PRRSV广西分离株GXYL-1403全基因克隆与序列分析

发布时间：2017-08-15 17:04

  本文关键词：PRRSV广西分离株GXYL-1403全基因克隆与序列分析

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【摘要】：对本实验室所分离的1株猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)毒株GXYL-1403进行全基因组克隆和序列分析。参考已发表的扩增全长PRRSV序列的13对特异性引物,用RT-PCR方法对病毒基因组进行分段扩增。将扩增得到的PCR片段克隆到pMD18-T载体上,获得的重组质粒经PCR鉴定后进行序列测定。通过软件对所扩增序列进行拼接,获得GXYL-1403的全长序列,并对GXYL-1403进行比较和遗传进化分析。结果表明GXYL1403株基因序列全长为15 018bp,与国内外多株PRRSV毒株进行同源性比较发现,与VR-2332的相似性为89.1%,与TJ、JXA1、HEB1、HUB1、HUB2、TP株同源性达到了97.9%~98.1%。另外,GXYL-1403分离株nsp2蛋白含有高致病性PRRSV特异的1+29个氨基酸的缺失。特别重要的是,在缺失29个氨基酸区域的上游,含有连续20个氨基酸缺失,在下游出现了连续74个氨基酸的缺失。遗传进化分析发现美洲型PRRSV主要分为3个亚群,GXYL-1403跟高致病性PRRSV毒株属于同一分支,证实了GXYL-1403株为美洲型PRRSV毒株。
【作者单位】： 广西大学动物科学技术学院动物传染病研究室;
【关键词】： 猪繁殖与呼吸综合征病毒 克隆 序列分析 遗传进化分析
【基金】：国家自然科学基金项目(31372444) 广西大学科研基金项目(XGZ130959)
【分类号】：S852.65
【正文快照】： 猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproduc-tive and respiratory syndrome virus,PRRSV)是猪繁殖与呼吸综合征(Porcine reproductive and re-spiratory syndrome,PRRS)的病原。不同年龄、品种和性别的猪均可感染,以妊娠母猪和1月龄以内的仔猪最易感,主要特征为母猪流产、死胎

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 刘永宏;赵丽;刘俊峰;王凤龙;刘月焕;;从猪繁殖与呼吸综合征病毒的起源与进化谈猪繁殖与呼吸综合征的防制[J];中国兽医杂志;2012年03期

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 程晓峰;;合肥地区蓝耳病血清抗体检测结果与分析[J];当代畜牧;2014年33期

中国博士学位论文全文数据库 前1条

1 唐娜;PRRSV诊断方法的建立及鲁豫冀地区PRRSV的流行与遗传变异研究[D];吉林大学;2013年

【二级参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 郭宝清,陈章水,刘文兴,崔益洙;从疑似PRRS流产胎儿分离PRRSV的研究[J];中国畜禽传染病;1996年02期

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 聂世芳;加州理工学院开发DNA序列分析新方法[J];生物工程进展;1986年03期

2 朴健植;邵洪波;林志武;孔祥福;;分子恴P逞е械腄NA序列分析[J];哈尔滨师范大学自然科学学报;1986年03期

3 吴乃虎;舒幼敏;;DNA序列分析新进展[J];生物学杂志;1989年04期

4 Gillevet PM;钱苏鸣;;化学发光多重DNA序列分析[J];国外医学(分子生物学分册);1991年04期

5 朱国庆,吕宝忠;DNA序列分析中混沌图的应用[J];数理医药学杂志;1994年01期

6 陈中元;;ITS序列分析在药品真菌鉴定与控制中的应用价值[J];当代医药论丛;2014年03期

7 吴阳;李晨阳;李玲玲;焦道忠;李春利;张宁宁;王岁楼;;猪血清白蛋白基因的克隆与序列分析[J];动物医学进展;2007年03期

8 乔军;夏咸柱;杨松涛;鞠会艳;黄耕;;猫白介素-18基因的克隆、序列分析及其表达[J];农业生物技术学报;2007年02期

9 王伟杰;郭豫杰;王月影;乔新安;杨森;王艳玲;杨国宇;;鸡Muslin cDNA克隆与序列分析[J];华北农学报;2007年04期

10 史斌;龙塔;赵战勤;薛云;;16S rRNA序列分析在猪肠道细菌鉴定中的应用[J];河南农业科学;2013年06期

中国重要会议论文全文数据库 前10条

1 黄永仁;周建华;;计算机辅助多肽1H谱归属与序列分析[A];第七届全国波谱学学术会议论文摘要集[C];1992年

2 杨波;张萍;尹崇;李朝飞;王立华;胡晓辉;余健秀;代小江;庞义;;SpltMNPV ORF131基因的序列分析、克隆及功能[A];全国生物防治暨第八届杀虫微生物学术研讨会论文摘要集[C];2000年

