藏羊GM-CSF基因的RT-PCR扩增、序列分析及蛋白结构预测

发布时间：2017-08-08 17:37

  本文关键词：藏羊GM-CSF基因的RT-PCR扩增、序列分析及蛋白结构预测

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【摘要】：为了研究藏羊GM-CSF基因及其编码蛋白的功能,提取藏羊脾脏总RNA,应用RT-PCR技术对藏羊GM-CSF基因进行扩增及测序,并利用DNA Star软件进行序列分析及编码蛋白结构预测。测试表明,藏羊GM-CSF基因长度为381 bp,编码127个氨基酸;藏羊GM-CSF基因与参考绵羊、藏羚羊、山羊和水牛的GM-CSF基因的核苷酸序列同源性依次为100%、99.2%、98.7%和92.1%,氨基酸序列同源性依次为100%、97.6%、96.9%和81.0%。蛋白结构预测表明GM-CSF蛋白具有1个N-糖基化位点、1个N-豆蔻酰化位点、1个粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子信号、2个蛋白激酶C磷酸化位点、3个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点;综合二、三级结构预测得出,该蛋白主要由α螺旋组成,其次是β转角和无规则卷曲,而β折叠相对较少。研究成果可为青海藏羊GM-CSF基因抗病功能的研究提供参考。
【作者单位】： 青海大学农牧学院省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室;
【关键词】： 藏羊 GM-CSF基因 RT-PCR 序列分析 蛋白结构预测
【基金】：青海省科技厅项目(2016-ZJ-738) 青海大学“123高层次人才培养工程”项目共同资助
【分类号】：S826
【正文快照】： RT-PCR Amplification and Sequence Analysis of GM-CSF Gene of TibetanSheep and Protein Structure PredictionZhang Xiaofen Ye Guisheng*Ma Yuhua He Xiaolong Kang Ming Han Zhihui Jia Yuening ZhangHongboCollege of Agriculture and Animal Husbandry,Qinghai Unive

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本文编号：641232