影响饲料转化率的多基因调控区多态性分析

发布时间：2017-08-06 10:05

  本文关键词：影响饲料转化率的多基因调控区多态性分析

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【摘要】：鸡小肠上皮细胞中一些营养转运基因和生长因子的表达变化会影响肠道对饲料中营养的吸收能力,导致个体间体重、饲料转化率等生产性状的差异。为了研究营养转运基因及生长因子调控区不同的单核苷酸多态位点导致的基因表达差异及对相关生产性状的影响,本试验对黄羽肉鸡群体中10种氨基酸转运蛋白基因(rBAT、B0+AT、EAAT3、 y+LAT1、y+LAT2、B0AT1、CAT1、CAT2、SLC22A3、LAT1)1种糖转运蛋白基因(SGLT1)和1种生长因子基因(FGF1)上游调控区1000bp内的多态性位点进行了筛查并与鸡饲料利用率性状进行了关联鉴定。试验群体来自两个没有遗传关联背景的品系(N202、N301)共724只黄羽肉鸡。试验通过测序在12个基因上游1000bp内发现了108个明显的SNP位点,利用双尾检验法筛查到可能与饲料转化率相关的SNP位点共7个,分别是B0AT1上游T-834C、SGLT1上游G-490A、rBAT上游T-761G G-713A T-658C G-568T、FGF1上游T-899C。为进一步研究它们与饲料转化率的关联性,试验在两功能类基因中各选取了一个基因(B0AT1、FGF1)作为研究对象在两个鸡群中验证不同基因型与饲料利用率性状的关联,通过片段分析法对B0AT1上游T-834C、FGF1上游T-899C进行了检测及分型,最后采用一般线性模型分析不同基因型对两个品系饲料利用率性状的影响。结果表明B0AT1上游T-834C在N301群体中符合Hardy-Weinberg平衡,并且此位点在该群体与FCR存在极显著相关(P0.01),TC型个体饲料利用率极显著高于TT型和CC型(P0.01),显示出杂种优势,T-834C位点在N202群体中不符合Hardy-Weinberg平衡且与FCR相关性较低(P0.05),但C基因对体重存在一定的基因效应;FGF1上游T-899C位点在两个群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态,在N301群体中,此位点与FCR有显著相关(P0.05),CC基因型比TC基因型有着更低的FCR(P0.05)。但在N202群体中,此SNP位点与FCR相关性较低(P0.05)。本次试验在两个鸡群体中对多个功能基因上游调控区SNP位点进行了筛查并对其影响调控表达的机理进行了细致的研究,并就一些位点对生产性状的影响进行了分析讨论。
【关键词】：肉鸡 营养转运 生长因子 饲料转化率 转录因子
【学位授予单位】：山西农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S831
【目录】：

• 摘要7-8
• 第一章 前言8-17
• 1.1 中国优质肉鸡发展现状8
• 1.2 鸡对营养物质的吸收利用8
• 1.3 营养转运蛋白研究进展8-13
• 1.3.1 单糖转运蛋白9-10
• 1.3.2 氨基酸养转运蛋白10-13
• 1.4 生长因子研究进展13-14
• 1.5 遗传标记及应用14-16
• 1.6 本试验的研究目的、意义及主要内容16-17
• 第二章 材料与方法17-26
• 2.1 试验材料17-19
• 2.1.1 试验对象17
• 2.1.2 试验仪器17-18
• 2.1.3 试验试剂18
• 2.1.4 常用溶液的配置18-19
• 2.1.5 常用的网址及软件19
• 2.2 试验方法19-24
• 2.2.1 SGLT1、B~0 AT1、FGF1等基因调控区SNP位点的筛查19-22
• 2.2.2 SNPs的分型22-24
• 2.3 数据统计方法24-26
• 2.3.1 双尾检验法24
• 2.3.2 基因频率和基因型频率计算24-25
• 2.3.3 Hardy-Weinberg平衡检测25
• 2.3.4 SNPs与经济性状关联分析25-26
• 第三章 试验结果与分析26-34
• 3.1 多基因调控区SNP筛查结果与分析26-30
• 3.1.1 群体的分析及样本的选择26-27
• 3.1.2 总DNA提取结果27
• 3.1.3 多基因调控区扩增结果及测序分析27-29
• 3.1.4 转录因子结合位点分析29-30
• 3.2 SNP分型结果30-31
• 3.2.1 B~0 AT1基因T-834C位点分型结果30-31
• 3.2.2 FGF1基因T-899C位点分型结果31
• 3.3 数据统计分析31-34
• 3.3.1 等位基因频率及基因型频率分析31-32
• 3.3.2 SNP位点与生产性状关联分析32-34
• 第四章 讨论34-37
• 4.1 目标位点的选择、SNPs分型及引物设计34
• 4.2 Hardy-Weinberg群体遗传平衡分析34-35
• 4.3 基因型与生产性状的关联分析讨论35-37
• 4.3.1 B~0 AT1基因T-834C基因型与生产性状关联分析讨论35-36
• 4.3.2 FGF1基因T-899C基因型与生产性状关联分析讨论36-37
• 第五章 结论37-39
• 参考文献39-45
• Abstract45-47
• 附录47-51
• 致谢51

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