3 张志强;杨国宇;李宏基;郭豫杰;鲁维飞;;仔猪多胺代谢相关基因的克隆与序列分析[A];全国动物生理生化第十一次学术交流会论文摘要汇编[C];2010年

4 谢丽华;肖爱欢;兰家暖;张宁;秦毅斌;李茂宁;韦英益;黄伟坚;;猪胞内劳森氏菌16SrRNA基因的克隆及序列分析[A];中国畜牧兽医学会动物传染病学分会第三届猪病防控学术研讨会论文集[C];2008年

5 郑兰兰;崔保安;陈红英;方忠意;陈瑞亮;赵现敏;冯向杰;;河南良杂猪白细胞介素-18全基因的克隆与序列分析[A];中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第六届理事会第二次会议暨教学专业委员会第六届代表大会论文集[C];2006年

6 马辉刚;胡水秀;黄瑞荣;;水稻品种抗病基因类似序列分析[A];2003’华东植物病理学术研讨会暨江苏省植物病理学会第十次会员代表大会论文集[C];2003年

7 李凤华;肖显悦;崔丽;邹鲲鹏;关海峰;杨春清;江庆国;韩书祥;江国托;;猪干扰素β基因的克隆及序列分析[A];中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会成立20周年庆典暨第十次学术研讨会论文集（上）[C];2003年

8 陈国菊;雷建军;曹必好;曾国平;;商陆和美洲商陆基因组PAP基因的克隆及序列分析[A];蔬菜分子育种研讨会论文集[C];2004年

9 郑兰兰;崔保安;方忠意;陈红英;陈瑞亮;冯向杰;;河南良杂猪白细胞介素-15全基因的克隆与序列分析[A];中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第六届理事会第二次会议暨教学专业委员会第六届代表大会论文集[C];2006年

10 段丽娟;李明峰;李凤华;孙宏鑫;庄国宏;张晓宇;邵钢;江国托;;鸡白细胞介素-15的基因克隆、序列分析及其在大肠杆菌中的表达[A];中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第六届理事会第二次会议暨教学专业委员会第六届代表大会论文集[C];2006年

中国重要报纸全文数据库 前1条

1 ;黄种人从亚洲迁徙美洲[N];新华每日电讯;2010年

中国博士学位论文全文数据库 前3条

1 梁国龙;回波信号瞬时参数序列分析及其应用研究[D];哈尔滨工程大学;1997年

2 王建华;猪CD3ε、CD4和CD8α分子的cDNA克隆、序列分析与原核表达[D];中国农业大学;2004年

3 卢秉国;龙眼子叶胚发育相关的若干基因克隆及序列分析[D];福建农林大学;2009年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 张晓东;犬白介素-21基因的扩增、克隆与序列分析[D];吉林农业大学;2006年

2 刘艳梅;甘肃省曲霉菌的RAPD分析和ITS序列分析[D];甘肃农业大学;2006年

3 刘永斌;牛骨形态发生蛋白BMP-4 cDNA的克隆及序列分析[D];内蒙古农业大学;2005年

4 勾利美;冠环属线虫rDNA-ITS序列分析及系统发育研究[D];河南师范大学;2012年

5 刘玉洁;犬细小病毒的分离鉴定及其蛋白基因的序列分析研究[D];山东农业大学;2011年

6 程玉磊;鸡、猪、牛BPI活性部位基因的克隆和序列分析[D];安徽农业大学;2006年

7 郭宏儒;蒙古绵羊Bcl-2/Bax基因cDNA的克隆及序列分析[D];内蒙古农业大学;2008年

8 冯媛;抗体序列结构分析系统的建立与应用[D];第四军医大学;2005年

9 戴秀强;Human Cosavirus套式PCR检测方法的建立及基因组序列分析[D];上海交通大学;2011年

10 陈魁;鲈鱼SNARE基因的克隆与序列分析[D];中国海洋大学;2004年

，

本文编号：679293