猪FUT1基因启动子区的确定及活性分析

发布时间：2017-07-29 04:20

  本文关键词：猪FUT1基因启动子区的确定及活性分析

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【摘要】：F18大肠杆菌(Escherichia coli F18,E.coli F18)是养猪(Sus scrofa)业中发生最普遍、危害最大的病原菌之一,球系列鞘糖脂生物合成通路及通路中α-(1,2)岩藻糖转移酶1基因(alpha(1,2)fucose transferase 1,FUT1)对断奶仔猪F18抗性具有重要调控作用。本研究运用生物信息学技术挖掘课题组前期获得的断奶仔猪转录组测序结果,确定FUT1基因的转录起始位点和启动子区。同时对启动子区序列进行Cp G岛分析;采用双荧光素酶报告基因以及Ali Baba 2.0软件,分别分析启动子区活性和Cp G岛序列潜在的转录结合位点。通过比对人类(Homo sapiens)和猪的基因序列信息数据库,结果表明,FUT1基因转录起始区域具有5种可变剪接(AS-1,AS-2,AS-3,AS-4和AS-5)和2个启动子区域(启动子1和启动子2);双荧光素酶报告基因检测结果进一步显示,FUT1基因启动子2的转录活性极显著高于启动子1的转录活性(P0.01),启动子2的活性是启动子1的2.75倍,根据结果可以推测启动子2在转录过程中起主导作用;Cp G岛分析显示,猪FUT1基因启动子1和启动子2分别存在一个Cp G岛。FUT1启动子1扩增片转录因子预测分析表明,FUT1基因启动子1存在20个潜在的转录因子结合位点,并且Sp1出现在多个转录结合位点处。本研究结果为猪FUT1基因的甲基化检测和调控机制分析提供一定的基础和依据。
【作者单位】： 扬州大学动物科学与技术学院/江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室;扬州大学兽医学院;
【关键词】： 猪 α-( )岩藻糖转移酶基因(FUT) 启动子区 CpG岛
【基金】：国家自然科学基金(No.31372285和No.31172183) 转基因生物新品种培育科技重大专项(No.2014ZX08006-001B) 江苏省高校自然科学研究重大项目(No.14KJA230003) 江苏高校优势学科建设工程资助项目(PAPD)
【分类号】：S828
【正文快照】： 目前断奶仔猪(Sus scrofa)腹泻对规模化猪场2013;Christensen et al.,2004)。大量研究表明,启造成严重的危害,而产肠毒素大肠杆菌(enterotoxi-动子区Cp G岛的甲基化对基因的表达具有重要调genic Escherichia coli,ETEC)是引起断奶仔猪腹泻控作用,主要是通过影响染色质结构、DN

【参考文献】

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本文编号：587471