梅花鹿致敏与休眠鹿茸干细胞差异蛋白表达的2D-DIGE分析

发布时间：2017-07-01 23:14

  本文关键词：梅花鹿致敏与休眠鹿茸干细胞差异蛋白表达的2D-DIGE分析，，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：旨在对梅花鹿(Cervus nippon)致敏鹿茸干细胞与休眠鹿茸干细胞表达蛋白进行差异筛选、鉴定及生物信息分析,为深入探讨鹿茸独特的再生分子调节机制奠定基础。本研究采用双向荧光差异凝胶电泳(Two-dimensional fluorescence difference in gel electrophoresis,2D-DIGE)分离蛋白样品;利用DeCyder 7.2分析软件对2D-DIGE图像进行统计学分析寻找差异表达蛋白;利用MALDI-TOF-MS(Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight tandem mass spectrometry)鉴定差异蛋白,通过Mascot软件搜索NCBInr数据库寻找匹配的蛋白;采用PANTHER(Protein Analysis Through Evolutionary Relationships)软件对差异蛋白进行聚类分析,REACTOME数据库分析差异蛋白所参与的信号通路。结果得到了致敏鹿茸干细胞与休眠鹿茸干细胞2D-DIGE图谱,致敏鹿茸干细胞与休眠鹿茸干细胞蛋白丰度相比较,比值≥1.1倍以及比值≤-1.1倍(P0.05)的差异蛋白点有159个,其中110个上调表达,49个下调表达,EDA(Extended data analysis)分析得到了多个Marker蛋白,质谱鉴定了84个差异蛋白质点,48个为阳性结果,共来自27种蛋白质。并对已鉴定蛋白进行了GO分析以及信号通路富集分析。致敏鹿茸干细胞与休眠鹿茸干细胞蛋白差异明显,质谱鉴定获得了来自多种可能与鹿茸再生相关的差异蛋白。由此可知,鹿茸再生是鹿茸干细胞从休眠到致敏的转化过程,需要多种蛋白分子以及信号通路的综合调控。
【作者单位】： 中国农业科学院特产研究所特种动物分子生物学国家重点实验室;
【关键词】： 鹿茸干细胞 再生 蛋白质组学 D-DIGE
【基金】：国家高技术研究发展计划(863)项目(2011AA100603) 国家自然科学基金项目(31170950) 吉林省重点科技攻关项目(20150204071NY) 吉林省自然科学基金项目(20140101139JC)
【分类号】：S825
【正文快照】： 近年来,再生生物学尤其是割处再生(Epimor-phic regeneration)是生命科学研究的重点领域,鹿茸是迄今为止所发现的唯一一个可以割处完全再生的哺乳动物附属器官。以鹿茸为模型深入研究其独特再生分子调节机制对于揭开哺乳动物器官再生之谜具有重要意义[1]。鹿茸是以年为周期而

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本文编号：507843