43-44
• 第五章 全文总结44-45
• 参考文献45-50
• 致谢50

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本文编号：493232